2xy9

Human Angiotensin converting enzyme in complex with phosphinic tripeptide

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 78.4 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME

HOMO SAPIENS

UniProt P12821

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 71–654 片段:RESIDUES 71-654 ;beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 3ES [(2S)-2-({3-[HYDROXYL(2-PHENYL-(1R)-1-{[(BENZYLOXY)[(2S)-2-({3-[HYDROXYL(2-PHENYL-(1R)-1-CARBONYL]-AMINO}ETHYL)PHOSPHINYL]-2-[(3-PHENYLISOXAZOL-5-YL)METHYL]-1-OXO-PROPYL}AMINO)-3-(4-HYDROXY-PHENYL) × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 4.7;13.5% PEG4000,50MM SODIUM ACETATE, PH 4.7 AND 0.01MM ZNSO4 分辨率 1.97 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 89 个其他 PDB 条目、150 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–584; UniProt 71–654

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2xy9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2xy9
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2xy9
沉积日期 deposition_date2010-11-16
结构标题 titleHuman Angiotensin converting enzyme in complex with phosphinic tripeptide
关键词 keywordsHYDROLASE, ZINC METALLOPROTEASE, METALLOPEPTIDASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.89
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.61
零角强度 I(0) i077561200.00
分子量 molecular_weight69850.0 kDa
排除体积 excluded_volume87490 ų
包络体积 envelope_volume100100 ų
水化壳体积 shell_volume33671 ų
包络直径 envelope_diameter82.5
壳层 Rg shell_rg32.38
包络 Rg envelope_rg23.91
形状 Rg shape_rg23.58
总 Rg total_rg24.61
总原子数 total_atoms4925
残基数 n_residues581
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax78.4
Rg (实空间) rg_real24.72
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36
I(0) (实空间) i0_real7.7560e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0660e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.76
I(0) (倒空间) i0_reciprocal77560000.0000
解质量估计 total_estimate0.6703
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.4
偏度 Skewness skewness0.188
峰度 Kurtosis kurtosis-0.358
角度范围 angular_range— – 0.3200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha26580000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.871; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.036; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.996

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2xy9a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.5 — Neurolysin-like
结构域编号 domain_idd2xy9a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)