Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Cytochrome c iso-1 × 1 （P00044） Cytochrome c iso-1 × 1 （P00044） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEME C × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CCPR_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–294； UniProt 68–361 |
Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Cytochrome c peroxidase, mitochondrial × 1 （P00431） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEME C × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CYC1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2, 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 2–108； UniProt 3–109 作者链 C； PDB构建体 1–108； UniProt 2–109 |
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| 条目编号 entry_id | 2n18 |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-03-24 |
| 结构标题 title | Dominant form of the low-affinity complex of yeast cytochrome c and cytochrome c peroxidase |
| 关键词 keywords | cytochrome c, cytochrome c peroxidase, low affinity complex, OXIDOREDUCTASE-ELECTRON TRANSPORT complex; OXIDOREDUCTASE/ELECTRON TRANSPORT |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 9 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.25 Å |
| Rg（电子密度） | 26.52 Å |
| 总 Rg | 27.28 Å |
| 原子数 | 8241 |
| 残基数 | 510 |
| 排除体积 | 74326 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2n18__assembly_1__model_1 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2n18__assembly_1__model_2 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2n18__assembly_1__model_3 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2n18__assembly_1__model_4 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2n18__assembly_1__model_5 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2n18__assembly_1__model_6 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2n18__assembly_1__model_7 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2n18__assembly_1__model_8 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2n18__assembly_1__model_9 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2n18__assembly_1__model_10 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2n18__assembly_1__model_11 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2n18__assembly_1__model_12 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2n18__assembly_1__model_13 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2n18__assembly_1__model_14 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2n18__assembly_1__model_15 |
trimeric （3） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d2n18a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.93 — Heme-dependent peroxidases |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.93.1 — Heme-dependent peroxidases |
| 家族 Family family | a.93.1.1 — CCP-like |
| 结构域编号 domain_id | d2n18b1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.3 — Cytochrome c |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.3.1 — Cytochrome c |
| 家族 Family family | a.3.1.1 — monodomain cytochrome c |
| 结构域编号 domain_id | d2n18b2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2n18c_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.3 — Cytochrome c |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.3.1 — Cytochrome c |
| 家族 Family family | a.3.1.1 — monodomain cytochrome c |
| 结构域编号 domain_id | 2n18A01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 520 — Peroxidase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 2n18A02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Peroxidase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Peroxidase, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 2n18B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cytochrome c-like domain |
| 结构域编号 domain_id | 2n18C00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cytochrome c-like domain |