2jxm

Ensemble of twenty structures of the Prochlorothrix hollandica plastocyanin- cytochrome f complex

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Plastocyanin

Prochlorothrix hollandica

UniProt P50057

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Cytochrome f × 1 (Q8RN59) COPPER (II) ION × 1 HEME C × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PLAS_PROHO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–97; UniProt 35–131

Cytochrome f

Prochlorothrix hollandica

UniProt Q8RN59

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Plastocyanin × 1 (P50057) COPPER (II) ION × 1 HEME C × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8RN59_PROHO
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–249; UniProt 47–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2jxm
沉积日期 deposition_date2007-11-22
结构标题 titleEnsemble of twenty structures of the Prochlorothrix hollandica plastocyanin- cytochrome f complex
关键词 keywordsCopper, Electron transport, Metal-binding, Transport; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2jxm__assembly_1__model_12

Assembly 1 · Model 12 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2jxm__assembly_1__model_12 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2jxm__assembly_1__model_12 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.30 Å
Rg(电子密度)23.66 Å
总 Rg24.37 Å
原子数5179
残基数346
排除体积46940 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2jxm__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2jxm__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2jxm__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2jxm__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2jxm__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2jxm__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2jxm__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2jxm__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2jxm__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2jxm__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2jxm__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2jxm__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2jxm__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2jxm__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2jxm__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2jxm__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2jxm__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2jxm__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2jxm__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2jxm__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2jxma_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.6.1 — Cupredoxins
家族 Family familyb.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like
结构域编号 domain_idd2jxmb1
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.4 — Electron transport chains
超家族 Superfamily superfamilyi.4.1 — Electron transport chains
家族 Family familyi.4.1.1 — Electron transport chains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2jxmA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Cupredoxins - blue copper proteins
结构域编号 domain_id2jxmB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily830 — Cytochrome f large domain
结构域编号 domain_id2jxmB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
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7. 引用文献 (1)