SAXSdb — 2l65

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CalC

Micromonospora echinospora

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	2,4-dideoxy-4-(ethylamino)-3-O-methyl-alpha-L-threo-pentopyranose-(1-2)-4-amino-4,6-dideoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2,6-dideoxy-4-thio-beta-D-allopyranose × 1 4-HYDROXY-5-IODO-2,3-DIMETHOXY-6-METHYLBENZOIC ACID × 1 3-O-methyl-alpha-L-rhamnopyranose × 1 [1,8-DIHYDROXY-11-OXO-13-(2-METHYLTRITHIO-ETHYLIDENE)-BICYCLO[7.3.1]TRIDECA-4,9-DIENE-2,6-DIYN-10-YL]-CARBAMIC ACID METHYL ESTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8KNF0_MICEC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–155； UniProt 27–181

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2l65
沉积日期 deposition_date	2010-11-15
结构标题 title	HADDOCK calculated model of the complex of the resistance protein CalC and Calicheamicin-Gamma
关键词 keywords	;Resistance Protein, Structural Genomics, PSI-1, Protein Structure Initiative, Center for Eukaryotic Structural Genomics, CESG, Unknown function ;; Structural genomics, Unknown function
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2l65__assembly_1__model_3

Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2l65__assembly_1__model_3 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2l65__assembly_1__model_3 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.94 Å
Rg（电子密度）	16.74 Å
总 Rg	17.99 Å
原子数	1658
残基数	155
排除体积	23893 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2l65__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2l65__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2l65__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2l65__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CalC
分子量 formula_weight	17915.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6632

NYDPFVRHSVTVKADRKTAFKTFLEGFPEWWPNNFRTTKVGAPLGVDKKGGRWYEIDEQGEEHTFGLIRKVDEPDTLVIGWRLNGFGRIDPDNSSEFTVTFVADGQKKTRVDVEHTHFDRMGTKHAKRVRNGMDKGWPTILQSFQDKIDEEGAKK

来源 Source

来源生物 organism	Micromonospora echinospora
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1877
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	2,4-dideoxy-4-(ethylamino)-3-O-methyl-alpha-L-threo-pentopyranose-(1-2)-4-amino-4,6-dideoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	320.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2,6-dideoxy-4-thio-beta-D-allopyranose
分子量 formula_weight	164.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	4-HYDROXY-5-IODO-2,3-DIMETHOXY-6-METHYLBENZOIC ACID
分子量 formula_weight	338.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	3-O-methyl-alpha-L-rhamnopyranose
分子量 formula_weight	178.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	[1,8-DIHYDROXY-11-OXO-13-(2-METHYLTRITHIO-ETHYLIDENE)-BICYCLO[7.3.1]TRIDECA-4,9-DIENE-2,6-DIYN-10-YL]-CARBAMIC ACID METHYL ESTER
分子量 formula_weight	407.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2l65a1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.129.3 — Bet v1-like
家族 Family family	d.129.3.5 — AHSA1 domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2l65A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	530 — Alpha-D-Glucose-1,6-Bisphosphate; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — START domain

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HADDOCK calculated model of the complex of the resistance protein CalC and Calicheamicin-Gamma