SACCHAROMYCES KLUYVERI
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | GLYCINE × 6 ZINC ION × 3 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | GLYCINE × 10 ZINC ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q96W94_SACKL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–454； UniProt 2–455 作者链 B； PDB构建体 1–454； UniProt 2–455 作者链 C； PDB构建体 1–454； UniProt 2–455 作者链 D； PDB构建体 1–454； UniProt 2–455 |
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| 条目编号 entry_id | 2vl1 |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-01-07 |
| 结构标题 title | Crystal structure of beta-alanine synthase from Saccharomyces kluyveri in complex with a gly-gly peptide |
| 关键词 keywords | HYDROLASE, DI-ZINC CENTER, AMIDOHYDROLASE, ALPHA AND BETA PROTEIN, COMPLEX WITH GLYCINE-GLYCINE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 33.84 Å |
| Rg（电子密度） | 33.88 Å |
| 总 Rg | 34.16 Å |
| 原子数 | 6738 |
| 残基数 | 863 |
| 排除体积 | 118790 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 360 — |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1B01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1B02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 360 — |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1C01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1C02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 360 — |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1D01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |
| 结构域编号 domain_id | 2vl1D02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 360 — |