SAXSdb — 2hfg

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CB3s Fab light chain (kappa)

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 23–236	未记录	CB3s Fab heavy chain × 1 （Q6N093） Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C × 1 （Q96RJ3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Drops contained 2.1 microliters protein solution (pH 6.5) and 2.9 microliters of (0.1M citric acid pH 3.0, 24% PEG 3350, and 0.1 M Praseodymium (III) acetate) over a reservoir of 24% PEG 3350. pH of final drop ~4.5.	分辨率 2.61 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2HFG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2AJ3 Crystal Structure of a Cross-Reactive HIV-1 Neutralizing CD4-Binding Site Antibody Fab m18 提交 2005-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–236（212 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 20% (w/v) PEG-8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.03 Å R-free 0.269
2AJ3 Crystal Structure of a Cross-Reactive HIV-1 Neutralizing CD4-Binding Site Antibody Fab m18 提交 2005-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 25–236（212 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 20% (w/v) PEG-8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.03 Å R-free 0.269
2AJ3 Crystal Structure of a Cross-Reactive HIV-1 Neutralizing CD4-Binding Site Antibody Fab m18 提交 2005-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 25–236（212 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 20% (w/v) PEG-8000, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.03 Å R-free 0.269

共 1 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6PIH7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–214； UniProt 23–236

CB3s Fab heavy chain

Homo sapiens

UniProt Q6N093

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–194	未记录	CB3s Fab light chain (kappa) × 1 （Q6PIH7） Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C × 1 （Q96RJ3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Drops contained 2.1 microliters protein solution (pH 6.5) and 2.9 microliters of (0.1M citric acid pH 3.0, 24% PEG 3350, and 0.1 M Praseodymium (III) acetate) over a reservoir of 24% PEG 3350. pH of final drop ~4.5.	分辨率 2.61 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2HFG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9N5P CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IGG2 FC FRAGMENT-FC-GAMMA RECEPTOR IIA COMPLEX H131 VARIANT 提交 2025-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 195–417（223 aa）链 B 195–417（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 2000 MME	分辨率 2.01 Å R-free 0.232

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6N093_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 29–228； UniProt 1–194

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C

Homo sapiens

UniProt Q96RJ3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 7–54	片段：cysteine rich domain (residues 7-54) 突变：V20N, L27P	CB3s Fab light chain (kappa) × 1 （Q6PIH7） CB3s Fab heavy chain × 1 （Q6N093）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Drops contained 2.1 microliters protein solution (pH 6.5) and 2.9 microliters of (0.1M citric acid pH 3.0, 24% PEG 3350, and 0.1 M Praseodymium (III) acetate) over a reservoir of 24% PEG 3350. pH of final drop ~4.5.	分辨率 2.61 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2HFG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MPV Structure of bhpBR3, the BAFF-binding loop of BR3 embedded in a beta-hairpin peptide 提交 2002-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–31（6 aa）片段：BR3 loop (residues 26-31)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）no added salt；压力 ambient NMR样品组成 2.9 mM bhpBR3 peptide \| 92% H2O, 8% D2O, 0.1 mM DSS, pH 4.5 NMR样品组成 2.9 mM bhpBR3 peptide \| 100% D2O, 0.1 mM DSS, pH 4.5	分辨率未提供
1OQE Crystal structure of sTALL-1 with BAFF-R 提交 2003-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：108-meric	链 K 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 L 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 M 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 N 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 O 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 P 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 Q 16–46（31 aa）片段：extracellular domain 链 R 16–46（31 aa）片段：extracellular domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；dioxane, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K	分辨率 2.50 Å R-free 0.259
1OSX Solution Structure of the Extracellular Domain of BLyS Receptor 3 (BR3) 提交 2003-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–61（61 aa）片段：extracellular domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl, 25 mM Na2PO4；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM BR3 U-15N,25 mM Na2PO4, 50 mM NaCl, 0.1 mM NaN3, 0.1 mM DSS-d10 \| 92%H2O/8%D2O NMR样品组成 1.5 mM BR3 U-15N,13C,25 mM Na2PO4, 50 mM NaCl, 0.1 mM NaN3, 0.1 mM DSS-d10 \| 92%H2O/8%D2O NMR样品组成 1.5 mM BR3 U-15N,13C,25 mM Na2PO4, 50 mM NaCl, 0.1 mM NaN3, 0.1 mM DSS-d10 \| 100% D2O	分辨率未提供
4V46 Crystal structure of the BAFF-BAFF-R complex 提交 2003-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric	链 B0 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B1 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B2 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B3 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B4 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B5 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B6 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B7 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B8 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 B9 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BA 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BB 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BC 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BD 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BE 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BF 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BG 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BH 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BI 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BJ 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BK 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BL 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BM 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BN 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BO 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BP 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BQ 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BR 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BS 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BT 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BU 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BV 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BW 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BX 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BY 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 BZ 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Ba 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bb 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bc 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bd 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Be 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bf 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bg 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bh 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bi 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bj 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bk 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bl 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bm 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bn 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bo 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bp 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bq 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Br 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bs 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bt 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bu 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bv 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bw 1–63（63 aa）片段：residues 1-63 链 Bx 1–63（63 aa）片段：residues 1-63	未记录	MG MAGNESIUM ION × 40	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium formate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.226
8ZUJ Pentagonal cluster of BAFF-BAFFR ectodomain complex 提交 2024-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 A 2–78（77 aa）链 B 2–78（77 aa）链 C 2–78（77 aa）链 G 2–78（77 aa）链 H 2–78（77 aa）链 I 2–78（77 aa）链 M 2–78（77 aa）链 N 2–78（77 aa）链 O 2–78（77 aa）链 S 2–78（77 aa）链 T 2–78（77 aa）链 U 2–78（77 aa）链 Y 2–78（77 aa）链 Z 2–78（77 aa）链 a 2–78（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
8ZUK Cluster structure of the BAFF-BAFFR-TRAF3 complex 提交 2024-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 D 1–184（184 aa）链 E 1–184（184 aa）链 F 1–184（184 aa）链 J 1–184（184 aa）链 K 1–184（184 aa）链 L 1–184（184 aa）链 P 1–184（184 aa）链 Q 1–184（184 aa）链 R 1–184（184 aa）链 V 1–184（184 aa）链 W 1–184（184 aa）链 X 1–184（184 aa）链 b 1–184（184 aa）链 c 1–184（184 aa）链 d 1–184（184 aa）链 h 1–184（184 aa）链 i 1–184（184 aa）链 j 1–184（184 aa）链 n 1–184（184 aa）链 o 1–184（184 aa）链 p 1–184（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TR13C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 4–51； UniProt 7–54

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hfg
沉积日期 deposition_date	2006-06-23
结构标题 title	Crystal structure of hBR3 bound to CB3s-Fab
关键词 keywords	fab fragment, TNFRSF, antibody-receptor complex, CRD, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.91 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.10 Å
零角强度 I(0) i0	41109200.00
分子量 molecular_weight	49044.0 kDa
排除体积 excluded_volume	61093 Å³
包络体积 envelope_volume	76368 Å³
水化壳体积 shell_volume	25792 Å³
包络直径 envelope_diameter	90.0 Å
壳层 Rg shell_rg	31.91 Å
包络 Rg envelope_rg	25.02 Å
形状 Rg shape_rg	25.07 Å
总 Rg total_rg	25.96 Å
总原子数 total_atoms	3448
残基数 n_residues	447
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	87.1 Å
Rg (实空间) rg_real	25.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1110e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.5700e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.93 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	41110000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8896
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.358
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.370
角度范围 angular_range	— – 0.3050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7326000.0000
实空间数据点数 n_real_points	62
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.874; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.957; Smooth: 0.982

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CB3s Fab light chain (kappa)
分子量 formula_weight	23250.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	3475

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSQISPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CB3s Fab heavy chain
分子量 formula_weight	24414.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTISSSSIHWVRQAPGKGLEWVAWVLPSVGFTDYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRVCYNRLGVCAGGMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C
分子量 formula_weight	5323.1 kDa
突变 mutation	V20N, L27P
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

GSYSLRGRDAPAPTPCNPAECFDPLVRHCVACGLLRTPRPKPAGASSPAPR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	27

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d2hfgh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d2hfgh2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d2hfgl1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2hfgl2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d2hfgr_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.24 — TNF receptor-like
超家族 Superfamily superfamily	g.24.1 — TNF receptor-like
家族 Family family	g.24.1.2 — BAFF receptor-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2hfgH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2hfgH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2hfgL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	2hfgL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	146.408 Å
晶胞边长 b length_b	146.408 Å
晶胞边长 c length_c	146.408 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	I 21 3
空间群编号 int_tables_number	199
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.610 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2005
R_work r_work	0.1946
R_free r_free	0.2525

fit	/app/data/saxs_computation/hf/2hfg/2hfg.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hf/2hfg/2hfg.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hf/2hfg/2hfg.dat

Crystal structure of hBR3 bound to CB3s-Fab

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CB3s Fab light chain (kappa)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CB3s Fab heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)