SAXSdb — 3cgn

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

Thermus thermophilus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–149	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；286 K；100mM MES, pH6.5, 1.6M Na/K-Tartrate, 26mg/ml, 1:1 mixing, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K	分辨率 2.70 Å R-free 0.257
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–149	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；286 K；100mM MES, pH6.5, 1.6M Na/K-Tartrate, 26mg/ml, 1:1 mixing, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K	分辨率 2.70 Å R-free 0.257

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3CGN	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3CGM Crystal structure of thermophilic SlyD 提交 2008-03-06	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	SCN THIOCYANATE ION × 6 NI NICKEL (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；286 K；60mg/ml protein, 1:1 mixing, 2M Ammonium sulfate, 2% PEG 400, 1% Thiocyanate, 100mM HEPES, pH7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K	分辨率 2.41 Å R-free 0.226
3CGM Crystal structure of thermophilic SlyD 提交 2008-03-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	SCN THIOCYANATE ION × 36 NI NICKEL (II) ION × 6 GOL GLYCEROL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；286 K；60mg/ml protein, 1:1 mixing, 2M Ammonium sulfate, 2% PEG 400, 1% Thiocyanate, 100mM HEPES, pH7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K	分辨率 2.41 Å R-free 0.226
3LUO Crystal Structure and functional characterization of the thermophilic prolyl isomerase and chaperone SlyD 提交 2010-02-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10MG/ML N-SUC-ALA-LEU-PRO-PHE-PNA, 2M AMMONIUM SULFATE, 5 % PEG 400, 100MM MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.55 Å R-free 0.235
3LUO Crystal Structure and functional characterization of the thermophilic prolyl isomerase and chaperone SlyD 提交 2010-02-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10MG/ML N-SUC-ALA-LEU-PRO-PHE-PNA, 2M AMMONIUM SULFATE, 5 % PEG 400, 100MM MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.55 Å R-free 0.235
4ODK Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with T1 peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；13.2% PEG1500, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.05 M sodium chloride, 11% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.40 Å R-free 0.167
4ODL Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2 peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.92 Å R-free 0.224
4ODL Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2 peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.92 Å R-free 0.224
4ODM Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；19% PEG3350, 8% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.208
4ODM Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；19% PEG3350, 8% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.208
4ODM Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；19% PEG3350, 8% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.208
4ODM Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；19% PEG3350, 8% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.208
4ODN Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with S2-plus peptide 提交 2014-01-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20% PEG6000, 0.1 M citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.60 Å R-free 0.198
4ODO Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
4ODO Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
4ODO Structure of SlyD from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–149（149 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
4ODP Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–64（64 aa）片段：SEE REMARK 999 链 A 126–149（24 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；28% PEG400, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.202
4ODQ Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with S3 peptide 提交 2014-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–64（64 aa）片段：SEE REMARK 999 链 A 126–149（24 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；25% PEG6000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.213
4ODR Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–64（64 aa）片段：SEE REMARK 999 链 A 126–149（24 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20% PEG6000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.2 M zinc chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.93 Å R-free 0.170
4ODR Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–64（64 aa）片段：SEE REMARK 999 链 B 126–149（24 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20% PEG6000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.2 M zinc chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.93 Å R-free 0.170
7OXG ttSlyD FKBP domain with M8A pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–64（64 aa）链 A 126–149（24 aa）	突变：Deletion of IF domain 突变：Deletion of IF domain	CL CHLORIDE ION × 1 IMD IMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.5；292.15 K；Bis-Tris, PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7OXG ttSlyD FKBP domain with M8A pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–64（64 aa）链 B 126–149（24 aa）	突变：Deletion of IF domain 突变：Deletion of IF domain	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.5；292.15 K；Bis-Tris, PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7OXH ttSlyD with pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NI NICKEL (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 6.5；292.15 K；Sodium cacodylate, PEG 200	分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7OXI ttSlyD with W4A pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 6.5；292.15 K；sodium cacodylate, MPD, PEG8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.245
7OXJ ttSlyD with M8A pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；292.15 K；Sodium cacodylate, PEG 200	分辨率 1.85 Å R-free 0.224
7OXK ttSlyD with W4K pseudo-wild-type S2 peptide 提交 2021-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 9；292.15 K；1-4dioxane, bicine, PEG 20000	分辨率 2.80 Å R-free 0.235

共 15 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5SLE7_THET8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3cgn
沉积日期 deposition_date	2008-03-06
结构标题 title	Crystal Structure of thermophilic SlyD
关键词 keywords	SlyD, prolyl cis trans isomerase, chaperone, Rotamase, ISOMERASE; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.34 Å
零角强度 I(0) i0	5409100.00
分子量 molecular_weight	16556.0 kDa
排除体积 excluded_volume	20496 Å³
包络体积 envelope_volume	26921 Å³
水化壳体积 shell_volume	12684 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.1 Å
壳层 Rg shell_rg	23.65 Å
包络 Rg envelope_rg	19.18 Å
形状 Rg shape_rg	19.30 Å
总 Rg total_rg	20.18 Å
总原子数 total_atoms	1168
残基数 n_residues	151
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	66.0 Å
Rg (实空间) rg_real	20.06 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.55 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.4090e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.3940e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.05 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5409000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8876
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.330
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.555
角度范围 angular_range	— – 0.4000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	526600.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.913; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.835; Smooth: 0.962

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
分子量 formula_weight	17400.2 kDa
EC 编号 ec_number	5.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1189

MKVGQDKVVTIRYTLQVEGEVLDQGELSYLHGHRNLIPGLEEALEGREEGEAFQAHVPAEKAYGPHDPEGVQVVPLSAFPEDAEVVPGAQFYAQDMEGNPMPLTVVAVEGEEVTVDFNHPLAGKDLDFQVEVVKVREATPEELLHGHAHPSGHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Thermus thermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	300852
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	21

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	3cgnA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	81.180 Å
晶胞边长 b length_b	85.090 Å
晶胞边长 c length_c	92.220 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	F 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	22
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	19.760 Å
R 因子 r_factor	0.2110
R_work r_work	0.2090
R_free r_free	0.2570

fit	/app/data/saxs_computation/cg/3cgn/3cgn.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cg/3cgn/3cgn.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cg/3cgn/3cgn.dat

Crystal Structure of thermophilic SlyD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction