2v93

EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN

ESCHERICHIA COLI

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	1-(1-HYDROXY-2,2,6,6-TETRAMETHYLPIPERIDIN-4-YL)PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECO57
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–370； UniProt 27–396

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2v93
沉积日期 deposition_date	2007-08-21
结构标题 title	EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR
关键词 keywords	;MBP, PRE, PERIPLASM, TRANSPORT, DOMAIN MOTION, RAPID CONFORMATIONAL EXCHANGE, TRANSPORT PROTEIN, SUGAR TRANSPORT, MINOR SPECIES IN SOLUTION ;; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2v93__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2v93__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2v93__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.21 Å
Rg（电子密度）	16.19 Å
总 Rg	17.06 Å
原子数	814
残基数	149
排除体积	9030 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2v93__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2v93__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2v93__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2v93__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`2v93__assembly_1__model_5`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`2v93__assembly_1__model_6`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`2v93__assembly_1__model_7`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`2v93__assembly_1__model_8`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`2v93__assembly_1__model_9`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`2v93__assembly_1__model_10`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`2v93__assembly_1__model_11`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`2v93__assembly_1__model_12`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`2v93__assembly_1__model_13`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`2v93__assembly_1__model_14`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`2v93__assembly_1__model_15`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`2v93__assembly_1__model_16`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`2v93__assembly_1__model_17`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`2v93__assembly_1__model_18`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`2v93__assembly_1__model_19`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`2v93__assembly_1__model_20`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`2v93__assembly_1__model_21`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`2v93__assembly_1__model_22`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`2v93__assembly_1__model_23`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`2v93__assembly_1__model_24`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`2v93__assembly_1__model_25`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`2v93__assembly_1__model_26`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`2v93__assembly_1__model_27`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`2v93__assembly_1__model_28`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`2v93__assembly_1__model_29`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`2v93__assembly_1__model_30`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	31	`2v93__assembly_1__model_31`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	32	`2v93__assembly_1__model_32`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	33	`2v93__assembly_1__model_33`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	34	`2v93__assembly_1__model_34`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	35	`2v93__assembly_1__model_35`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	36	`2v93__assembly_1__model_36`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	37	`2v93__assembly_1__model_37`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	38	`2v93__assembly_1__model_38`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	39	`2v93__assembly_1__model_39`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	40	`2v93__assembly_1__model_40`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	41	`2v93__assembly_1__model_41`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	42	`2v93__assembly_1__model_42`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	43	`2v93__assembly_1__model_43`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	44	`2v93__assembly_1__model_44`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	45	`2v93__assembly_1__model_45`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	46	`2v93__assembly_1__model_46`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	47	`2v93__assembly_1__model_47`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	48	`2v93__assembly_1__model_48`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	49	`2v93__assembly_1__model_49`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	50	`2v93__assembly_1__model_50`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2v93a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamily	c.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family family	c.94.1.1 — Phosphate binding protein-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2v93A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	2v93A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
分子量 formula_weight	40757.3 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	189600

来源生物 organism	ESCHERICHIA COLI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v93__assembly_1__model_1

2v93__assembly_1__model_1 | I(q)

2v93__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v93__assembly_1__model_1

2v93__assembly_1__model_1 | I(q)

2v93__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)