SAXSdb — 2j0m

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FOCAL ADHESION KINASE 1

GALLUS GALLUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	1,2,3,4-TETRAHYDROGEN-STAUROSPORINE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FAK1_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–371； UniProt 31–399 作者链 B； PDB构建体 1–276； UniProt 411–686

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2j0m
沉积日期 deposition_date	2006-08-03
结构标题 title	Crystal structure a two-chain complex between the FERM and kinase domains of focal adhesion kinase.
关键词 keywords	;FOCAL ADHESION, CELL MIGRATION, PHOSPHORYLATION, FERM, KINASE, TRANSFERASE, ATP-BINDING, INTEGRIN SIGNALING, NUCLEOTIDE-BINDING, TYROSINE-PROTEIN KINASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2j0m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2j0m__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2j0m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.66 Å
Rg（电子密度）	30.15 Å
总 Rg	30.83 Å
原子数	4755
残基数	586
排除体积	85117 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2j0m__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FOCAL ADHESION KINASE 1
分子量 formula_weight	42444.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4808

GSGAMERVLKVFHYFENSSEPTTWASIIRHGDATDVRGIIQKIVDCHKVKNVACYGLRLSHLQSEEVHWLHLDMGVSNVREKFELAHPPEEWKYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKNDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRSYGEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLRRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESILKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGANPTHLADFNQVQTIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGATQSFIIRPQKEGERALPSIPKLANNEKQGVRSHTVSVSETDDYAE

来源 Source

来源生物 organism	GALLUS GALLUS
通用名 common_name	CHICKEN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FOCAL ADHESION KINASE 1
分子量 formula_weight	31758.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

STRDYEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ

来源 Source

来源生物 organism	GALLUS GALLUS
通用名 common_name	CHICKEN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2,3,4-TETRAHYDROGEN-STAUROSPORINE
分子量 formula_weight	470.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	53

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2j0ma1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family family	a.11.2.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j0ma2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.55.1 — PH domain-like
家族 Family family	b.55.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j0ma3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2j0mb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	2j0mA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	2j0mA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2j0mA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	2j0mB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	2j0mB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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晶胞边长 a length_a	67.490 Å
晶胞边长 b length_b	90.600 Å
晶胞边长 c length_c	242.610 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	27.390 Å
R 因子 r_factor	0.2240
R_work r_work	0.2210
R_free r_free	0.2820

Crystal structure a two-chain complex between the FERM and kinase domains of focal adhesion kinase.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FOCAL ADHESION KINASE 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2j0m__assembly_1__model_1

2j0m__assembly_1__model_1 | I(q)

2j0m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure a two-chain complex between the FERM and kinase domains of focal adhesion kinase.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FOCAL ADHESION KINASE 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2j0m__assembly_1__model_1

2j0m__assembly_1__model_1 | I(q)

2j0m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)