Protein capicua homolog
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 34–48 | 片段:Ataxin-1-binding linear motif (UNP 34-48) | Ataxin-1 × 1 (P54253) | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6.8;310 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient NMR样品组成:0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:0.5 mM [U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2M41 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
28–48(21 aa)
片段:UNP residues 28-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
28–48(21 aa)
片段:UNP residues 28-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
28–48(21 aa)
片段:UNP residues 28-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
21–48(28 aa)
片段:UNP residues 21-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
21–48(28 aa)
片段:UNP residues 21-48
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 A
199–276(78 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 D
199–276(78 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 G
199–276(78 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 J
199–276(78 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 6KZG 14-3-3 protein in Complex with CIC S301 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
298–305(8 aa)
链 Q
298–305(8 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;8% v/v TacsimateTM pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.231 |
| 6KZH 14-3-3 protein in Complex with CIC S173 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
170–177(8 aa)
链 Q
170–177(8 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 2.65 Å R-free 0.274 |
| 7M5W Crystal structure of the HMG-C1 domain of human capicua bound to DNA 提交 2021-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric |
链 A
188–280(93 aa)
片段:HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527
链 A
1457–1527(71 aa)
片段:HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;100 mM MES, 100 mM CaCl2, 100 mM NaCl, and 16% (w/v) PEG 8000
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分辨率 2.95 Å R-free 0.243 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CIC_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–15; UniProt 34–48 |