Protein AfaD
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Afimbrial adhesin AFA-III × 1 （Q57254） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | AFAD_ECOLX |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 |
2ixq
The solution structure of the invasive tip complex from Afa-Dr fibrils
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
Afimbrial adhesin AFA-III
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein AfaD × 1 （Q47038） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | AFAE3_ECOLX |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–123； UniProt 38–160 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2ixq |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-07-10 |
| 结构标题 title | The solution structure of the invasive tip complex from Afa-Dr fibrils |
| 关键词 keywords | IG-LIKE DOMAIN, AFIMBRIAL SHEATH, STRUCTURAL PROTEIN, DONOR STRAND COMPLEMENTED, CELL ADHESION, DAF, AFAE, UPEC, DAEC, FIMBRIA; CELL ADHESION |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2ixq__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2ixq__assembly_1__model_1 | I(q)
2ixq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 28.32 Å |
| Rg（电子密度） | 28.64 Å |
| 总 Rg | 28.92 Å |
| 原子数 | 4179 |
| 残基数 | 285 |
| 排除体积 | 37691 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains
SCOP 2.08 (4 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2ixqa1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.2.3 — Bacterial adhesins |
| 家族 Family family | b.2.3.2 — Pilus subunits |
| 结构域编号 domain_id | d2ixqa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2ixqb1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.2.3 — Bacterial adhesins |
| 家族 Family family | b.2.3.6 — Dr-family adhesin |
| 结构域编号 domain_id | d2ixqb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2ixqA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1570 — Dr adhesin |
| 结构域编号 domain_id | 2ixqB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1570 — Dr adhesin |