SAXSdb — 2iy3

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

Sulfolobus solfataricus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	4.5S RNA × 1 SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0E3MG81_SULSF
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 297–432； UniProt 297–432

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

Sulfolobus solfataricus

UniProt O07347

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	4.5S RNA × 1 SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP54_THEAQ
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–296； UniProt 1–296

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2iy3
沉积日期 deposition_date	2006-07-12
结构标题 title	Structure of the E. Coli Signal Regognition Particle
关键词 keywords	RNA-BINDING, RNA-BINDING PROTEIN COMPLEX, SIGNAL RECOGNITION PARTICLE; RNA-BINDING
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2iy3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2iy3__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2iy3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.03 Å
Rg（电子密度）	35.72 Å
总 Rg	35.47 Å
原子数	110
残基数	110
排除体积	62178 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2iy3__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein
分子量 formula_weight	48274.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	559

MFQQLSARLQEAIGRLRGRGRITEEDLKATLREIRRALMDADVNLEVARDFVERVREEALGKQVLESLTPAEVILATVYEALKEALGGEARLPVLKDRNLWFLVGLQGSGKTTTAAKLALYYKGKGRRPLLVAADTQRPAAREQLRLLGEKVGVPVLEVMDGESPESIRRRVEEKARLEARDLILVDTAGRLQIDEPLMGELARLKEVLGPDEVLLVLDAMTGQEALSVARAFDEKVGVTGLVLTKLDGDARGGAALSARHVTGKPIYFAGVSEKPEGLEPFYPERLAGRILGMGDIESILEKVKGLEEYDKIQKKMEDVMEGKGKLTLRDVYAQIIALRKMGPLSKVLQHIPGLGIMLPTPSEDQLKIGEEKIRRWLAALNSMTYKELENPNIIDKSRMRRIAEGSGLEVEEVRELLEWYNNMNRLLKMVK

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus solfataricus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	4.5S RNA
分子量 formula_weight	35547.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	B

GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUACUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAUGACGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCAGGGCCCCC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SIGNAL SEQUENCE
分子量 formula_weight	1380.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AALALAAAAALALAAAG

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2iy3a1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.13 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins
家族 Family family	a.24.13.1 — Domain of the SRP/SRP receptor G-proteins

结构域编号 domain_id	d2iy3a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.10 — Nitrogenase iron protein-like

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	16.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	16.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	PROJECTION MATCHING
颗粒数 num_particles	24382

Structure of the E. Coli Signal Regognition Particle

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2iy3__assembly_1__model_1

2iy3__assembly_1__model_1 | I(q)

2iy3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the E. Coli Signal Regognition Particle

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Signal recognition particle protein,Signal recognition particle 54 kDa protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2iy3__assembly_1__model_1

2iy3__assembly_1__model_1 | I(q)

2iy3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)