2hr2

Crystal structure of a tpr-like protein (ct2138) from chlorobium tepidum tls at 2.54 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein

Chlorobium tepidum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 4 CHLORIDE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 2 CHLORIDE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
6	蛋白单体	单体	蛋白 1	GLYCEROL × 4 CHLORIDE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
7	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 6	GLYCEROL × 13 CHLORIDE ION × 3 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8KAL8_CHLTE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158 作者链 B； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158 作者链 C； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158 作者链 D； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158 作者链 E； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158 作者链 F； PDB构建体 2–159； UniProt 1–158

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hr2
沉积日期 deposition_date	2006-07-19
结构标题 title	Crystal structure of a tpr-like protein (ct2138) from chlorobium tepidum tls at 2.54 A resolution
关键词 keywords	;Alpha-alpha superhelix fold, structural genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Protein Structure Initiative, PSI-2, unknown function ;; UNKNOWN FUNCTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hr2__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hr2__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hr2__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.92 Å
Rg（电子密度）	16.14 Å
总 Rg	17.31 Å
原子数	1209
残基数	150
排除体积	21482 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2hr2__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2hr2__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2hr2__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2hr2__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`2hr2__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`2hr2__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`2hr2__assembly_7__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hypothetical protein
分子量 formula_weight	17762.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	7235

GMKPLKEVVGAYLALSDAQRQLVAGEYDEAAANCRRAMEISHTMPPEEAFDHAGFDAFCHAGLAEALAGLRSFDEALHSADKALHYFNRRGELNQDEGKLWISAVYSRALALDGLGRGAEAMPEFKKVVEMIEERKGETPGKERMMEVAIDRIAQLGAS

来源 Source

来源生物 organism	Chlorobium tepidum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	194439
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	88

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2hr2a1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

结构域编号 domain_id	d2hr2b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

结构域编号 domain_id	d2hr2c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

结构域编号 domain_id	d2hr2d_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

结构域编号 domain_id	d2hr2e_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

结构域编号 domain_id	d2hr2f_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.8 — TPR-like
家族 Family family	a.118.8.8 — CT2138-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2hr2A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	2hr2B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	2hr2C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	2hr2D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	2hr2E00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

结构域编号 domain_id	2hr2F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

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晶胞边长 a length_a	89.090 Å
晶胞边长 b length_b	91.280 Å
晶胞边长 c length_c	176.170 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.540 Å
最低分辨率 resolution_low	29.696 Å
R 因子 r_factor	0.2050
R_work r_work	0.2040
R_free r_free	0.2320

Crystal structure of a tpr-like protein (ct2138) from chlorobium tepidum tls at 2.54 A resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hr2__assembly_3__model_1

2hr2__assembly_3__model_1 | I(q)

2hr2__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a tpr-like protein (ct2138) from chlorobium tepidum tls at 2.54 A resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypothetical protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hr2__assembly_3__model_1

2hr2__assembly_3__model_1 | I(q)

2hr2__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)