SAXSdb — 3ajc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein fliG

Thermotoga maritima

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 104–335	片段：FliG MC domain, UNP residues 104-335 突变：deletion of UNP residues 170-172	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；50% PEG 200, 0.1M Phospho-Citrate, 0.2M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3AJC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1LKV Crystal Structure of the Middle and C-terminal Domains of the Flagellar Rotor Protein FliG 提交 2002-04-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 104–335（232 aa）片段：RESIDUES 104-335	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；Isopropanol, CaCl2, sodium acetate, pluronic F-68, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1LKV Crystal Structure of the Middle and C-terminal Domains of the Flagellar Rotor Protein FliG 提交 2002-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 X 104–335（232 aa）片段：RESIDUES 104-335	未记录	CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；Isopropanol, CaCl2, sodium acetate, pluronic F-68, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1QC7 T. MARITIMA FLIG C-TERMINAL DOMAIN 提交 1999-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 235–335（101 aa）片段：FLIG-C 链 B 235–335（101 aa）片段：FLIG-C	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；286 K；ISOPROPANOL, pH 5.2, temperature 286K	分辨率 2.20 Å R-free 0.304
3SOH Architecture of the Flagellar Rotor 提交 2011-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 117–193（77 aa）片段：middle domain (UNP residues 117-193)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；0.1 M MES, pH 6.5, 10% dioxane, 1.6 M ammonium sulfate, EVAPORATION	分辨率 3.50 Å R-free 0.301
3SOH Architecture of the Flagellar Rotor 提交 2011-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 117–193（77 aa）片段：middle domain (UNP residues 117-193)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；0.1 M MES, pH 6.5, 10% dioxane, 1.6 M ammonium sulfate, EVAPORATION	分辨率 3.50 Å R-free 0.301
4FHR Crystal structure of the complex between the flagellar motor proteins FliG and FliM. 提交 2012-06-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 115–327（213 aa）片段：Middle and C-terminal domains. UNP residues 115-327	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；50 mM calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.0, and 25% v/v MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.93 Å R-free 0.243
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
4QRM crystal structure of a binary complex of FliM-FliG middle domains from T.maritima 提交 2014-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 117–187（71 aa）片段：Middle domain, Chain B, D, F, H, J, L, N, P, R, T, V	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.2 M sodium acetate trihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 4.32 Å R-free 0.291
5TDY Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima 提交 2016-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–98（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Wild Type: 100 mM HEPES pH 7.5, 25% (w/v) PEG3000, 200 mM sodium chloride Selenomethionine: 100 mm imidazole pH 7.2, 30% (w/v) PEG8000, 130 mM sodium chloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.217
5TDY Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima 提交 2016-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–98（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Wild Type: 100 mM HEPES pH 7.5, 25% (w/v) PEG3000, 200 mM sodium chloride Selenomethionine: 100 mm imidazole pH 7.2, 30% (w/v) PEG8000, 130 mM sodium chloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.217
5TDY Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima 提交 2016-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–98（98 aa）链 D 1–98（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Wild Type: 100 mM HEPES pH 7.5, 25% (w/v) PEG3000, 200 mM sodium chloride Selenomethionine: 100 mm imidazole pH 7.2, 30% (w/v) PEG8000, 130 mM sodium chloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.217
5TDY Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima 提交 2016-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–98（98 aa）链 D 1–98（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Wild Type: 100 mM HEPES pH 7.5, 25% (w/v) PEG3000, 200 mM sodium chloride Selenomethionine: 100 mm imidazole pH 7.2, 30% (w/v) PEG8000, 130 mM sodium chloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.217

共 6 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIG_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–229； UniProt 104–335

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3ajc
沉积日期 deposition_date	2010-05-27
结构标题 title	Structure of the MC domain of FliG (PEV), a CW-biased mutant
关键词 keywords	chemotaxis, flagellum, flagellar motor, structural protein; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.33 Å
零角强度 I(0) i0	9864710.00
分子量 molecular_weight	23892.0 kDa
排除体积 excluded_volume	30286 Å³
包络体积 envelope_volume	38192 Å³
水化壳体积 shell_volume	16377 Å³
包络直径 envelope_diameter	67.1 Å
壳层 Rg shell_rg	25.80 Å
包络 Rg envelope_rg	20.38 Å
形状 Rg shape_rg	20.34 Å
总 Rg total_rg	21.16 Å
总原子数 total_atoms	1678
残基数 n_residues	210
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	68.2 Å
Rg (实空间) rg_real	21.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.46 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.8650e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2790e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	9865000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8967
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	22.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.293
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.516
角度范围 angular_range	— – 0.3750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1606000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.902; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.982

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3ajca_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.14 — FliG
家族 Family family	a.118.14.1 — FliG

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3ajcA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Flagellar motor switch protein FliG, alpha-alpha superhelical domain

结构域编号 domain_id	3ajcA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Flagellar motor switch protein FliG, alpha-alpha superhelical domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	93.150 Å
晶胞边长 b length_b	93.150 Å
晶胞边长 c length_c	48.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 62
空间群编号 int_tables_number	171
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	33.560 Å
R 因子 r_factor	0.2240
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	0.2400

描述 description	Flagellar motor switch protein fliG
分子量 formula_weight	26047.2 kDa
突变 mutation	deletion of UNP residues 170-172
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1792

Structure of the MC domain of FliG (PEV), a CW-biased mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein fliG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2336
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	114

fit	/app/data/saxs_computation/aj/3ajc/3ajc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/aj/3ajc/3ajc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/aj/3ajc/3ajc.dat