2z3r

Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 143.0 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-15

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261） GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 49–162	未记录	Interleukin-15 receptor alpha chain × 1 （Q13261） GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2Z3R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2XQB Crystal Structure of anti-IL-15 Antibody in Complex with human IL-15 提交 2010-09-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 49–162（114 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9.5；PCTP 100MM, PH 9.5, 25 %W/V PEG-3350, 200MM AMMONIUM SULPHATE	分辨率 2.60 Å R-free 0.318
2Z3Q Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex 提交 2007-06-05	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 49–162（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å R-free 0.252
2Z3Q Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex 提交 2007-06-05	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 49–162（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å R-free 0.252
4GS7 Structure of the Interleukin-15 quaternary complex 提交 2012-08-27	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 49–162（114 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；298 K；22.5% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS propane, 0.2M sodium acetate, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.227

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL15_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 C； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 E； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 G； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 I； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 K； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 M； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162 作者链 O； PDB构建体 6–119； UniProt 49–162

Interleukin-15 receptor alpha chain

Homo sapiens

UniProt Q13261

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933） GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 31–132	片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	Interleukin-15 × 1 （P40933） GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.250

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2Z3R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2ERS Solution structure of the Interleukin-15 receptor sushi domain 提交 2005-10-25	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–96（66 aa）片段：sushi domain of the Interleukin-15 receptor	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1 mM Il-15 receptor sushi domian 15N,13C; 20mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 7% D2O; pH = 7.4 \| 20mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 7% D2O; pH = 7.4p	分辨率未提供
2Z3Q Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex 提交 2007-06-05	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 31–132（102 aa）片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å R-free 0.252
2Z3Q Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex 提交 2007-06-05	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 31–132（102 aa）片段：IL-15Ra, residues in database 31-132	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å R-free 0.252
4GS7 Structure of the Interleukin-15 quaternary complex 提交 2012-08-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 30–97（68 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；298 K；22.5% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS propane, 0.2M sodium acetate, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.227

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I15RA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 D； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 F； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 H； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 J； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 L； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 N； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132 作者链 P； PDB构建体 6–107； UniProt 31–132

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2z3r
沉积日期 deposition_date	2007-06-05
结构标题 title	Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex
关键词 keywords	Protein-Protein complex, CYTOKINE-CYTOKINE RECEPTOR COMPLEX; CYTOKINE/CYTOKINE RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.87 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.39 Å
零角强度 I(0) i0	446975000.00
分子量 molecular_weight	171740.0 kDa
排除体积 excluded_volume	214530 Å³
包络体积 envelope_volume	321980 Å³
水化壳体积 shell_volume	62733 Å³
包络直径 envelope_diameter	147.3 Å
壳层 Rg shell_rg	47.54 Å
包络 Rg envelope_rg	42.27 Å
形状 Rg shape_rg	43.38 Å
总 Rg total_rg	43.64 Å
总原子数 total_atoms	11998
残基数 n_residues	1534
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	143.0 Å
Rg (实空间) rg_real	43.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.05 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.4700e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.6380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	447000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8663
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	55.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.249
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.306
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	27920000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.805; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.846

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Interleukin-15
分子量 formula_weight	13258.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O
原子数 atom_count	12517

AMAISNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Interleukin-15 receptor alpha chain
分子量 formula_weight	11496.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

AMAISITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSTVTTAGVTPQPESLSPSGKEPAAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	519

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (32 domains)

结构域编号 domain_id	d2z3ra2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3ra3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rb2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rb3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rc2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3rc3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rd2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rd3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3re2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3re3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rf2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rf3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rg2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3rg3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rh2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rh3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3ri2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3ri3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rj2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rj3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rk2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3rk3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rl2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rl3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rm2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3rm3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rn2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rn3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3ro2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d2z3ro3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d2z3rp2
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamily	g.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family family	g.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

结构域编号 domain_id	d2z3rp3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	2z3rA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rF01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rJ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rM00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rN01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

结构域编号 domain_id	2z3rO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	2z3rP01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	81.800 Å
晶胞边长 b length_b	127.035 Å
晶胞边长 c length_c	191.331 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	30.930 Å
R 因子 r_factor	0.2061
R_work r_work	0.2050
R_free r_free	0.2499

Crystal structure of the IL-15/IL-15Ra complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Interleukin-15 receptor alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (32 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/z3/2z3r/2z3r.fit
pddf	/app/data/pr_computation/z3/2z3r/2z3r.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/z3/2z3r/2z3r.dat