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2hj8

Solution NMR structure of the C-terminal domain of the interferon alpha-inducible ISG15 protein from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics target HR2873B

Method: SOLUTION NMR Dmax: 40.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interferon-induced 17 kDa protein

Homo sapiens

UniProt P05161

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 78–156 片段：ISG15 C-terminal domain (8.9 kDa), Ubiquitin-like 2 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2；压力 ambient NMR样品组成：0.81 mM U-13C,15N HR2873B, 50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2, 1x protease inhibitor, 0.02% NaN3, pH 6.5, 5% D2O / 95% H2O | 5% D2O / 95% H2O NMR样品组成：0.9 mM 5%-13C,U-15N HR2873B, 50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2, 1x protease inhibitor, 0.02% NaN3, pH 6.5, 5% D2O / 95% H2O | 5% D2O / 95% H2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2HJ8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1Z2M Crystal Structure of ISG15, the Interferon-Induced Ubiquitin Cross Reactive Protein 提交 2005-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 0–154（155 aa）
突变：c78s OS4 OSMIUM 4+ ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；Tris-HCl buffer, PEG4K, MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.50 Å R-free 0.223
3PHX OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with ISG15 提交 2010-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 79–156（78 aa） 片段：UNP residues 79-156
未记录 ZN ZINC ION × 12 ACY ACETIC ACID × 2 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG8K, 0.2M zinc acetate, 0.1M MES sodium salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.192
3PHX OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with ISG15 提交 2010-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 79–156（78 aa） 片段：UNP residues 79-156
未记录 ZN ZINC ION × 12 ACY ACETIC ACID × 2 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG8K, 0.2M zinc acetate, 0.1M MES sodium salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.192
3PSE Structure of a viral OTU domain protease bound to interferon-stimulated gene 15 (ISG15) 提交 2010-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–156（156 aa）
突变：C78S 4LJ 1.7.6 3-bromanylpropan-1-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM MES, 23% PEG6000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.224
3R66 Crystal structure of human ISG15 in complex with NS1 N-terminal region from influenza virus B, Northeast Structural Genomics Consortium Target IDs HX6481, HR2873, and OR2 提交 2011-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–157（157 aa）
链 D 1–157（157 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG3350, 1% dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
3RT3 Complex of influenza virus protein with host anti-viral factor 提交 2011-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–158（158 aa）
突变：C78S SIN SUCCINIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.01 Å R-free 0.243
3SDL Crystal structure of human ISG15 in complex with NS1 N-terminal region from influenza B virus, Northeast Structural Genomics Consortium Target IDs HX6481, HR2873, and OR2 提交 2011-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–157（157 aa）
链 D 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；15% PEG3350, 1% dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, EVAPORATION
分辨率 2.29 Å R-free 0.261
5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 80–157（78 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 80-157)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution
分辨率 2.62 Å R-free 0.250
5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 80–157（78 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 80-157)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution
分辨率 2.62 Å R-free 0.250
5W8T Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 80–156（77 aa）
未记录 AYE prop-2-en-1-amine × 1 ZN ZINC ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD
分辨率 2.76 Å R-free 0.224
5W8T Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 80–156（77 aa）
未记录 AYE prop-2-en-1-amine × 1 ZN ZINC ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD
分辨率 2.76 Å R-free 0.224
5W8U Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 80–156（77 aa） 片段：UNP residues 80-156
未记录 ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD
分辨率 2.41 Å R-free 0.237
5W8U Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 80–156（77 aa） 片段：UNP residues 80-156
未记录 ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD
分辨率 2.41 Å R-free 0.237
6BI8 X-ray structure of MERS coronavirus papain-like protease in complex with human ISG15 提交 2017-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–156（156 aa）
突变：C78S PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；0.25 M Potassium Citrate, pH 8.3 20% PEG3350
分辨率 2.29 Å R-free 0.215
6BI8 X-ray structure of MERS coronavirus papain-like protease in complex with human ISG15 提交 2017-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–156（156 aa）
突变：C78S PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；0.25 M Potassium Citrate, pH 8.3 20% PEG3350
分辨率 2.29 Å R-free 0.215
6FFA FMDV Leader protease bound to substrate ISG15 提交 2018-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 79–155（77 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2 M Ammonium Sulfate 0.2 M Sodium potassium tartrate tetrahydrate 0.1 M Sodium citrate tribasic (pH 5.6)
分辨率 1.50 Å R-free 0.186
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 79–157（79 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)
突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 79–157（79 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)
突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 79–157（79 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)
突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–157（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100
分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–157（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100
分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–157（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100
分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 2–157（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100
分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2–157（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100
分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
7S6P The crystal structure of human ISG15 提交 2021-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.268
8OIF Structure of the UBE1L activating enzyme bound to ISG15 and UBE2L6 提交 2023-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–157（157 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8SE9 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 2) 提交 2023-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–157（157 aa）
链 D 1–157（157 aa）
突变：C78S 突变：C78S AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SEA Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 1) 提交 2023-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–157（157 aa）
链 D 1–157（157 aa）
突变：C78S 突变：C78S AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8SEB Cryo-EM structure of a single loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 adenylate complex 提交 2023-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–157（157 aa）
突变：C78S AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8SV8 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex from a composite map 提交 2023-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–157（157 aa）
链 D 1–157（157 aa）
突变：C78S 突变：C78S AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–157（157 aa） 片段：residues 1-157
突变：C78S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–157（157 aa） 片段：residues 1-157
突变：C78S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–157（157 aa） 片段：residues 1-157
突变：C78S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9ZFO Cryo-EM Structure of Human STAT2-USP18-ISG15 Complex 提交 2025-12-01 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM HEPES (pH 8.0), 200mM NaCl and 1.0mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å

共 21 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCRP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–80； UniProt 78–156

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2hj8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2hj8
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2hj8
沉积日期 deposition_date2006-06-30
结构标题 titleSolution NMR structure of the C-terminal domain of the interferon alpha-inducible ISG15 protein from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics target HR2873B
关键词 keywordsHR2873B, human ISG15, Northeast Structural Genomics Consortium, Protein Structure Initiative, NESG, PSI-1, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier12.00 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron11.80 Å
零角强度 I(0) i0384441000.00
分子量 molecular_weight169970.0 kDa
排除体积 excluded_volume214540 ų
包络体积 envelope_volume19546 ų
水化壳体积 shell_volume12172 ų
包络直径 envelope_diameter47.1 Å
壳层 Rg shell_rg19.51 Å
包络 Rg envelope_rg13.90 Å
形状 Rg shape_rg11.76 Å
总 Rg total_rg12.09 Å
总原子数 total_atoms24100
残基数 n_residues1500
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax40.5 Å
Rg (实空间) rg_real11.91 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real3.8440e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.3210e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal11.91 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal384400000.0000
解质量估计 total_estimate0.7549
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary16.4 Å
偏度 Skewness skewness0.047
峰度 Kurtosis kurtosis-0.132
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha116900.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.604; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2hj8a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2hj8A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)