3ci5

Complex of Phosphorylated Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major actin

物种未注明

UniProt P07830

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Gelsolin × 1 (P06396) MAGNESIUM ION × 1 SULFATE ION × 10 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GLYCEROL × 5 CALCIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Gelsolin × 2 (P06396) MAGNESIUM ION × 2 SULFATE ION × 20 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GLYCEROL × 10 CALCIUM ION × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACT1_DICDI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 2–376

Gelsolin

Homo sapiens

UniProt P06396

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Major actin × 1 (P07830) MAGNESIUM ION × 1 SULFATE ION × 10 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GLYCEROL × 5 CALCIUM ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Major actin × 2 (P07830) MAGNESIUM ION × 2 SULFATE ION × 20 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GLYCEROL × 10 CALCIUM ION × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GELS_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 2–126; UniProt 52–176

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ci5
沉积日期 deposition_date2008-03-10
结构标题 titleComplex of Phosphorylated Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin
关键词 keywords;Actin, Gelsolin, Dictyostelium discoideum, Phosphorylated Tyrosine, Actin-Associated Protein, Methyl Histidine, ATP-binding, Cytoskeleton, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Structural protein, Actin capping, Actin-binding, Alternative initiation, Amyloid, Disease mutation, Secreted ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ci5__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ci5__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ci5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)37.77 Å
Rg(电子密度)38.76 Å
总 Rg38.62 Å
原子数7991
残基数984
排除体积141450 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3ci5__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3ci5__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3ci5a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3ci5a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.1 — Actin/HSP70
结构域编号 domain_idd3ci5g2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.109 — Gelsolin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.109.1 — Actin depolymerizing proteins
家族 Family familyd.109.1.1 — Gelsolin-like
结构域编号 domain_idd3ci5g3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3ci5A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id3ci5A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id3ci5A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id3ci5G00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
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7. 引用文献 (1)