SAXSdb — 2wj8

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NUCLEOPROTEIN

HUMAN RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS A STRAIN LONG

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	同源多聚体	蛋白 10 RNA 10	;RNA (5'-R(CPCPCPCPCPC)-3') ; × 10 BORATE ION × 6 water × 10	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	同源多聚体	蛋白 10 RNA 10	;RNA (5'-R(CPCPCPCPCPC)-3') ; × 10 BORATE ION × 6 water × 10	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NCAP_HRSVA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 B； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 C； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 D； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 E； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 F； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 G； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 H； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 I； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 J； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 K； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 L； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 M； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 N； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 O； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 P； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 Q； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 R； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 S； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 T； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2wj8
沉积日期 deposition_date	2009-05-25
结构标题 title	Respiratory Syncitial Virus RiboNucleoProtein
关键词 keywords	;RNA BINDING PROTEIN RNA COMPLEX, NUCLEOCAPSID (N), RIBONUCLEOPROTEIN, RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS (RSV), VIRAL NUCLEOPROTEIN, TEMPLATE-LIKE ASSEMBLY, RNA, VIRION, COMPLEX, CYTOPLASM, RNA BINDING PROTEIN, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex ;; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2wj8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2wj8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2wj8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	58.66 Å
Rg（电子密度）	58.06 Å
总 Rg	58.43 Å
原子数	30640
残基数	3822
排除体积	543420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2wj8__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2wj8__assembly_2__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NUCLEOPROTEIN
分子量 formula_weight	43507.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	20

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T
原子数 atom_count	61928

MALSKVKLNDTLNKDQLLSSSKYTIQRSTGDSIDTPNYDVQKHINKLCGMLLITEDANHKFTGLIGMLYAMSRLGREDTIKILRDAGYHVKANGVDVTTHRQDINGKEMKFEVLTLASLTTEIQINIEIESRKSYKKMLKEMGEVAPEYRHDSPDCGMIILCIAALVITKLAAGDRSGLTAVIRRANNVLKNEMKRYKGLLPKDIANSFYEVFEKHPHFIDVFVHFGIAQSSTRGGSRVEGIFAGLFMNAYGAGQVMLRWGVLAKSVKNIMLGHASVQAEMEQVVEVYEYAQKLGGEAGFYHILNNPKASLLSLTQFPHFSSVVLGNAAGLGIMGEYRGTPRNQDLYDAAKAYAEQLKENGVINYSVLDLTAEELEAIKHQLNPKDNDVEL

来源 Source

来源生物 organism	HUMAN RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS A STRAIN LONG
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11260
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;RNA (5'-R(CPCPCPCPCPC)-3') ;
分子量 formula_weight	2091.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	20

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t

CCCCCCC

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	BORATE ION
分子量 formula_weight	78.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	685

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晶胞边长 a length_a	218.200 Å
晶胞边长 b length_b	220.990 Å
晶胞边长 c length_c	218.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.09 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	80

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.290 Å
最低分辨率 resolution_low	79.180 Å
R 因子 r_factor	0.2057
R_work r_work	0.2050
R_free r_free	0.2258

Respiratory Syncitial Virus RiboNucleoProtein

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NUCLEOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wj8__assembly_1__model_1

2wj8__assembly_1__model_1 | I(q)

2wj8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (2)

Respiratory Syncitial Virus RiboNucleoProtein

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NUCLEOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wj8__assembly_1__model_1

2wj8__assembly_1__model_1 | I(q)

2wj8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (2)