Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–150 | 片段：N-terminal domain | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.5；298 K；压力 ambient NMR样品组成：1.164 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HR5460A, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1.033 mM [U-10% 13C; U-100% 15N] HR5460A, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2LAH | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–150（150 aa）
片段：TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–150（150 aa）
片段：TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
1–150（150 aa）
片段：TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
1–150（150 aa）
片段：TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.244 |
| 4QPM Structure of Bub1 kinase domain 提交 2014-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
749–1094（346 aa）
片段：UNP residues 749-1094
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；293 K；20% PEG3350, 1% Tryptone, 10 mM DTT, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 4QPM Structure of Bub1 kinase domain 提交 2014-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
749–1094（346 aa）
片段：UNP residues 749-1094
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；293 K；20% PEG3350, 1% Tryptone, 10 mM DTT, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 4R8Q Structure and substrate recruitment of the human spindle checkpoint kinase bub1 提交 2014-09-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
724–1085（362 aa）
片段：Kinase domain, unp residues 724-1085
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.29；293 K；TO 15 MG/ML BUB1, ATP WAS ADDED TO A FINAL CONCENTRATION OF 10 MM. SITTING DROPS WERE MADE BY MIXING 1.5 MICROLITERS PROTEIN WITH 1.5 MICROLITERS CRYSTALLIZATION SOLUTION (20% W/V PEG 3350, 0.1 M SODIUM FORMATE PH 6.29, 25 MM DTT) AND EQUILIBRATING AGAINST 200 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. LARGE SINGLE CRYSTALS WERE OBTAINED BY REPEATED SEEDING. THE CRYSTALS WERE CRYO-PROTECTED IN RESERVOIR SOLUTION SUPPLEMENTED WITH 18% V/V GLYCEROL AND THEN FLASH-COOLED IN LIQUID PROPANE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K, vapor diffusion, sitting drop
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.264 |
| 5DMZ Structure of human Bub1 kinase domain phosphorylated at Ser969 提交 2015-09-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
726–1085（360 aa）
片段：UNP residues 726-1085
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；0.2 M NaCl, 15% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 5DMZ Structure of human Bub1 kinase domain phosphorylated at Ser969 提交 2015-09-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
726–1085（360 aa）
片段：UNP residues 726-1085
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；0.2 M NaCl, 15% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 6F7B Crystal structure of the human Bub1 kinase domain in complex with BAY 1816032 提交 2017-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
726–1085（360 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CVQ 2-[3,5-bis(fluoranyl)-4-[[3-[5-methoxy-4-[(3-methoxypyridin-4-yl)amino]pyrimidin-2-yl]indazol-1-yl]methyl]phenoxy]ethanol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.26；277 K；200mM MgCl2, 100mM Tris-HCl pH 7.26, 5% glycerol, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 7B1F Orthorhombic P212121 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
455–479（25 aa）
链 D
455–479（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 4000, 0.1 M Hepes pH 7.5, 10% isopropanol
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.287 |
| 7B1H Monoclinic P21 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
455–479（25 aa）
链 D
455–479（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；8% Isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 7B1H Monoclinic P21 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 G
455–479（25 aa）
链 H
455–479（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；8% Isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 7B1J Orthorhombic P21212 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
455–479（25 aa）
链 D
455–479（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% Isopropanol, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.296 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | BUB1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 11–160； UniProt 1–150 |
