2leg

Membrane protein complex DsbB-DsbA structure by joint calculations with solid-state NMR and X-ray experimental data

Method: SOLID-STATE NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thiol:disulfide interchange protein DsbA

Escherichia coli

UniProt P0AEG4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Disulfide bond formation protein B × 1 (P0A6M2) ZINC ION × 1 UBIQUINONE-1 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DSBA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–189; UniProt 20–208

Disulfide bond formation protein B

Escherichia coli

UniProt P0A6M2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Thiol:disulfide interchange protein DsbA × 1 (P0AEG4) ZINC ION × 1 UBIQUINONE-1 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DSBB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–176; UniProt 1–176

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2leg
沉积日期 deposition_date2011-06-15
结构标题 titleMembrane protein complex DsbB-DsbA structure by joint calculations with solid-state NMR and X-ray experimental data
关键词 keywords;Disulfide bond, membrane protein, redox-active center, cell inner membrane, cell membrane, chaperone, electron transport, membrane, oxidoreductase, transmembrane, transport ;; MEMBRANE PROTEIN, OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodSOLID-STATE NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2leg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2leg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2leg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)23.44 Å
Rg(电子密度)23.29 Å
总 Rg24.11 Å
原子数5154
残基数322
排除体积46869 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2leg__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2leg__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2leg__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2leg__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2leg__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2leg__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2leg__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2leg__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2leg__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2leg__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2legA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
结构域编号 domain_id2legB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1550 — Bromodomain-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DsbB-like
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7. 引用文献 (1)