SAXSdb — 2rhk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

Influenza A Virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 85–215 链 B； UniProt 85–215	片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 2 （O95639） NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 85–215 链 B； UniProt 85–215	片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 3 （O95639） NO3 NITRATE ION × 9 ZN ZINC ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 85–215	片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 2 （O95639） NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 85–215 链 B； UniProt 85–215	片段：NS1A effector domain (UNP residues 85-215)	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 1 （O95639） NO3 NITRATE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2RHK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AIL N-TERMINAL FRAGMENT OF NS1 PROTEIN FROM INFLUENZA A VIRUS 提交 1997-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–72（72 aa）片段：RNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；NATIVE CRYSTALS WERE GROWN FROM 50MM NAH2PO4, 100MM NACL, 1MM NAN3 AT PH 6.5; MERCURY DERIVATIVE CRYSTAL WAS PREPARED BY SOAKING THE NATIVE CRYSTAL IN 2MM CH3HGCL WITH 10% PEG 6000 AT PH 8.0; PLATINUM DERIVATIVE CRYSTAL WAS PREPARED BY SOAKING THE NATIVE CRYSTAL IN 4MM PT(NH3)2CL2 WITH 10% PEG 6000 AT PH 6.5.	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
1NS1 RNA-BINDING DOMAIN OF NON-STRUCTURAL PROTEIN 1 FROM INFLUENZA VIRUS, NMR, 16 STRUCTURES 提交 1997-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–73（73 aa）片段：RNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 1 - 73 链 B 1–73（73 aa）片段：RNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 1 - 73	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；293 K	分辨率未提供
3EE8 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% (w/v) PEG3350, and 4% (v/v) Tacsimate (pH6.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
3EE8 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% (w/v) PEG3350, and 4% (v/v) Tacsimate (pH6.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
3EE9 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Batch；pH 5.5；298 K；20% (w/v) PEG400, 0.1M CH3COONa (pH5.5), 0.1M MgSO4, Batch, temperature 298K	分辨率 2.14 Å R-free 0.234
3EE9 Structure of NS1 effector domain 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 84–205（122 aa）片段：Effector domain (UNP residues 84-205)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Batch；pH 5.5；298 K；20% (w/v) PEG400, 0.1M CH3COONa (pH5.5), 0.1M MgSO4, Batch, temperature 298K	分辨率 2.14 Å R-free 0.234
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWG X-ray structure of NS1 effector domain W187A mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain 链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187A 突变：W187A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate, 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.233
3KWI X-ray structure of NS1 effector domain W187Y mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate and 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.258
3KWI X-ray structure of NS1 effector domain W187Y mutant 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 78–205（128 aa）片段：NS1 effector domain	突变：W187Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；0.3M magnesium formate and 0.1M Bis-Tris , pH 5.5, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.21 Å R-free 0.258

共 6 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NS1_IAUDO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–132； UniProt 85–215 作者链 B； PDB构建体 2–132； UniProt 85–215

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4

Homo sapiens

UniProt O95639

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 61–121 链 D； UniProt 61–121	片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121) 突变：P94S	Non-structural protein 1 × 2 （P03495） NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 61–121 链 D； UniProt 61–121	片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121) 突变：P94S	Non-structural protein 1 × 3 （P03495） NO3 NITRATE ION × 9 ZN ZINC ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 61–121 链 D； UniProt 61–121	片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121) 突变：P94S	Non-structural protein 1 × 1 （P03495） NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 61–121	片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121) 突变：P94S	Non-structural protein 1 × 2 （P03495） NO3 NITRATE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50	分辨率 1.95 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2RHK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2D9N Solution structure of CCCH type zinc-finger domain 2 in Cleavage and polyadenylation specificity factor 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 61–126（66 aa）片段：CCCH-type zinc finger motif	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient NMR样品组成 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 50uM ZnCl2+1mM IDA, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6DNH Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution 提交 2018-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6FUW Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution 提交 2018-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–178（178 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；15 seconds wait time prior to blotting	分辨率 3.07 Å
6URG Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-CPSF100 PIM complex 提交 2019-10-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6URO Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex 提交 2019-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 118–178（61 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 118–178（61 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 118–178（61 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 118–178（61 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.264
8E3I CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal 提交 2022-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8E3Q CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF 提交 2022-08-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
8R8R Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc) 提交 2023-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 C 2–244（243 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.79 Å
9OXE CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal 提交 2025-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
9OXS CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal 提交 2025-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å

共 11 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CPSF4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 12–72； UniProt 61–121 作者链 D； PDB构建体 12–72； UniProt 61–121

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2rhk
沉积日期 deposition_date	2007-10-09
结构标题 title	Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
关键词 keywords	;Influenza A, Nonstructural protein, viral protein: host complex, Zn finger, Alternative splicing, Cytoplasm, Host-virus interaction, Interferon antiviral system evasion, Nucleus, RNA-binding, Suppressor of RNA silencing, Metal-binding, mRNA processing, Zinc, Zinc-finger, METAL BINDING PROTEIN, VIRAL PROTEIN-METAL BINDING PROTEIN COMPLEX, VIRAL PROTEIN-NUCLEAR PROTEIN COMPLEX, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG ;; VIRAL PROTEIN/NUCLEAR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.66 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.02 Å
零角强度 I(0) i0	31223300.00
分子量 molecular_weight	42260.0 kDa
排除体积 excluded_volume	52630 Å³
包络体积 envelope_volume	65865 Å³
水化壳体积 shell_volume	23798 Å³
包络直径 envelope_diameter	92.6 Å
壳层 Rg shell_rg	30.07 Å
包络 Rg envelope_rg	24.83 Å
形状 Rg shape_rg	24.09 Å
总 Rg total_rg	24.54 Å
总原子数 total_atoms	2943
残基数 n_residues	361
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	89.8 Å
Rg (实空间) rg_real	24.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1220e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.3610e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.70 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	31220000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8406
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.422
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.138
角度范围 angular_range	— – 0.3200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5522000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.703; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.825; Smooth: 0.989

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Non-structural protein 1
分子量 formula_weight	15964.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3128

MPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEWNDNTVRVSKTLQRFAWGSSNENGRPPLTLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A Virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11320
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
分子量 formula_weight	8570.8 kDa
突变 mutation	P94S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MGHHHHHHSHMSGEKTVVCKHWLRGLCKKGDQCEFLHEYDMTKMSECYFYSKFGECSNKECPFLHIDPESKI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NITRATE ION
分子量 formula_weight	62.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	122.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	185

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2rhka_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family family	d.299.1.1 — Ns1 effector domain-like

结构域编号 domain_id	d2rhkb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family family	d.299.1.1 — Ns1 effector domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2rhkA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain

结构域编号 domain_id	2rhkB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain

结构域编号 domain_id	2rhkC00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1000 — CCCH zinc finger
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, CCCH-type

结构域编号 domain_id	2rhkD00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1000 — CCCH zinc finger
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, CCCH-type

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	50.960 Å
晶胞边长 b length_b	50.960 Å
晶胞边长 c length_c	205.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2100
R_work r_work	0.2100
R_free r_free	0.2340

fit	/app/data/saxs_computation/rh/2rhk/2rhk.fit
pddf	/app/data/pr_computation/rh/2rhk/2rhk.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/rh/2rhk/2rhk.dat

Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)