Staphylococcus aureus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 | 单体 | 蛋白 1 其他聚合物 1 | ;N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose ; × 1 POTASSIUM ION × 3 CITRIC ACID × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | A8E1U5_STAAU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 |
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| 条目编号 entry_id | 2rdg |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-09-24 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Staphylococcal Superantigen-Like protein 11 in complex with Sialyl Lewis X |
| 关键词 keywords | OB fold, beta grasp, protein-carbohydrate complex, TOXIN; TOXIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.69 Å |
| Rg（电子密度） | 17.45 Å |
| 总 Rg | 18.48 Å |
| 原子数 | 1625 |
| 残基数 | 192 |
| 排除体积 | 28773 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2rdga1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.40 — OB-fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.40.2 — Bacterial enterotoxins |
| 家族 Family family | b.40.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d2rdga2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.6 — Superantigen toxins, C-terminal domain |
| 家族 Family family | d.15.6.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 2rdgA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 120 — |
| 结构域编号 domain_id | 2rdgA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 110 — |