SAXSdb — 2xcm

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90

HORDEUM VULGARE

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	SGT1-LIKE PROTEIN × 1 （Q84LL4） RAR1 × 1 （Q9FLI9） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	SGT1-LIKE PROTEIN × 1 （Q84LL4） RAR1 × 1 （Q9FLI9） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7XJ80_HORVU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–213； UniProt 2–210 作者链 B； PDB构建体 5–213； UniProt 2–210

SGT1-LIKE PROTEIN

ARABIDOPSIS THALIANA

UniProt Q84LL4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90 × 1 （Q7XJ80） RAR1 × 1 （Q9FLI9） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90 × 1 （Q7XJ80） RAR1 × 1 （Q9FLI9） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q84LL4_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–92； UniProt 73–164 作者链 D； PDB构建体 1–92； UniProt 73–164

RAR1

ARABIDOPSIS THALIANA

UniProt Q9FLI9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90 × 1 （Q7XJ80） SGT1-LIKE PROTEIN × 1 （Q84LL4） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90 × 1 （Q7XJ80） SGT1-LIKE PROTEIN × 1 （Q84LL4） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9FLI9_ARATH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 2–74； UniProt 149–221 作者链 F； PDB构建体 2–74； UniProt 149–221

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2xcm
沉积日期 deposition_date	2010-04-23
结构标题 title	COMPLEX OF HSP90 N-TERMINAL, SGT1 CS AND RAR1 CHORD2 DOMAIN
关键词 keywords	CHAPERONE-PROTEIN BINDING COMPLEX, STRESS RESPONSE; CHAPERONE/PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xcm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xcm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xcm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.02 Å
Rg（电子密度）	29.38 Å
总 Rg	29.85 Å
原子数	3034
残基数	379
排除体积	53897 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2xcm__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2xcm__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90
分子量 formula_weight	23942.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6330

HHAAATETETFAFQAEINQLLSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRFESLTDKSKLDAQPELFIHIIPDKATSTLTIVDSGIGMTKSDLVNNLGTIARSGTKEFMEALAAGADVSMIGQFGVGFYSAYLVAERVVVTTKHNDDEQYVWESQAGGSFTVTRDTSGEQLGRGTKMVLYLKDDQMEYLEERRIKDLVKKHSEFISYPISLWA

来源 Source

来源生物 organism	HORDEUM VULGARE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4513
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SGT1-LIKE PROTEIN
分子量 formula_weight	10541.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

AKYRHEYYQKPEEVVVTVFAKGIPKQNVNIDFGEQILSVVIEVPGEDAYYLQPRLFGKIIPDKCKYEVLSTKIEICLAKADIITWASLEHGK

来源 Source

来源生物 organism	ARABIDOPSIS THALIANA
通用名 common_name	THALE CRESS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	RAR1
分子量 formula_weight	8407.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

AAVIDINQPQVCKNKGCGQTFKERDNHETACSHHPGPAVFHDRLRGWKCCDVHVKEFDEFMEIPPCTKGWHSSS

来源 Source

来源生物 organism	ARABIDOPSIS THALIANA
通用名 common_name	THALE CRESS
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	270

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2xcma1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.1 — Heat shock protein 90, HSP90, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2xcma2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2xcmb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.1 — Heat shock protein 90, HSP90, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2xcmb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2xcmc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.15 — HSP20-like chaperones
超家族 Superfamily superfamily	b.15.1 — HSP20-like chaperones
家族 Family family	b.15.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2xcmd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.15 — HSP20-like chaperones
超家族 Superfamily superfamily	b.15.1 — HSP20-like chaperones
家族 Family family	b.15.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2xcmA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2xcmB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2xcmC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	790 —

结构域编号 domain_id	2xcmD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	790 —

▶

晶胞边长 a length_a	88.890 Å
晶胞边长 b length_b	88.890 Å
晶胞边长 c length_c	117.820 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32
空间群编号 int_tables_number	145
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	46.780 Å
R 因子 r_factor	0.2000
R_work r_work	0.1980
R_free r_free	0.2420

COMPLEX OF HSP90 N-TERMINAL, SGT1 CS AND RAR1 CHORD2 DOMAIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SGT1-LIKE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RAR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xcm__assembly_1__model_1

2xcm__assembly_1__model_1 | I(q)

2xcm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

COMPLEX OF HSP90 N-TERMINAL, SGT1 CS AND RAR1 CHORD2 DOMAIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CYTOSOLIC HEAT SHOCK PROTEIN 90

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SGT1-LIKE PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RAR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2xcm__assembly_1__model_1

2xcm__assembly_1__model_1 | I(q)

2xcm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)