SAXS 散射曲线 SAXS Profile
P(r) 距离分布 P(r) Distribution
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条目编号 entry_id 2fr9 沉积日期 deposition_date 2006-01-19 结构标题 title NMR structure of the alpha-conotoxin GI (SER12)-benzoylphenylalanine derivative 关键词 keywords ALPHA-CONOTOXIN GI, BENZOPHENONE ANALOGS, NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR ANTAGONIST, TOXIN; TOXIN 实验方法 method SOLUTION NMR
回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier 6.42 Å 回转半径 Rg (电子) rg_electron 7.17 Å 零角强度 I(0) i0 21247300.00 分子量 molecular_weight 33407.0 kDa 排除体积 excluded_volume 39449 ų 包络体积 envelope_volume 3750 ų 水化壳体积 shell_volume 4323 ų 包络直径 envelope_diameter 26.6 Å 壳层 Rg shell_rg 12.60 Å 包络 Rg envelope_rg 8.92 Å 形状 Rg shape_rg 7.22 Å 总 Rg total_rg 7.26 Å 总原子数 total_atoms 4074 残基数 n_residues 252 球谐函数阶数 n_harmonics 20 q 范围 q_range — – 0.5000 Å−1 数据点数 n_points 101 壳层类型 shell_type directional 溶剂电子密度 solvent_density 0.3340 e/ų 壳层衬度 contrast_shell 0.0300 e/ų CRYSOL 版本 crysol_version 4.1.3
最大尺寸 Dmax dmax 25.0 Å Rg (实空间) rg_real 6.46 Å Rg 误差 (实空间) rg_real_error 0.43 Å I(0) (实空间) i0_real 2.1250e+07 I(0) 误差 (实空间) i0_real_error 2.2820e+05 Rg (倒空间) rg_reciprocal 6.46 Å I(0) (倒空间) i0_reciprocal 21250000.0000 解质量估计 total_estimate 0.8019 解质量评级 solution_quality
GOOD
a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks 2 主峰位置 r_peak_primary 7.9 Å 偏度 Skewness skewness 0.412 峰度 Kurtosis kurtosis -0.092 角度范围 angular_range — – 0.5000 Å−1 当前正则化参数 α current_alpha 0.0000 最高正则化参数 α highest_alpha 1090.0000 实空间数据点数 n_real_points 80 GNOM 版本 gnom_version 4.1.3 质量判据 quality_criteria
AN1: 0.000;
Oscil: 0.658;
Stabil: 0.998;
Sysdev: 1.000;
Positv: 1.000;
Valcen: 0.571;
Smooth: 0.881
晶胞参数 Unit Cell
晶胞边长 a length_a 1.000 Å 晶胞边长 b length_b 1.000 Å 晶胞边长 c length_c 1.000 Å 晶胞夹角 α angle_alpha 90.00 ° 晶胞夹角 β angle_beta 90.00 ° 晶胞夹角 γ angle_gamma 90.00 ° 晶胞分子数 Z z_pdb 1
对称性 Symmetry
空间群 space_group P 1 空间群编号 int_tables_number 1 晶系 crystal_system —
Entity 1
polymer
描述 description Alpha-conotoxin GI 分子量 formula_weight 1608.8 kDa 来源方法 src_method syn 拷贝数 entity_count 1
聚合体 Polymer
聚合体类型 type polypeptide(L) 链编号 strand_id A 原子数 atom_count 4074
ECCNPACGRHYFC
;Alpha-Conotoxin GI benzoylphenylalanine derivatives. (1)H-NMR structures and photoaffinity labeling of the Torpedo californica nicotinic acetylcholine receptor.
;
Febs J. (2006)
Files (7)
pr_distribution /app/data/pr_computation/fr/2fr9/pr_distribution.jsonpr_output /app/data/pr_computation/fr/2fr9/2fr9.pr.outpr_plot /app/data/visualization/pr_computation/fr/2fr9/2fr9_pr_distribution.pngsaxs_curve_dat /app/data/saxs_computation/fr/2fr9/2fr9.datsaxs_fit /app/data/saxs_computation/fr/2fr9/2fr9.fitsaxs_log /app/data/saxs_computation/fr/2fr9/2fr9.logsaxs_plot /app/data/visualization/saxs_computation/fr/2fr9/2fr9_saxs_profile.png
Curves (3)
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