2r59

Leukotriene A4 hydrolase complexed with inhibitor RB3041

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Leukotriene A-4 hydrolase

Homo sapiens

UniProt P09960

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ZINC ION × 1 YTTERBIUM (III) ION × 1 N-{(2S)-3-[(R)-[(1R)-1-amino-2-phenylethyl](hydroxy)phosphoryl]-2-benzylpropanoyl}-L-phenylalanine × 1 ACETIC ACID × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LKHA4_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 7–616; UniProt 2–611

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2r59
沉积日期 deposition_date2007-09-03
结构标题 titleLeukotriene A4 hydrolase complexed with inhibitor RB3041
关键词 keywords;transition state, analogue peptide, hydrolysis, Alternative splicing, Cytoplasm, Hydrolase, Leukotriene biosynthesis, Metal-binding, Metalloprotease, Multifunctional enzyme, Protease, Zinc ;; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2r59__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2r59__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2r59__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.99 Å
Rg(电子密度)24.87 Å
总 Rg25.90 Å
原子数4918
残基数610
排除体积88037 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2r59__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2r59a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.1 — ARM repeat
家族 Family familya.118.1.7 — Leukotriene A4 hydrolase C-terminal domain
结构域编号 domain_idd2r59a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.98 — Zn aminopeptidase N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyb.98.1 — Zn aminopeptidase N-terminal domain
家族 Family familyb.98.1.1 — Zn aminopeptidase N-terminal domain
结构域编号 domain_idd2r59a3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.13 — Zn aminopeptidase catalytic domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2r59A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1730 — tricorn interacting facor f3 domain
结构域编号 domain_id2r59A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2010 — Zincin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30
结构域编号 domain_id2r59A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology390 — Neutral Protease; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neutral Protease Domain 2
结构域编号 domain_id2r59A04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily320 — Peptidase M1, leukotriene A4 hydrolase/aminopeptidase C-terminal domain

7. 引用文献 (6)