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2xpj

Crystal structure of Physalis Mottle Virus with intact ordered RNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COAT PROTEIN

物种未注明

UniProt P36351

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 180 RNA 60 5'-R(CP*CP*CP)-3' × 60 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 3 RNA 1 5'-R(CP*CP*CP)-3' × 1 与全部聚合物一致
3 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 15 RNA 5 5'-R(CP*CP*CP)-3' × 5 与全部聚合物一致
4 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 18 RNA 6 5'-R(CP*CP*CP)-3' × 6 与全部聚合物一致
5 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 3 RNA 1 5'-R(CP*CP*CP)-3' × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1e57 1e57 1e57 1e57 1e57 1e57 1qjz 1qjz 1qjz 1qjz 1qjz 2wws

共 17 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
2xpj 2xpj 2xpj 2xpj 2xpj

共 5 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_PHMV
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 B； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 C； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2xpj
沉积日期 deposition_date2010-08-26
结构标题 titleCrystal structure of Physalis Mottle Virus with intact ordered RNA
关键词 keywordsVIRUS, PLANT RNA VIRUS; VIRUS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2xpj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2xpj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2xpj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）129.20 Å
总 Rg129.10 Å
原子数240060
残基数31980
排除体积4324900 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2xpj__assembly_1__model_1 240-MERIC （240） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2xpj__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 2xpj__assembly_3__model_1 eicosameric （20） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 2xpj__assembly_4__model_1 24-meric （24） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 2xpj__assembly_5__model_1 tetrameric （4） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id2xpjA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2xpjB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2xpjC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
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7. 引用文献 (1)