SAXSdb — 3cjk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Copper transport protein ATOX1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–68	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% PEG-6000, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.283

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3CJK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FE0 CRYSTAL STRUCTURE OF CADMIUM-HAH1 提交 2000-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；MES buffer, lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.75 Å R-free 0.213
1FE4 CRYSTAL STRUCTURE OF MERCURY-HAH1 提交 2000-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	IUM URANYL (VI) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 HG MERCURY (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；MES buffer, ammonium sulfate, magnesium chloride, dithiothreitol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.75 Å R-free 0.218
1FEE CRYSTAL STRUCTURE OF COPPER-HAH1 提交 2000-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Strictly anaerobic. MES buffer, lithium sulfate, and dithiothreitol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
1TL4 Solution structure of Cu(I) HAH1 提交 2004-06-09	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM sodium acetate；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM Cu(I)HAH1 U-15N; 10 mM sodium acetate \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mM Cu(I)HAH1 U-95% 13C,U-98% 15N; 4 mM DTT; 100 mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1TL5 Solution structure of apoHAH1 提交 2004-06-09	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM apoHAH1 U-15N; 5mM DTT; 100 mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mM apoHAH1 U-95% 13C,U-98% 15N; 5 mM DTT; 100 mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mM unlabelled apoHAH1 ; 5 mM DTT; 100 mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2K1R The solution NMR structure of the complex between MNK1 and HAH1 mediated by Cu(I) 提交 2008-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–68（68 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 0.6 mM HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 1.0 mM HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LQ9 Solution structure of the K60A mutant of Atox1 提交 2012-02-28	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	突变：K60A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.215；压力 ambient NMR样品组成 0.4-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity-1, 100 mM sodium phosphate-2, 2-2.5 mM DTT-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4-0.5 mM [U-100% 15N] entity-4, 100 mM sodium phosphate-5, 2-2.5 mM DTT-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity-7, 100 mM sodium phosphate-8, 2-2.5 mM DTT-9, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3IWL Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) 提交 2009-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
3IWL Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) 提交 2009-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
3IWX Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (dimer) 提交 2009-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	CPT Cisplatin × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；1.5 M lithium sulfate, 0.1M MES, 50 mM NaCl, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.14 Å R-free 0.228
4QOT Crystal structure of human copper chaperone bound to the platinum ion 提交 2014-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；12mg/mlATOX-Pt(DACH)(H2O)(SO4), 65% sat Li2SO4, 100mM MES, 60mM NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4YDX Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) - new refinement 提交 2015-02-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–68（67 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.60 Å R-free 0.155
4YEA Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (dimer) - new refinement 提交 2015-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–68（67 aa）链 B 2–68（67 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；1.5 M LITHIUM SULFATE, 0.1M MES, 50 MM NACL, PH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 294K	分辨率 2.14 Å R-free 0.197
5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
5T7L Pt(II)-mediated copper-dependent interactions between ATOX1 and MNK1 提交 2016-09-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–68（67 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG-6000 10 to 30 % w/v and sodium citrate 0.1M at pH 4.7	分辨率 2.83 Å R-free 0.273
7DC1 Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2020-10-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M LiCl, 0.1M Tris pH8, 20% PEG6,000	分辨率 1.75 Å R-free 0.204
7DC1 Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2020-10-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–68（68 aa）	未记录	AG SILVER ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M LiCl, 0.1M Tris pH8, 20% PEG6,000	分辨率 1.75 Å R-free 0.204
7ZC3 Crystal structure of human copper chaperone Atox1 bound to zinc ion by CxxC motif 提交 2022-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–68（68 aa）链 B 1–68（68 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop:12.5mg/ml Atox1 + 1.62mM ZnSO4 in 25mM Sodium Phosphate buffer pH 7.0, 2mM DTT; Reservoir: 1.9M Li2SO4, 100mM MES pH 6.0, 2.5% glycerol; VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K.	分辨率 1.90 Å R-free 0.186

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UniProt名称	ATOX1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–67； UniProt 2–68

Copper-transporting ATPase 1

Homo sapiens

UniProt Q04656

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 7–77	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% PEG-6000, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.283

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3CJK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AW0 FOURTH METAL-BINDING DOMAIN OF THE MENKES COPPER-TRANSPORTING ATPASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-10-08	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–446（72 aa）片段：FOURTH METAL-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
1KVI Solution Structure of the Reduced Form of the First Heavy Metal Binding Motif of the Menkes Protein 提交 2002-01-26	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–79（79 aa）片段：RESIDUES 1-79	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 20 mM NaAcetate buffer, 10 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.01% Na Azide, 1 mM Protein \| H2O/D2O	分辨率未提供
1KVJ Solution Structure of the Cu(I) bound form of the first heavy metal binding motif of the Menkes protein 提交 2002-01-26	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–79（79 aa）片段：RESIDUES 1-79	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；295 K；压力 1 NMR样品组成 20 mM Na Acetate buffer, 10 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.01% Na Azide, 1 mM Protein \| H2O/D2O	分辨率未提供
1Q8L Second Metal Binding Domain of the Menkes ATPase 提交 2003-08-21	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–246（83 aa）片段：Second Copper Binding Domain (residues 164-246)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）30mM；压力 ambient NMR样品组成 0.5mM MNKr2, U-15N, 20mM potassium phosphate, 10 mM Sodium Chloride, pH6.5. \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1S6O Solution structure and backbone dynamics of the apo-form of the second metal-binding domain of the Menkes protein ATP7A 提交 2004-01-26	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 169–240（72 aa）片段：Second soluble domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）phosphate 100 mM；压力 ambient NMR样品组成 1 mM protein, pH 7 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM protein U-15N, pH 7 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM protein U-15N,13C, pH 7 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1S6U Solution structure and backbone dynamics of the Cu(I) form of the second metal-binding domain of the Menkes protein ATP7A 提交 2004-01-27	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 169–240（72 aa）片段：Second domain of ATP7A	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM phosphate；压力 ambient NMR样品组成 1 mM protein, 1:1 copper(I) \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM protein U-15N, 1:1 copper(I) \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM protein U-15N,13C, 1:1 copper(I) \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1Y3J Solution structure of the copper(I) form of the fifth domain of Menkes protein 提交 2004-11-25	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 486–558（73 aa）片段：fifth domain of the menkes protein	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 ambient NMR样品组成 1mM MNK5 domain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer NA \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1Y3K Solution structure of the apo form of the fifth domain of Menkes protein 提交 2004-11-25	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 486–558（73 aa）片段：fifth domain of the menkes protein	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 ambient NMR样品组成 1mM MNK5 domain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer NA \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1YJR Solution structure of the apo form of the sixth soluble domain A69P mutant of Menkes protein 提交 2005-01-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 562–633（72 aa）片段：Sixth soluble domain	突变：A69P	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1YJT Solution structure of the Cu(I) form of the sixth soluble domain A69P mutant of Menkes protein 提交 2005-01-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 562–633（72 aa）片段：Sixth soluble domain	突变：A69P	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1YJU Solution structure of the apo form of the sixth soluble domain of Menkes protein 提交 2005-01-15	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 562–633（72 aa）片段：Sixth soluble domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1YJV Solution structure of the Cu(I) form of the sixth soluble domain of Menkes protein 提交 2005-01-15	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 562–633（72 aa）片段：Sixth soluble domain	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM 15N labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM 15N 13C labeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0mM unlabeled sample; 5mM DTT; 100mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2AW0 FOURTH METAL-BINDING DOMAIN OF THE MENKES COPPER-TRANSPORTING ATPASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-10-08	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–446（72 aa）片段：FOURTH METAL-BINDING DOMAIN	未记录	AG SILVER ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
2G9O Solution structure of the apo form of the third metal-binding domain of ATP7A protein (Menkes Disease protein) 提交 2006-03-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 275–352（78 aa）片段：sixth soluble domain, residues 275-352	突变：K46V	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1.5mM Apo-MNK3 unlabelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT,90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM Apo-MNK3 15N labelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM Apo-MNK3 15N, 13C labelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 1mM DTT, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2GA7 Solution structure of the copper(I) form of the third metal-binding domain of ATP7A protein (menkes disease protein) 提交 2006-03-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 275–352（78 aa）片段：Third soluble domain, residues 275-352	突变：K46V	CU1 COPPER (I) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1mM copper(I)MNK3 unlabelled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5mM copper(I)MNK3 15N labeled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5mM copper(I)MNK3 15N,13C labeled sample, 100mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2K1R The solution NMR structure of the complex between MNK1 and HAH1 mediated by Cu(I) 提交 2008-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 5–77（73 aa）片段：HMA 1 domain: Residues 5-77	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 0.6 mM HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 1.0 mM HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KIJ Solution structure of the Actuator domain of the copper-transporting ATPase ATP7A 提交 2009-05-06	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 806–924（119 aa）片段：actuator domain, UNP residues 806-924	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）phosphate, arginine, glutamate；压力 ambient NMR样品组成 0.3 mM Actd-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-13C; U-15N] Actd-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] Actd-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KMV Solution structure of the nucleotide binding domain of the human Menkes protein in the ATP-free form 提交 2009-08-05	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1051–1231（181 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）phospate 0.05；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM [U-99% 15N] ATPfree N-MNK-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] ATPfree N-MNK-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KMX Solution structure of the nucleotide binding domain of the human Menkes protein in the ATP-bound form 提交 2009-08-05	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1051–1231（181 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）phospate 0.05；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM [U-99% 15N] ATPfree N-MNK-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] ATPfree N-MNK-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5T7L Pt(II)-mediated copper-dependent interactions between ATOX1 and MNK1 提交 2016-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–77（71 aa）片段：UNP residues 7-77	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG-6000 10 to 30 % w/v and sodium citrate 0.1M at pH 4.7	分辨率 2.83 Å R-free 0.273
7LU8 Structure of the cryptic HMA domain of the human copper transporter ATP7A 提交 2021-02-21	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–156（73 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）210；压力 1 NMR样品组成 0.35 mM [U-13C; U-15N] HMA2A, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP7A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–71； UniProt 7–77

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3cjk
沉积日期 deposition_date	2008-03-13
结构标题 title	Crystal structure of the adduct HAH1-Cd(II)-MNK1.
关键词 keywords	;HAH1; ATP7A; ATP7B; Menkes disease; metal homeostasis, Chaperone, Copper, Copper transport, Ion transport, Metal-binding, Transport, Alternative splicing, ATP-binding, Cytoplasm, Disease mutation, Endoplasmic reticulum, Glycoprotein, Golgi apparatus, Hydrolase, Magnesium, Membrane, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Polymorphism, Transmembrane, METAL TRANSPORT-HYDROLASE COMPLEX ;; METAL TRANSPORT/HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.42 Å
零角强度 I(0) i0	4936660.00
分子量 molecular_weight	15766.0 kDa
排除体积 excluded_volume	19644 Å³
包络体积 envelope_volume	22387 Å³
水化壳体积 shell_volume	12267 Å³
包络直径 envelope_diameter	65.8 Å
壳层 Rg shell_rg	21.31 Å
包络 Rg envelope_rg	16.85 Å
形状 Rg shape_rg	16.46 Å
总 Rg total_rg	17.20 Å
总原子数 total_atoms	1094
残基数 n_residues	143
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	67.2 Å
Rg (实空间) rg_real	17.16 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.87 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.9370e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.9820e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.15 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4937000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7514
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	16.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.523
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.005
角度范围 angular_range	— – 0.4650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1512000.0000
实空间数据点数 n_real_points	77
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.414; Stabil: 0.996; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.540; Smooth: 0.995

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Copper transport protein ATOX1
分子量 formula_weight	7394.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1170

PKHEFSVDMTCGGCAEAVSRVLNKLGGVKYDIDLPNKKVCIESEHSMDTLLATLKKTGKTVSYLGLEI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Copper-transporting ATPase 1
分子量 formula_weight	8317.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

VNSVTISVEGMTCNSCVWTIEQQIGKVNGVHHIKVSLEEKNATIIYDPKLQTPKTLQEAIDDMGFDAVIHNIEGR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CADMIUM ION
分子量 formula_weight	112.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	76

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3cjka1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.17 — HMA, heavy metal-associated domain
家族 Family family	d.58.17.1 — HMA, heavy metal-associated domain

结构域编号 domain_id	d3cjka2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3cjkb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.17 — HMA, heavy metal-associated domain
家族 Family family	d.58.17.1 — HMA, heavy metal-associated domain

结构域编号 domain_id	d3cjkb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3cjkA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	3cjkB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

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8. 引用文献 (3)

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晶胞边长 a length_a	47.707 Å
晶胞边长 b length_b	55.274 Å
晶胞边长 c length_c	63.241 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	26.300 Å
R 因子 r_factor	0.2308
R_work r_work	0.2257
R_free r_free	0.2825

fit	/app/data/saxs_computation/cj/3cjk/3cjk.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cj/3cjk/3cjk.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cj/3cjk/3cjk.dat

Crystal structure of the adduct HAH1-Cd(II)-MNK1.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Copper transport protein ATOX1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Copper-transporting ATPase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)