2la1

Expression in Pichia pastoris and backbone dynamics of dendroaspin, a three finger toxin

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mambin

Dendroaspis jamesoni kaimosae

UniProt P28375

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MAMB_DENJA
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–59; UniProt 1–59

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2la1
沉积日期 deposition_date2011-03-01
结构标题 titleExpression in Pichia pastoris and backbone dynamics of dendroaspin, a three finger toxin
关键词 keywordsdendroaspin, disintegrin, integrin, three-finger fold, snake toxin, TOXIN; TOXIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2la1__assembly_1__model_19

Assembly 1 · Model 19 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2la1__assembly_1__model_19 | I(q)

10-2 10-1 104 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2la1__assembly_1__model_19 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)11.72 Å
Rg(电子密度)10.78 Å
总 Rg12.11 Å
原子数897
残基数59
排除体积8163 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2la1__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2la1__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2la1__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2la1__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2la1__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2la1__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2la1__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2la1__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2la1__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2la1__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2la1__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2la1__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2la1__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2la1__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2la1__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2la1__assembly_1__model_16 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2la1__assembly_1__model_17 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2la1__assembly_1__model_18 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2la1__assembly_1__model_19 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2la1__assembly_1__model_20 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2la1A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59

7. 引用文献 (1)