Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Cell adhesion molecule × 1 （Q4KMG0） ZINC ION × 1 CALCIUM ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Cell adhesion molecule × 1 （Q4KMG0） ZINC ION × 1 CALCIUM ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SHH_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–168； UniProt 26–189 作者链 B； PDB构建体 5–168； UniProt 26–189 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Sonic hedgehog protein × 1 （Q62226） ZINC ION × 1 CALCIUM ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Sonic hedgehog protein × 1 （Q62226） ZINC ION × 1 CALCIUM ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CDON_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 4–102； UniProt 826–924 作者链 D； PDB构建体 4–102； UniProt 826–924 |
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| 条目编号 entry_id | 3d1m |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-05-06 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of Sonic Hedgehog Bound to the third FNIII domain of CDO |
| 关键词 keywords | ;Fibronectin Protein-Protein Complex, Autocatalytic cleavage, Developmental protein, Glycoprotein, Hydrolase, Lipoprotein, Membrane, Palmitate, Protease, Secreted, Immunoglobulin domain, Transmembrane, signaling protein - cell adhesion COMPLEX ;; signaling protein / cell adhesion |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.35 Å |
| Rg（电子密度） | 18.74 Å |
| 总 Rg | 19.51 Å |
| 原子数 | 1993 |
| 残基数 | 247 |
| 排除体积 | 35048 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3d1ma_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.65 — Hedgehog/DD-peptidase |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.65.1 — Hedgehog/DD-peptidase |
| 家族 Family family | d.65.1.2 — Hedgehog (development protein), N-terminal signaling domain |
| 结构域编号 domain_id | d3d1mb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.65 — Hedgehog/DD-peptidase |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.65.1 — Hedgehog/DD-peptidase |
| 家族 Family family | d.65.1.2 — Hedgehog (development protein), N-terminal signaling domain |
| 结构域编号 domain_id | d3d1mc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.1.2 — Fibronectin type III |
| 家族 Family family | b.1.2.1 — Fibronectin type III |
| 结构域编号 domain_id | d3d1md_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.1.2 — Fibronectin type III |
| 家族 Family family | b.1.2.1 — Fibronectin type III |
| 结构域编号 domain_id | 3d1mA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1380 — Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 3d1mB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1380 — Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 3d1mC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |
| 结构域编号 domain_id | 3d1mD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Immunoglobulins |