Tobacco mosaic virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 同源多聚体 | 蛋白 49 RNA 49 | ;RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3') ; × 49 CALCIUM ION × 49 water × 98 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3') ; × 1 CALCIUM ION × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| 3 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3') ; × 1 CALCIUM ION × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | COAT_TMV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 P； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 |
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| 条目编号 entry_id | 2tmv |
| 沉积日期 deposition_date | 1988-09-15 |
| 结构标题 title | VISUALIZATION OF PROTEIN-NUCLEIC ACID INTERACTIONS IN A VIRUS. REFINED STRUCTURE OF INTACT TOBACCO MOSAIC VIRUS AT 2.9 ANGSTROMS RESOLUTION BY X-RAY FIBER DIFFRACTION |
| 关键词 keywords | VIRUS, Helical virus, Virus-RNA COMPLEX; Virus/RNA |
| 实验方法 method | FIBER DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 62.37 Å |
| Rg（电子密度） | 63.06 Å |
| 总 Rg | 62.83 Å |
| 原子数 | 62720 |
| 残基数 | 7693 |
| 排除体积 | 1096300 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2tmv__assembly_1__model_1 |
helical （98） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 2tmv__assembly_2__model_1 |
dimeric （2） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 3 | 1 | 2tmv__assembly_3__model_1 |
dimeric （2） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。 | ||||||
| 结构域编号 domain_id | d2tmvp_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.5 — TMV-like viral coat proteins |
| 家族 Family family | a.24.5.1 — TMV-like viral coat proteins |
| 结构域编号 domain_id | 2tmvP00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 70 — Tobacco mosaic virus-like, coat protein |