SAXSdb — 2xcg

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Amine oxidase [flavin-containing] B

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	;[[(2R,3S,4S)-5-[(4AS)-7,8-DIMETHYL-2,4-DIOXO-4A,5-DIHYDROBENZO[G]PTERIDIN-10-YL]-2,3,4-TRIHYDROXY-PENTOXY]-HYDROXY-PHOSPHORYL] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL HYDROGEN PHOSPHATE ; × 2 3-PHENYLPROPANAL × 2 2-(2-BENZOFURANYL)-2-IMIDAZOLINE × 2 N-DODECYL-N,N-DIMETHYL-3-AMMONIO-1-PROPANESULFONATE × 2 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	;[[(2R,3S,4S)-5-[(4AS)-7,8-DIMETHYL-2,4-DIOXO-4A,5-DIHYDROBENZO[G]PTERIDIN-10-YL]-2,3,4-TRIHYDROXY-PENTOXY]-HYDROXY-PHOSPHORYL] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL HYDROGEN PHOSPHATE ; × 4 3-PHENYLPROPANAL × 4 2-(2-BENZOFURANYL)-2-IMIDAZOLINE × 4 N-DODECYL-N,N-DIMETHYL-3-AMMONIO-1-PROPANESULFONATE × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AOFB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–520； UniProt 1–520 作者链 B； PDB构建体 1–520； UniProt 1–520

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xcg
沉积日期 deposition_date	2010-04-23
结构标题 title	Tranylcypromine-inhibited human monoamine oxidase B in complex with 2- (2-benzofuranyl)-2-imidazoline
关键词 keywords	FLAVOPROTEIN, MAOB, MITOCHONDRION, OXIDOREDUCTASE, TRANSMEMBRANE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xcg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xcg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xcg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.46 Å
Rg（电子密度）	29.77 Å
总 Rg	30.50 Å
原子数	8112
残基数	993
排除体积	145150 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xcg__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2xcg__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Amine oxidase [flavin-containing] B
分子量 formula_weight	58837.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.3.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8914

MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDRVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSYVGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWRTMDDMGREIPSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQTRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEERLKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDRIYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTTFLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Komagataella pastoris

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;[[(2R,3S,4S)-5-[(4AS)-7,8-DIMETHYL-2,4-DIOXO-4A,5-DIHYDROBENZO[G]PTERIDIN-10-YL]-2,3,4-TRIHYDROXY-PENTOXY]-HYDROXY-PHOSPHORYL] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL HYDROGEN PHOSPHATE ;
分子量 formula_weight	787.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3-PHENYLPROPANAL
分子量 formula_weight	134.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-(2-BENZOFURANYL)-2-IMIDAZOLINE
分子量 formula_weight	184.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	N-DODECYL-N,N-DIMETHYL-3-AMMONIO-1-PROPANESULFONATE
分子量 formula_weight	336.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	754

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d2xcga1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2xcga2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family family	d.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

结构域编号 domain_id	d2xcgb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2xcgb2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family family	d.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2xcgA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	2xcgA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2xcgA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	405 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor, domain 1

结构域编号 domain_id	2xcgB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	2xcgB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2xcgB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	405 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor, domain 1

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晶胞边长 a length_a	131.893 Å
晶胞边长 b length_b	223.706 Å
晶胞边长 c length_c	86.716 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	21
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	46.980 Å
R 因子 r_factor	0.1560
R_work r_work	0.1551
R_free r_free	0.1894

Tranylcypromine-inhibited human monoamine oxidase B in complex with 2- (2-benzofuranyl)-2-imidazoline

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Amine oxidase [flavin-containing] B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xcg__assembly_1__model_1

2xcg__assembly_1__model_1 | I(q)

2xcg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Tranylcypromine-inhibited human monoamine oxidase B in complex with 2- (2-benzofuranyl)-2-imidazoline

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Amine oxidase [flavin-containing] B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xcg__assembly_1__model_1

2xcg__assembly_1__model_1 | I(q)

2xcg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)