2ru7

Refined structure of RNA aptamer in complex with the partial binding peptide of prion protein

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P16 peptide from Major prion protein

物种未注明

UniProt P10279

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 2 RNA 2 RNA_(5'-R(*GP*GP*AP*GP*GP*AP*GP*GP*AP*GP*GP*A)-3') × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRIO_BOVIN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–12; UniProt 108–119 作者链 D; PDB构建体 1–12; UniProt 108–119

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ru7
沉积日期 deposition_date2013-12-24
结构标题 titleRefined structure of RNA aptamer in complex with the partial binding peptide of prion protein
关键词 keywords;Aptamer, Prion, RNA, Alzheimer's disease, Membrane protein-RNA complex ;; Membrane Protein/RNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ru7__assembly_1__model_3

Assembly 1 · Model 3 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ru7__assembly_1__model_3 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ru7__assembly_1__model_3 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)12.02 Å
Rg(电子密度)11.43 Å
总 Rg12.50 Å
原子数1202
残基数48
排除体积10855 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ru7__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2ru7__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2ru7__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2ru7__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2ru7__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 引用文献 (1)