SAXSdb — 2wnv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B × 1 （P02746） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C × 1 （P02747） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B × 1 （P02746） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C × 1 （P02747） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1QA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–134； UniProt 112–245 作者链 D； PDB构建体 1–134； UniProt 112–245

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B

物种未注明

UniProt P02746

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A × 1 （P02745） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C × 1 （P02747） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A × 1 （P02745） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C × 1 （P02747） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1QB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–136； UniProt 116–251 作者链 E； PDB构建体 1–136； UniProt 116–251

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C

物种未注明

UniProt P02747

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A × 1 （P02745） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B × 1 （P02746） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A × 1 （P02745） COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B × 1 （P02746） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1QC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–131； UniProt 115–245 作者链 F； PDB构建体 1–131； UniProt 115–245

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2wnv
沉积日期 deposition_date	2009-07-20
结构标题 title	Complex between C1q globular heads and deoxyribose
关键词 keywords	;IMMUNE SYSTEM, C1Q, SECRETED, COLLAGEN, COMPLEMENT, RECOGNITION, DISULFIDE BOND, INNATE IMMUNITY, IMMUNE RESPONSE, PYRROLIDONE CARBOXYLIC ACID, DISEASE MUTATION, COMPLEMENT PATHWAY, GLYCOPROTEIN, HYDROXYLATION ;; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2wnv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2wnv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2wnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.75 Å
Rg（电子密度）	19.36 Å
总 Rg	20.40 Å
原子数	3085
残基数	393
排除体积	54801 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2wnv__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2wnv__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A
分子量 formula_weight	14985.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	7548

QPRPAFSAIRRNPPMGGNVVIFDTVITNQEEPYQNHSGRFVCTVPGYYYFTFQVLSQWEICLSIVSSSRGQVRRSLGFCDTTNKGLFQVVSGGMVLQLQQGDQVWVEKDPKKGHIYQGSEADSVFSGFLIFPSA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B
分子量 formula_weight	15398.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

ATQKIAFSATRTINVPLRRDQTIRFDHVITNMNNNYEPRSGKFTCKVPGLYYFTYHASSRGNLCVNLMRGRERAQKVVTFCDYAYNTFQVTTGGMVLKLEQGENVFLQATDKNSLLGMEGANSIFSGFLLFPDMEA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C
分子量 formula_weight	14559.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

KQKFQSVFTVTRQTHQPPAPNSLIRFNAVLTNPQGDYDTSTGKFTCKVPGLYYFVYHASHTANLCVLLYRSGVKVVTFCGHTSKTNQVNSGGVLLRLQVGEEVWLAVNDYYDMVGIQGSDSVFSGFLLFPD

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose
分子量 formula_weight	134.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1054

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2wnva_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

结构域编号 domain_id	d2wnvb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

结构域编号 domain_id	d2wnvc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

结构域编号 domain_id	d2wnvd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

结构域编号 domain_id	d2wnve_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

结构域编号 domain_id	d2wnvf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.22 — TNF-like
超家族 Superfamily superfamily	b.22.1 — TNF-like
家族 Family family	b.22.1.1 — TNF-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2wnvA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	2wnvB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	2wnvC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	2wnvD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	2wnvE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	2wnvF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

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晶胞边长 a length_a	48.350 Å
晶胞边长 b length_b	48.330 Å
晶胞边长 c length_c	88.060 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	92.39 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	113.57 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.250 Å
最低分辨率 resolution_low	19.710 Å
R 因子 r_factor	0.1763
R_work r_work	0.1750
R_free r_free	0.2018

Complex between C1q globular heads and deoxyribose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wnv__assembly_1__model_1

2wnv__assembly_1__model_1 | I(q)

2wnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Complex between C1q globular heads and deoxyribose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COMPLEMENT C1Q SUBCOMPONENT SUBUNIT C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2wnv__assembly_1__model_1

2wnv__assembly_1__model_1 | I(q)

2wnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)