2v1c

Crystal structure and mutational study of RecOR provide insight into its role in DNA repair

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RECOMBINATION PROTEIN RECR

DEINOCOCCUS RADIODURANS

UniProt Q9ZNA2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 HYPOTHETICAL PROTEIN × 2 (Q9RW50) ZINC ION × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RECR_DEIRA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220 作者链 B; PDB构建体 1–220; UniProt 1–220

HYPOTHETICAL PROTEIN

DEINOCOCCUS RADIODURANS

UniProt Q9RW50

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 RECOMBINATION PROTEIN RECR × 4 (Q9ZNA2) ZINC ION × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9RW50_DEIRA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–244; UniProt 1–244

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2v1c
沉积日期 deposition_date2007-05-23
结构标题 titleCrystal structure and mutational study of RecOR provide insight into its role in DNA repair
关键词 keywords;RECOMBINATION, HOMOLOGOUS RECOMBINATION, RECFOR PATHWAY, DNA RECOMBINATION, DNA BINDING, ZINC-FINGER, METAL-BINDING, RECOR COMPLEX, HYPOTHETICAL PROTEIN, DEINOCOCCUS RADIODURANS, RECR, ZINC, RECO, DNA DAMAGE, DNA REPAIR ;; RECOMBINATION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2v1c__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2v1c__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2v1c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.91 Å
Rg(电子密度)35.09 Å
总 Rg35.76 Å
原子数9562
残基数1254
排除体积170930 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2v1c__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2v1ca1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.49 — Recombination protein RecR
超家族 Superfamily superfamilye.49.1 — Recombination protein RecR
家族 Family familye.49.1.1 — Recombination protein RecR
结构域编号 domain_idd2v1cb1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.49 — Recombination protein RecR
超家族 Superfamily superfamilye.49.1 — Recombination protein RecR
家族 Family familye.49.1.1 — Recombination protein RecR

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id2v1cA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — RecR Domain 1
结构域编号 domain_id2v1cA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 —
结构域编号 domain_id2v1cA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Dna Topoisomerase Vi A Subunit; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2v1cB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — RecR Domain 1
结构域编号 domain_id2v1cB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 —
结构域编号 domain_id2v1cB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Dna Topoisomerase Vi A Subunit; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id2v1cB04
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily240 —
结构域编号 domain_id2v1cC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id2v1cC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 — Recombination protein O, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2v1cC03
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology220 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Recombination protein O, zinc-binding domain
▶

7. 引用文献 (1)