3ci0

The Crystal Structure of the GspK-GspI-GspJ complex from enterotoxigenic Escherichia coli Type 2 Secretion System

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pseudopilin GspI

Escherichia coli

UniProt Q8VPC3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Pseudopilin GspJ × 1 (Q8VRM4) Pseudopilin GspK × 1 (A7ZRI8) CHLORIDE ION × 1 CALCIUM ION × 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8VPC3_ECOLX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 4–89; UniProt 33–118

Pseudopilin GspJ

Escherichia coli

UniProt Q8VRM4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Pseudopilin GspI × 1 (Q8VPC3) Pseudopilin GspK × 1 (A7ZRI8) CHLORIDE ION × 1 CALCIUM ION × 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8VRM4_ECOLX
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 2–163; UniProt 26–187

Pseudopilin GspK

Escherichia coli

UniProt A7ZRI8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Pseudopilin GspI × 1 (Q8VPC3) Pseudopilin GspJ × 1 (Q8VRM4) CHLORIDE ION × 1 CALCIUM ION × 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A7ZRI8_ECO24
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 4–298; UniProt 31–325

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ci0
沉积日期 deposition_date2008-03-10
结构标题 titleThe Crystal Structure of the GspK-GspI-GspJ complex from enterotoxigenic Escherichia coli Type 2 Secretion System
关键词 keywordsGENERAL SECRETORY PATHWAY, PSEUDOPILUS, TYPE 4 PILIN BIOGENESIS, METHYLATION, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ci0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ci0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ci0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.43 Å
Rg(电子密度)24.56 Å
总 Rg25.27 Å
原子数4112
残基数507
排除体积73273 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3ci0__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd3ci0i1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.24 — Pili subunits
超家族 Superfamily superfamilyd.24.1 — Pili subunits
家族 Family familyd.24.1.7 — GSPII I/J protein-like
结构域编号 domain_idd3ci0j1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.24 — Pili subunits
超家族 Superfamily superfamilyd.24.1 — Pili subunits
家族 Family familyd.24.1.5 — EpsJ-like
结构域编号 domain_idd3ci0k1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.16 — GspK insert domain-like
家族 Family familya.60.16.1 — GspK insert domain-like
结构域编号 domain_idd3ci0k2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.16 — GspK insert domain-like
家族 Family familya.60.16.1 — GspK insert domain-like
结构域编号 domain_idd3ci0k3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.24 — Pili subunits
超家族 Superfamily superfamilyd.24.1 — Pili subunits
家族 Family familyd.24.1.6 — GspK pilin-like domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3ci0I00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1300 — Pantoate--beta-alanine Ligase; Chain: A,domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — GSPII I/J protein-like
结构域编号 domain_id3ci0J01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology610 — Pili subunits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GSPII I/J protein-like
结构域编号 domain_id3ci0J02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — gspk-gspi-gspj complex like domains
结构域编号 domain_id3ci0K01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1300 — Pantoate--beta-alanine Ligase; Chain: A,domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — GSPII I/J protein-like
结构域编号 domain_id3ci0K02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology40 — Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — EpsJ-like
结构域编号 domain_id3ci0K03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology40 — Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — EpsJ-like
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7. 引用文献 (1)