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2vq0

Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 88.4 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COAT PROTEIN

SESBANIA MOSAIC VIRUS

UniProt Q9EB06

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 180 PDB 声明：180-MERIC（180） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–47 链 A； UniProt 60–268 链 B； UniProt 1–47 链 B； UniProt 60–268 链 C； UniProt 1–47 链 C； UniProt 60–268 片段：RESIDUES 1-47,60-268 CA CALCIUM ION × 180 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP 分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–47 链 A； UniProt 60–268 链 B； UniProt 1–47 链 B； UniProt 60–268 链 C； UniProt 1–47 链 C； UniProt 60–268 片段：RESIDUES 1-47,60-268 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP 分辨率 3.60 Å R-free 0.258
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–47 链 A； UniProt 60–268 链 B； UniProt 1–47 链 B； UniProt 60–268 链 C； UniProt 1–47 链 C； UniProt 60–268 片段：RESIDUES 1-47,60-268 CA CALCIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP 分辨率 3.60 Å R-free 0.258
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–47 链 A； UniProt 60–268 链 B； UniProt 1–47 链 B； UniProt 60–268 链 C； UniProt 1–47 链 C； UniProt 60–268 片段：RESIDUES 1-47,60-268 CA CALCIUM ION × 18 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP 分辨率 3.60 Å R-free 0.258
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–47 链 A； UniProt 60–268 链 B； UniProt 1–47 链 B； UniProt 60–268 链 C； UniProt 1–47 链 C； UniProt 60–268 片段：RESIDUES 1-47,60-268 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP 分辨率 3.60 Å R-free 0.258

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2VQ0 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 240 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 5–267（263 aa）
链 B 5–267（263 aa）
链 C 5–267（263 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 80 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 66–268（203 aa） 片段：residues 66-268
突变：D146N/D149N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 37–268（232 aa） 片段：residues 37-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 180 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 180 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 90 PDB 声明：90-meric
链 A 1–268（268 aa）
链 B 1–268（268 aa）
链 C 1–268（268 aa）
突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A CA CALCIUM ION × 90 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 32–268（237 aa） 片段：residues 32-268
未记录 CA CALCIUM ION × 60 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–268（203 aa） 片段：RESIDUES 66-268
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000
分辨率 2.65 Å R-free 0.294
2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 66–268（203 aa） 片段：RESIDUES 66-268
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000
分辨率 2.65 Å R-free 0.294
4Y4Y T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (C2 crystal form) 提交 2015-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 B 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 C 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 D 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 E 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 F 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 G 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 H 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 I 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 J 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 K 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 L 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 M 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 N 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 O 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 P 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Q 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 R 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 S 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 T 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 U 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 V 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 W 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 X 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Y 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Z 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 a 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 b 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 c 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 d 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
未记录 SO4 SULFATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-20% PEG 4000, 5% Iso-propanol, 100 mM Sodium citrate
分辨率 3.00 Å R-free 0.200
4Y5Z T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form) 提交 2015-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 0 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 1 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 2 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 3 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 4 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 5 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 6 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 7 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 A 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 B 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 C 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 D 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 E 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 F 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 G 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 H 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 I 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 J 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 K 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 L 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 M 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 N 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 O 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 P 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Q 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 R 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 S 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 T 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 U 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 V 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 W 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 X 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Y 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Z 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 a 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 b 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 c 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 d 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 e 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 f 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 g 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 h 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 i 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 j 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 k 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 l 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 m 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 n 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 o 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 p 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 q 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 r 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 s 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 t 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 u 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 v 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 w 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 x 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 y 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 z 66–268（203 aa） 片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
未记录 SO4 SULFATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；15-25% PEG 400, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES
分辨率 2.95 Å R-free 0.249

共 10 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9EB06_9VIRU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–47； UniProt 1–47 作者链 A； PDB构建体 48–256； UniProt 60–268 作者链 B； PDB构建体 1–47； UniProt 1–47 作者链 B； PDB构建体 48–256； UniProt 60–268 作者链 C； PDB构建体 1–47； UniProt 1–47 作者链 C； PDB构建体 48–256； UniProt 60–268

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2vq0

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2vq0
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2vq0
沉积日期 deposition_date2008-03-10
结构标题 titleCapsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59)
关键词 keywordsCAPSID PROTEIN, SESBANIA MOSAIC VIRUS, VIRION, BETA-ANNULUS, COAT PROTEIN, VIRUS ASSEMBLY, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.28 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.16 Å
零角强度 I(0) i064329200.00
分子量 molecular_weight63432.0 kDa
排除体积 excluded_volume79525 ų
包络体积 envelope_volume94140 ų
水化壳体积 shell_volume29648 ų
包络直径 envelope_diameter92.5 Å
壳层 Rg shell_rg33.69 Å
包络 Rg envelope_rg27.73 Å
形状 Rg shape_rg27.16 Å
总 Rg total_rg27.82 Å
总原子数 total_atoms4454
残基数 n_residues606
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax88.4 Å
Rg (实空间) rg_real28.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.58 Å
I(0) (实空间) i0_real6.4330e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0330e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.29 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal64330000.0000
解质量估计 total_estimate0.9056
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary30.0 Å
偏度 Skewness skewness0.290
峰度 Kurtosis kurtosis-0.607
角度范围 angular_range— – 0.2800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha8152000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.955; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.927
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2vq0a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP
结构域编号 domain_idd2vq0b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP
结构域编号 domain_idd2vq0c1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2vq0A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2vq0B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2vq0C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)