3ch9

Crystal structure of Aspergillus fumigatus chitinase B1 in complex with dimethylguanylurea

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chitinase

Aspergillus fumigatus

UniProt Q873X9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 5 1-methyl-3-(N-methylcarbamimidoyl)urea × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 8 1-methyl-3-(N-methylcarbamimidoyl)urea × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q873X9_ASPFU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–433; UniProt 1–433 作者链 B; PDB构建体 1–433; UniProt 1–433

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ch9
沉积日期 deposition_date2008-03-09
结构标题 titleCrystal structure of Aspergillus fumigatus chitinase B1 in complex with dimethylguanylurea
关键词 keywords(beta-alpha)8 barrel, chitinase, peptide inhibitors, hydrolase, Glycosidase, HYDROLASE-HYDROLASE inhibitor complex; HYDROLASE/HYDROLASE inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ch9__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ch9__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ch9__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.31 Å
Rg(电子密度)20.83 Å
总 Rg21.81 Å
原子数3115
残基数394
排除体积54526 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3ch9__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3ch9__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3ch9a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family familyc.1.8.5 — Type II chitinase
结构域编号 domain_idd3ch9a2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.26.3 — Chitinase insertion domain
家族 Family familyd.26.3.1 — Chitinase insertion domain
结构域编号 domain_idd3ch9b1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family familyc.1.8.5 — Type II chitinase
结构域编号 domain_idd3ch9b2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.26.3 — Chitinase insertion domain
家族 Family familyd.26.3.1 — Chitinase insertion domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3ch9A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Glycosidases
结构域编号 domain_id3ch9A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id3ch9B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Glycosidases
结构域编号 domain_id3ch9B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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7. 引用文献 (1)