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2pzy

Structure of MK2 Complexed with Compound 76

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 129.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAP kinase-activated protein kinase 2

Homo sapiens

UniProt P49137

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 41–364 片段：MAPK-Activated protein kinase 2 B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K 分辨率 2.90 Å R-free 0.313
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 41–364 片段：MAPK-Activated protein kinase 2 B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K 分辨率 2.90 Å R-free 0.313
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 41–364 片段：MAPK-Activated protein kinase 2 STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K 分辨率 2.90 Å R-free 0.313
4 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 41–364 片段：MAPK-Activated protein kinase 2 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K 分辨率 2.90 Å R-free 0.313
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 41–364 链 B； UniProt 41–364 链 C； UniProt 41–364 链 D； UniProt 41–364 片段：MAPK-Activated protein kinase 2 B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 6 STU STAUROSPORINE × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；297 K；100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K 分辨率 2.90 Å R-free 0.313

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2PZY Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–400（400 aa）
未记录 HG MERCURY (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.15；298 K；2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.245
1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–400（400 aa）
未记录 HG MERCURY (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.15；298 K；2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.245
1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–400（400 aa）
链 B 1–400（400 aa）
未记录 HG MERCURY (II) ION × 42 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.15；298 K；2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.245
1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–400（400 aa） 片段：MK2
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–400（400 aa） 片段：MK2
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） STU STAUROSPORINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–400（400 aa） 片段：MK2
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–400（400 aa） 片段：MK2
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–400（400 aa） 片段：MK2
链 B 1–400（400 aa） 片段：MK2
链 C 1–400（400 aa） 片段：MK2
链 D 1–400（400 aa） 片段：MK2
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） STU STAUROSPORINE × 12 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
1NY3 Crystal structure of ADP bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–400（400 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；2.0M Ammonium Sulfate, pH unbuffered, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
1NY3 Crystal structure of ADP bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–400（400 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；2.0M Ammonium Sulfate, pH unbuffered, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
2JBO Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-1, soaking) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；1.5-1.6M SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE PH 4.5, 0.014M DEOXY-BIGCHAP. THE INHIBITOR WAS SOAKED INTO CRYSTALS GROWN INITIALLY FROM MK2-ADP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 41–364（324 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
分辨率 3.31 Å R-free 0.279
2OKR Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 370–393（24 aa） 片段：residues 370-393
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.272
2OKR Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 370–393（24 aa） 片段：residues 370-393
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.272
2ONL Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-24 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–400（400 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
分辨率 4.00 Å R-free 0.331
2ONL Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-24 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–400（400 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
分辨率 4.00 Å R-free 0.331
2OZA Structure of p38alpha complex 提交 2007-02-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 47–400（354 aa） 片段：MK2
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；5 to 20% PEG 4000, 100mM Na Citrate, 5mM DTT, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.296
2P3G Crystal structure of a pyrrolopyridine inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2007-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 45–371（327 aa） 片段：N- and C-terminally truncated
未记录 F10 2-[2-(2-FLUOROPHENYL)PYRIDIN-4-YL]-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；Protein solution (5 mg/ml) euqilibrated against 1.6 - 2.0 M sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 3.80 Å R-free 0.374
3A2C Crystal structure of a pyrazolopyrimidine inhibitor complex bound to MAPKAP Kinase-2 (MK2) 提交 2009-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 B 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 C 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 D 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 E 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 F 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 G 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 H 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 I 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 J 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 K 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
链 L 41–364（324 aa） 片段：kinase domaine, residues 41-364
未记录 PDY N~7~-(4-ethoxyphenyl)-6-methyl-N~5~-[(3S)-piperidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 24 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.335
3FPM Crystal Structure of a Squarate Inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2009-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 793 3-{[(1R)-1-phenylethyl]amino}-4-(pyridin-4-ylamino)cyclobut-3-ene-1,2-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；1600 mM Sodium Malonate pH 5, 1 % MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 3.30 Å R-free 0.337
3FPM Crystal Structure of a Squarate Inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2009-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 793 3-{[(1R)-1-phenylethyl]amino}-4-(pyridin-4-ylamino)cyclobut-3-ene-1,2-dione × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；1600 mM Sodium Malonate pH 5, 1 % MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 3.30 Å R-free 0.337
3FYJ Crystal structure of an optimzied benzothiophene inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 45–371（327 aa） 片段：MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
未记录 B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.388
3FYJ Crystal structure of an optimzied benzothiophene inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 45–371（327 aa） 片段：MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
未记录 B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.388
3FYK Crystal structure of a benzthiophene lead bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 45–371（327 aa） 片段：MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
未记录 B98 (3R)-3-(aminomethyl)-9-methoxy-1,2,3,4-tetrahydro-5H-[1]benzothieno[3,2-e][1,4]diazepin-5-one × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；MK-2 protein at 5 mg/ml equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.296
3FYK Crystal structure of a benzthiophene lead bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 45–371（327 aa） 片段：MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
未记录 B98 (3R)-3-(aminomethyl)-9-methoxy-1,2,3,4-tetrahydro-5H-[1]benzothieno[3,2-e][1,4]diazepin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；MK-2 protein at 5 mg/ml equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.296
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 B 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 C 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 D 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 E 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 F 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 G 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 H 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 I 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 J 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 K 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 L 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 17 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 B 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 C 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 E 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 F 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 H 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 I 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 K 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
链 L 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 41–364（324 aa） 片段：Protein kinase domain
未记录 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；273 K；40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3KA0 MK2 complex with inhibitor 6-(5-(2-aminopyrimidin-4-ylamino)-2-hydroxyphenyl)-N-methylbenzo[b]thiophene-2-carboxamide 提交 2009-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–366（320 aa） 片段：Kinase Domain
突变：T222E MK3 6-{5-[(2-aminopyrimidin-4-yl)amino]-2-hydroxyphenyl}-N-methylidene-1-benzothiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；2M Sodium Malonate pH 5.5 Anapoe 80 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 F 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 H 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
未记录 MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 E 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 J 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
未记录 MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 I 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 L 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
未记录 MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 G 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 K 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
未记录 MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 B 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 C 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 D 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 E 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 F 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 G 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 H 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 I 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 J 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 K 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
链 L 41–364（324 aa） 片段：Kinase domain
未记录 MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.298
3KGA Crystal structure of MAPKAP kinase 2 (MK2) complexed with a potent 3-aminopyrazole ATP site inhibitor 提交 2009-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa） 片段：Kinase domain
突变：DELTA216-236, P237G MG MAGNESIUM ION × 1 LX9 6-{3-amino-1-[3-(1H-indol-6-yl)phenyl]-1H-pyrazol-4-yl}-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；298 K；0.1M BICINE, 1.3M SODIUM MALONATE, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.235
3M2W Crystal structure of MAPKAK kinase 2 (MK2) complexed with a spiroazetidine-tetracyclic ATP site inhibitor 提交 2010-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa） 片段：Kinase domain
突变：DELTA216-236, P237G L8I 2'-(2-fluorophenyl)-1-methyl-6',8',9',11'-tetrahydrospiro[azetidine-3,10'-pyrido[3',4':4,5]pyrrolo[2,3-f]isoquinolin]-7'(5'H)-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；298 K；0.1M BICINE, 1.3M SODIUM MALONATE, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.41 Å R-free 0.227
3M42 Crystal structure of MAPKAP kinase 2 (MK2) complexed with a tetracyclic ATP site inhibitor 提交 2010-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa） 片段：Kinase domain
突变：DELTA216-236, P237G MG MAGNESIUM ION × 1 HGF 2-[5-(2-methoxyethoxy)pyridin-3-yl]-8,9,10,11-tetrahydro-7H-pyrido[3',4':4,5]pyrrolo[2,3-f]isoquinolin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；3.0M Na Formate, 0.1M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.232
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 05B 2'-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)pyrimidin-4-yl]-5',6'-dihydrospiro[piperidine-4,7'-pyrrolo[3,2-c]pyridin]-4'(1'H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 05B 2'-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)pyrimidin-4-yl]-5',6'-dihydrospiro[piperidine-4,7'-pyrrolo[3,2-c]pyridin]-4'(1'H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 47–364（318 aa） 片段：UNP residues 47-364
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.316
3R2Y MK2 kinase bound to Compound 1 提交 2011-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 46–364（319 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 46-364
未记录 MLI MALONATE ION × 2 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.6 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.334
3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 46–364（319 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 46-364
未记录 CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.332
3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 46–364（319 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 46-364
未记录 CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.332
3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 46–364（319 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 46-364
未记录 CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.332
3WI6 Crystal structure of MAPKAP Kinase-2 (MK2) in complex with non-selective inhibitor 提交 2013-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
链 B 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
链 C 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
链 D 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
链 E 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
链 F 41–364（324 aa） 片段：UNP residues 41-364
未记录 YRZ N-[(3S)-piperidin-3-yl]-7,8-dihydro-6H-pyrazolo[1,5-a]pyrrolo[3,2-e]pyrimidin-5-amine × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1M Na-Acetate, 1.6M Ammonium Sulphate, 200mM NaCl, 1.4mM Deoxi Big Chap, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.99 Å R-free 0.283
4TYH Ternary complex of P38 and MK2 with a P38 inhibitor 提交 2014-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 51–400（350 aa） 片段：UNP residues 51-400
未记录 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；9% PEG 4K, 100mM NaCit, pH 5.6
分辨率 3.00 Å R-free 0.313
6T8X Crystal structure of MAPKAPK2 (MK2) complexed with PF-3644022 and 5-(4-bromophenyl)-N-[4-(1-piperazinyl)phenyl]-N-(2-pyridinylmethyl)-2-furancarboxamide 提交 2019-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 41–338（298 aa）
链 B 41–338（298 aa）
链 C 41–338（298 aa）
链 D 41–338（298 aa）
链 E 41–338（298 aa）
链 F 41–338（298 aa）
突变：T222E, T334E 突变：T222E, T334E 突变：T222E, T334E 突变：T222E, T334E 突变：T222E, T334E 突变：T222E, T334E B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 6 CL CHLORIDE ION × 6 MW8 5-(4-bromophenyl)-~{N}-(4-piperazin-1-ylphenyl)-~{N}-(pyridin-2-ylmethyl)furan-2-carboxamide × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；1.3M NaMalonate, 0.1M Hepes pH6.0, 0.5% jeffamine ED2003
分辨率 2.81 Å R-free 0.247
6TCA Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor 提交 2019-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 41–400（360 aa）
未记录 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；295 K；100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
分辨率 3.70 Å R-free 0.297
6TCA Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor 提交 2019-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 41–400（360 aa）
未记录 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；295 K；100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
分辨率 3.70 Å R-free 0.297
6TCA Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor 提交 2019-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 41–400（360 aa）
未记录 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；295 K；100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
分辨率 3.70 Å R-free 0.297
6TCA Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor 提交 2019-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 41–400（360 aa）
未记录 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；295 K；100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
分辨率 3.70 Å R-free 0.297
7NRY Re-refinement of MAPKAP kinase-2/inhibitor complex 3fyj 提交 2021-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 X 45–371（327 aa）
未记录 B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 3 CL CHLORIDE ION × 3 MLA MALONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 47–364（318 aa）
突变：S216G MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 47–364（318 aa）
突变：S216G MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 47–364（318 aa）
突变：S216G MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 47–364（318 aa）
突变：S216G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 3.40 Å R-free 0.263
8XX1 The Crystal Structure of MAPKAP kinase 2 domain from Biortus 提交 2024-01-17 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–364（318 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH 7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
分辨率 2.55 Å R-free 0.245
9R59 Crystal structure of MAPKAPK2 with a covalent compound GCL334 targeting lysine 提交 2025-05-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 48–364（317 aa）
未记录 A1JH4 5-[3-[bis(oxidanyl)-$l^{3}-sulfanyl]oxy-4-chloranyl-phenyl]-~{N}-(4-piperazin-1-ylphenyl)-~{N}-(pyridin-2-ylmethyl)furan-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1M succinic acid, 1% PEG2000 MME, 0.1M HEPES pH 7.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.229

共 30 个其他 PDB 条目、100 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MAPK2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–324； UniProt 41–364 作者链 B； PDB构建体 1–324； UniProt 41–364 作者链 C； PDB构建体 1–324； UniProt 41–364 作者链 D； PDB构建体 1–324； UniProt 41–364

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2pzy

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2pzy
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2pzy
沉积日期 deposition_date2007-05-18
结构标题 titleStructure of MK2 Complexed with Compound 76
关键词 keywordsMK2, Protein Kinase, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.62 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron38.94 Å
零角强度 I(0) i0270397000.00
分子量 molecular_weight136480.0 kDa
排除体积 excluded_volume172110 ų
包络体积 envelope_volume239980 ų
水化壳体积 shell_volume51718 ų
包络直径 envelope_diameter133.4 Å
壳层 Rg shell_rg44.90 Å
包络 Rg envelope_rg37.97 Å
形状 Rg shape_rg38.96 Å
总 Rg total_rg39.23 Å
总原子数 total_atoms9585
残基数 n_residues1169
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax129.7 Å
Rg (实空间) rg_real39.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.02 Å
I(0) (实空间) i0_real2.7040e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.8810e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.58 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal270400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8289
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary48.6 Å
偏度 Skewness skewness0.188
峰度 Kurtosis kurtosis-0.548
角度范围 angular_range— – 0.2000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha24550000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.925; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2pzya_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit
结构域编号 domain_idd2pzyb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit
结构域编号 domain_idd2pzyc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit
结构域编号 domain_idd2pzyd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id2pzyA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id2pzyA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id2pzyB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id2pzyB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id2pzyC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id2pzyC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id2pzyD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id2pzyD02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)