2rii

Crystal Structure of Human Peroxiredoxin I in complex with Sulfiredoxin

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peroxiredoxin-1

Homo sapiens

UniProt Q06830

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Sulfiredoxin-1 × 2 (Q9BYN0) PHOSPHATE ION × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRDX1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 B; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199

Sulfiredoxin-1

Homo sapiens

UniProt Q9BYN0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Peroxiredoxin-1 × 2 (Q06830) PHOSPHATE ION × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SRXN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 5–110; UniProt 32–137 作者链 Y; PDB构建体 5–110; UniProt 32–137

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2rii
沉积日期 deposition_date2007-10-11
结构标题 titleCrystal Structure of Human Peroxiredoxin I in complex with Sulfiredoxin
关键词 keywords;protein-protein complex, engineered disulfide bond, sulfinic acid reductase, Antioxidant, Oxidoreductase, Peroxidase, Phosphorylation, Redox-active center, ATP-binding, Magnesium, Nucleotide-binding, ----, OXIDOREDUCTASE COMPLEX ;; OXIDOREDUCTASE COMPLEX
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2rii__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2rii__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2rii__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.66 Å
Rg(电子密度)26.79 Å
总 Rg27.51 Å
原子数4475
残基数574
排除体积79876 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2rii__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2riia_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamilyc.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family familyc.47.1.10 — Glutathione peroxidase-like
结构域编号 domain_idd2riib_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamilyc.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family familyc.47.1.10 — Glutathione peroxidase-like
结构域编号 domain_idd2riix_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.268 — ParB/Sulfiredoxin
超家族 Superfamily superfamilyd.268.1 — ParB/Sulfiredoxin
家族 Family familyd.268.1.4 — Sulfiredoxin-like
结构域编号 domain_idd2riiy_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.268 — ParB/Sulfiredoxin
超家族 Superfamily superfamilyd.268.1 — ParB/Sulfiredoxin
家族 Family familyd.268.1.4 — Sulfiredoxin-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2riiA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
结构域编号 domain_id2riiB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
结构域编号 domain_id2riiX01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1530 — Conserved hypothetical protein from pyrococcus furiosus pfu- 392566-001, ParB domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Conserved hypothetical protein from pyrococcus furiosus pfu- 392566-001, ParB domain
结构域编号 domain_id2riiY01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1530 — Conserved hypothetical protein from pyrococcus furiosus pfu- 392566-001, ParB domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Conserved hypothetical protein from pyrococcus furiosus pfu- 392566-001, ParB domain
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7. 引用文献 (1)