Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ras-related protein SEC4 × 1 （P07560） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Ras-related protein SEC4 × 2 （P07560） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SEC2_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–154； UniProt 17–167 作者链 B； PDB构建体 4–154； UniProt 17–167 |
Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Rab guanine nucleotide exchange factor SEC2 × 2 （P17065） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 6 | Rab guanine nucleotide exchange factor SEC2 × 4 （P17065） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SEC4_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–170； UniProt 18–187 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 2ocy |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-12-21 |
| 结构标题 title | Complex of the guanine exchange factor Sec2p and the Rab GTPase Sec4p |
| 关键词 keywords | Rab, GEF, guanine exchange factor, coiled-coil, ENDOCYTOSIS-EXOCYTOSIS COMPLEX; ENDOCYTOSIS/EXOCYTOSIS |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 52.50 Å |
| Rg（电子密度） | 54.38 Å |
| 总 Rg | 54.85 Å |
| 原子数 | 7184 |
| 残基数 | 874 |
| 排除体积 | 128350 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2ocya1 |
| 类 Class class | h — Coiled coil proteins |
| 折叠类型 Fold fold | h.1 — Parallel coiled-coil |
| 超家族 Superfamily superfamily | h.1.33 — Sec2 N-terminal region |
| 家族 Family family | h.1.33.1 — Sec2 N-terminal region |
| 结构域编号 domain_id | d2ocya2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2ocyb1 |
| 类 Class class | h — Coiled coil proteins |
| 折叠类型 Fold fold | h.1 — Parallel coiled-coil |
| 超家族 Superfamily superfamily | h.1.33 — Sec2 N-terminal region |
| 家族 Family family | h.1.33.1 — Sec2 N-terminal region |
| 结构域编号 domain_id | d2ocyb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d2ocyc1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 家族 Family family | c.37.1.8 — G proteins |
| 结构域编号 domain_id | 2ocyA00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Helix non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 140 — Helix Hairpins |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 910 — |
| 结构域编号 domain_id | 2ocyB00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Helix non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 140 — Helix Hairpins |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 910 — |
| 结构域编号 domain_id | 2ocyC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |