SAXSdb — 2ve7

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 80–286	片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224	KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24 × 1 （Q9BZD4,Q8NBT2） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 80–286	片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224	KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24 × 1 （Q9BZD4,Q8NBT2） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2VE7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IGP Crystal Structure of Hec1 CH domain 提交 2006-09-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 81–196（116 aa）	未记录	BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M cacodylate, pH 6.5, 22-30% PEG 8K, 0.2 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.231
8G0P Crystal structure of the human Ndc80:Nuf2 loop region 提交 2023-02-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 370–509（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1 M TRIS pH 8.6, and 0.2 M magnesium chloride	分辨率 2.00 Å R-free 0.297
9N9G Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 1 1–642（642 aa）链 N 1–642（642 aa）链 n 1–642（642 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KNTC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–208； UniProt 80–286 作者链 B； PDB构建体 2–208； UniProt 80–286

KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25

HOMO SAPIENS

UniProt Q9HBM1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 118–224	片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224	KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24 × 1 （Q9BZD4,Q8NBT2） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 118–224	片段：CHIMERA OF NDC80 RESIDUES 80-286 WITH SPC25 RESIDUES 118-224	KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24 × 1 （Q9BZD4,Q8NBT2） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2VE7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3IZ0 Human Ndc80 Bonsai Decorated Microtubule 提交 2010-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 118–224（107 aa）链 E 118–224（107 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；80mM PIPES, 1mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 0.05% Nonidet P-40, 20uM taxol cryo-EM玻璃化条件 2ul of 0.25 mg per ml MTs applied to grid for 1 minute 4ul of 0.7 mg per ml Ndc80 bonsai added, 1 minute manually blotted, then another 4ul of Ndc80 applied 1 minute 2ul removed with pipetter Blot for 2 seconds before plunging, 0mm offset；冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.60 Å
8PPR Structure of the human outer kinetochore KMN network complex 提交 2023-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 1–224（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8Q5H Human KMN network (outer kinetochore) 提交 2023-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 5 93–224（132 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPC25_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 209–315； UniProt 118–224 作者链 B； PDB构建体 209–315； UniProt 118–224

KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24

HOMO SAPIENS

UniProt Q8NBT2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 122–197	片段：CHIMERA OF NUF2 RESIDUES 1-169 WITH SPC24 RESIDUES 122-197 突变：YES	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25 × 1 （O14777,Q9HBM1） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 122–197	片段：CHIMERA OF NUF2 RESIDUES 1-169 WITH SPC24 RESIDUES 122-197 突变：YES	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25 × 1 （O14777,Q9HBM1） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2VE7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8PPR Structure of the human outer kinetochore KMN network complex 提交 2023-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–197（197 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8Q5H Human KMN network (outer kinetochore) 提交 2023-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 4 110–197（88 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPC24_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 175–250； UniProt 122–197 作者链 D； PDB构建体 175–250； UniProt 122–197

KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24

HOMO SAPIENS

UniProt Q9BZD4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–169	片段：CHIMERA OF NUF2 RESIDUES 1-169 WITH SPC24 RESIDUES 122-197 突变：YES	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25 × 1 （O14777,Q9HBM1） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–169	片段：CHIMERA OF NUF2 RESIDUES 1-169 WITH SPC24 RESIDUES 122-197 突变：YES	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25 × 1 （O14777,Q9HBM1） GOL GLYCEROL × 1 IPH PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；4.5-6.5 PEG 6000, 1.5-2 MPD, 0.1 M NAHEPES PH 7.5, 16 MM TCEP, 15 MM PHENOL	分辨率 2.88 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2VE7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8G0P Crystal structure of the human Ndc80:Nuf2 loop region 提交 2023-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 252–347（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1 M TRIS pH 8.6, and 0.2 M magnesium chloride	分辨率 2.00 Å R-free 0.297
9N9G Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 1–464（464 aa）链 f 1–464（464 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NUF2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 6–174； UniProt 1–169 作者链 D； PDB构建体 6–174； UniProt 1–169

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2ve7
沉积日期 deposition_date	2007-10-17
结构标题 title	Crystal structure of a bonsai version of the human Ndc80 complex
关键词 keywords	MITOSIS, CENTROMERE, CELL CYCLE, MICROTUBULE, KINETOCHORE, CELL DIVISION, CALPONIN HOMOLOGY; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	65.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	67.72 Å
零角强度 I(0) i0	192282000.00
分子量 molecular_weight	116960.0 kDa
排除体积 excluded_volume	147420 Å³
包络体积 envelope_volume	285670 Å³
水化壳体积 shell_volume	43187 Å³
包络直径 envelope_diameter	236.3 Å
壳层 Rg shell_rg	48.57 Å
包络 Rg envelope_rg	69.07 Å
形状 Rg shape_rg	67.82 Å
总 Rg total_rg	66.62 Å
总原子数 total_atoms	8236
残基数 n_residues	1010
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	220.3 Å
Rg (实空间) rg_real	67.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.73 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9230e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.1120e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	64.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	191200000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6562
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	36.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.478
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.657
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0003
最高正则化参数 α highest_alpha	6097000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.358; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.266; Smooth: 0.190

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25
分子量 formula_weight	36351.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8258

MIKDPRPLNDKAFIQQCIRQLCEFLTENGYAHNVSMKSLQAPSVKDFLKIFTFLYGFLCPSYELPDTKFEEEVPRIFKDLGYPFALSKSSMYTVGAPHTWPHIVAALVWLIDCIKIHTAMKESSPLFDDGQPWGEETEDGIMHNKLFLDYTIKCYESFMSGADSFDEMNAELQSKLKDLFNVDAFKLESLEAKNRALNEQIARLEQERSTANKANAERLKRLQKSADLYKDRLGLEIRKIYGEKLQFIFTNIDPKNPESPFMFSLHLNEARDYEVSDSAPHLEGLAEFQENVRKTNNFSAFLANVRKAFTATVYQ

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24
分子量 formula_weight	28993.4 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GPLGSMETLSFPRYNVAEIVIHIRNKILTGADGKNLTKNDLYPNPKPEVLHMIYMRALQIVYGIRLEHFYMMPVNSGVMYPHLMEGFLPFSNLVTHLDSFLPICRVNDFETADILCPKAKRTSRFLSGIINFIHFREACRETYMEFLWQYKSSADKMQQLNAAHQEALMKLERLEKEVDEDTTVTIPSAVYVAQLYHQVSKIEWEYECEPGMVKGIHHGPSVAQPIHLDSTQLSRKFISDYLWSLVDTEW

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHENOL
分子量 formula_weight	94.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	22

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2ve7A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	418 — Actin-binding Protein, T-fimbrin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Ncd80 complex, Ncd80 subunit

结构域编号 domain_id	2ve7A02
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	2ve7B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	418 — Actin-binding Protein, T-fimbrin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Ncd80 complex, Ncd80 subunit

结构域编号 domain_id	2ve7C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	418 — Actin-binding Protein, T-fimbrin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ncd80 complex, Nuf2 subunit

结构域编号 domain_id	2ve7C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — Ncd80 complex, Spc24 subunit

结构域编号 domain_id	2ve7D01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	418 — Actin-binding Protein, T-fimbrin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ncd80 complex, Nuf2 subunit

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	157.653 Å
晶胞边长 b length_b	248.965 Å
晶胞边长 c length_c	58.250 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.880 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2340
R_work r_work	0.2320
R_free r_free	0.2610

fit	/app/data/saxs_computation/ve/2ve7/2ve7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ve/2ve7/2ve7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ve/2ve7/2ve7.dat

Crystal structure of a bonsai version of the human Ndc80 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

KINETOCHORE PROTEIN NUF2, KINETOCHORE PROTEIN SPC24

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)