SAXSdb — 2v6e

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTELEMORASE

KLEBSIELLA PHAGE PHIKO2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	同源多聚体	蛋白 2 DNA 4	TELRL × 2 TELRL × 2 VANADATE ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6UAV6_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 21–558； UniProt 1–538 作者链 B； PDB构建体 21–558； UniProt 1–538

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2v6e
沉积日期 deposition_date	2007-07-17
结构标题 title	protelomerase TelK complexed with substrate DNA
关键词 keywords	HAIRPIN TELOMERE, HYDROLASE, RESOLVASE, PROTELOMERASE, DNA DISTORTION; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2v6e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2v6e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2v6e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.97 Å
Rg（电子密度）	37.38 Å
总 Rg	37.76 Å
原子数	10082
残基数	1152
排除体积	172980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2v6e__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTELEMORASE
分子量 formula_weight	64239.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	10082

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMRKVKIGELINSLVSEVEAIDASDRPQGDKTKKIKAAALKYKNALFNDKRKFRGKGLEKRISANTFNSYMSRARKRFDDRLHHNFEKNVIKLSEKYPLYSEELSSWLSMPAASIRQHMSRLQAKLKEIMPLAEDLSNIKIGTKNSEAKINKLANKYPEWQFAISDLNSEDWKDKRDYLYKLFQQGSSLLEDLNNLKVNHEVLYHLQLSSAERTSIQQRWANVLSEKKRNVVVIDYPRYMQAIYDIINKPIVSFDLTTRRGMAPLAFALAALSGRRMIEIMLQGEFSVAGKYTVTFLGQAKKRSEDKGISRKIYTLCDATLFVSLVNELRSCPAAADFDEVIKGYGENDTRSENGRINAILATAFNPWVKTFLGDDRRVYKDSRAIYARIAYEMFFRVDPRWKNVDEDVFFMEILGHDDENTQLHYKQFKLANFSRTWRPNVGEENARLAALQKLDSMMPDFARGDAGVRIHETVKQLVEQDPSIKITNSTLRPFNFSTRLIPRYLEFAADALGQFVGENGQWQLKDEAPAIVLPDEEI

来源 Source

来源生物 organism	KLEBSIELLA PHAGE PHIKO2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	255431
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TELRL
分子量 formula_weight	7770.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C,E

CGCGCGTATAATGGGCAATTGTGTG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	TELRL
分子量 formula_weight	5732.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D,F

CACACAATTGCCCATTATA

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	VANADATE ION
分子量 formula_weight	114.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	2v6eA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3180 —

结构域编号 domain_id	2v6eA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	270 —

结构域编号 domain_id	2v6eA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	443 — hpI Integrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Telomere resolvase

结构域编号 domain_id	2v6eA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2040 —

结构域编号 domain_id	2v6eB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3180 —

结构域编号 domain_id	2v6eB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	270 —

结构域编号 domain_id	2v6eB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	443 — hpI Integrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Telomere resolvase

结构域编号 domain_id	2v6eB04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2040 —

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晶胞边长 a length_a	157.973 Å
晶胞边长 b length_b	157.973 Å
晶胞边长 c length_c	90.842 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2554
R_work r_work	0.2554
R_free r_free	0.2860

protelomerase TelK complexed with substrate DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTELEMORASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v6e__assembly_1__model_1

2v6e__assembly_1__model_1 | I(q)

2v6e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

protelomerase TelK complexed with substrate DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTELEMORASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v6e__assembly_1__model_1

2v6e__assembly_1__model_1 | I(q)

2v6e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)