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2ghq

CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1

Homo sapiens

UniProt Q9GZU7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DNA-directed RNA polymerase II largest subunit × 1 （P24928） MAGNESIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DNA-directed RNA polymerase II largest subunit × 1 （P24928） MAGNESIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1t9z 1ta0 3l0b 3l0b 3l0c 3l0c 3l0y 3l0y 3pgl 3pgl

共 10 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ghq 2ghq 2ght 2ght 4ygy 4ygy 4ygy 4ygy 4yh1 4yh1 6du3 6du3

共 12 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CTDS1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–181； UniProt 77–256 作者链 B； PDB构建体 2–181； UniProt 77–256

DNA-directed RNA polymerase II largest subunit

Homo sapiens

UniProt P24928

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1 × 1 （Q9GZU7） MAGNESIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1 × 1 （Q9GZU7） MAGNESIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ghq 2ghq 2ght 2ght 2lto 4jxt 5iy6 5iy7 5iy8 5iy9 5iya 5iyb

共 38 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–9； UniProt 1795–1803 作者链 D； PDB构建体 1–9； UniProt 1795–1803

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ghq
沉积日期 deposition_date2006-03-27
结构标题 titleCTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II
关键词 keywordsprotein-peptide complex, HAD superfamily, Hydrolase; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ghq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ghq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ghq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）17.49 Å
Rg（电子密度）16.23 Å
总 Rg17.23 Å
原子数1506
残基数183
排除体积26746 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ghq__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2ghq__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2ghqa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.16 — NLI interacting factor-like phosphatase
结构域编号 domain_idd2ghqb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.16 — NLI interacting factor-like phosphatase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2ghqA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id2ghqB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
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7. 引用文献 (1)