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2D9N
Solution structure of CCCH type zinc-finger domain 2 in Cleavage and polyadenylation specificity factor
提交 2005-12-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
61–126(66 aa)
片段:CCCH-type zinc finger motif
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM;压力 ambient
NMR样品组成
20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 50uM ZnCl2+1mM IDA,
90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2RHK
Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
提交 2007-10-09
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 C
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
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突变:P94S
突变:P94S
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NO3 NITRATE ION × 5
ZN ZINC ION × 4
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.234
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2RHK
Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
提交 2007-10-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 C
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
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突变:P94S
突变:P94S
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NO3 NITRATE ION × 9
ZN ZINC ION × 6
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.234
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2RHK
Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
提交 2007-10-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
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突变:P94S
突变:P94S
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NO3 NITRATE ION × 5
ZN ZINC ION × 4
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.234
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2RHK
Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
提交 2007-10-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 D
61–121(61 aa)
片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
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突变:P94S
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NO3 NITRATE ION × 4
ZN ZINC ION × 2
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.234
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6DNH
Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution
提交 2018-06-06
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:tetrameric
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链 C
1–244(244 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å
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6FUW
Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution
提交 2018-02-28
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:tetrameric
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链 C
1–178(178 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;15 seconds wait time prior to blotting
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分辨率 3.07 Å
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6URO
Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex
提交 2019-10-23
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:hexameric
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链 C
1–244(244 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.60 Å
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7ZYH
Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1
提交 2022-05-24
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
118–178(61 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
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分辨率 2.20 Å
R-free 0.264
|
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7ZYH
Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1
提交 2022-05-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 D
118–178(61 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.264
|
|
7ZYH
Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1
提交 2022-05-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 G
118–178(61 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.264
|
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7ZYH
Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1
提交 2022-05-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 J
118–178(61 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.264
|
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8E3I
CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal
提交 2022-08-17
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:tetrameric
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链 C
1–244(244 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.53 Å
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8E3Q
CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF
提交 2022-08-17
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聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1–244(244 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.68 Å
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8R8R
Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc)
提交 2023-11-29
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:pentameric
|
链 C
2–244(243 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.79 Å
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9OXE
CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal
提交 2025-06-03
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:tetrameric
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链 C
1–244(244 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.53 Å
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9OXS
CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal
提交 2025-06-04
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
1–244(244 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å
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