SAXSdb — 2ihs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CG2944-PF, isoform F

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa × 1 （P09052） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa × 1 （P09052） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7KRQ1_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–209； UniProt 29–234 作者链 B； PDB构建体 4–209； UniProt 29–234

20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa

Drosophila melanogaster

UniProt P09052

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CG2944-PF, isoform F × 1 （Q7KRQ1） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CG2944-PF, isoform F × 1 （Q7KRQ1） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VASA_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–20； UniProt 184–203 作者链 D； PDB构建体 1–20； UniProt 184–203

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2ihs
沉积日期 deposition_date	2006-09-27
结构标题 title	Crystal structure of the B30.2/SPRY domain of GUSTAVUS in complex with a 20-residue VASA peptide
关键词 keywords	B30.2/SPRY, GUSTAVUS, VASA, SPRY-containing SOCS box, F-box-SPRY, TRIM family, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ihs__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ihs__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ihs__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.54 Å
Rg（电子密度）	16.50 Å
总 Rg	17.62 Å
原子数	1721
残基数	215
排除体积	30612 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2ihs__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2ihs__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CG2944-PF, isoform F
分子量 formula_weight	24180.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3600

GHMRELQADFVKPARIDILLDMPPASRDLQLKHSWNSEDRSLNIFVKEDDKLTFHRHPVAQSTDCIRGKVGLTKGLHIWEIYWPTRQRGTHAVVGVCTADAPLHSVGYQSLVGSTEQSWGWDLGRNKLYHDSKNCAGVTYPAILKNDEAFLVPDKFLVALDMDEGTLSFIVDQQYLGIAFRGLRGKKLYPIVSAVWGHCEITMRYIGGLVDELN

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa
分子量 formula_weight	2497.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

DINNNNNIVEDVERKREFYI

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	142

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d2ihsa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.22 — SPRY domain

结构域编号 domain_id	d2ihsa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2ihsb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.22 — SPRY domain

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晶胞边长 a length_a	80.209 Å
晶胞边长 b length_b	80.209 Å
晶胞边长 c length_c	159.798 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2190
R_free r_free	0.2600

Crystal structure of the B30.2/SPRY domain of GUSTAVUS in complex with a 20-residue VASA peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CG2944-PF, isoform F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2ihs__assembly_2__model_1

2ihs__assembly_2__model_1 | I(q)

2ihs__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the B30.2/SPRY domain of GUSTAVUS in complex with a 20-residue VASA peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CG2944-PF, isoform F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

20-mer from ATP-dependent RNA helicase vasa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2ihs__assembly_2__model_1

2ihs__assembly_2__model_1 | I(q)

2ihs__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

7. 引用文献 (1)