3dbh

Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ULA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–531； UniProt 1–534 作者链 C； PDB构建体 3–531； UniProt 1–534 作者链 E； PDB构建体 3–531； UniProt 1–534 作者链 G； PDB构建体 3–531； UniProt 1–534

NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit

Homo sapiens

UniProt Q8TBC4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8 × 1 （Q15843） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–434； UniProt 33–463 作者链 D； PDB构建体 4–434； UniProt 33–463 作者链 F； PDB构建体 4–434； UniProt 33–463 作者链 H； PDB构建体 4–434； UniProt 33–463

NEDD8

Homo sapiens

UniProt Q15843

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit × 1 （Q13564） NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit × 1 （Q8TBC4） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NEDD8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 13–88； UniProt 1–76 作者链 J； PDB构建体 13–88； UniProt 1–76 作者链 K； PDB构建体 13–88； UniProt 1–76 作者链 L； PDB构建体 13–88； UniProt 1–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3dbh
沉积日期 deposition_date	2008-05-31
结构标题 title	Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg)
关键词 keywords	;Cell cycle, activating enzyme, Apoptosis, Membrane, Ubl conjugation pathway, ATP-binding, Ligase, Nucleotide-binding, Polymorphism, Nucleus ;; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3dbh__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3dbh__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3dbh__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.60 Å
Rg（电子密度）	30.42 Å
总 Rg	31.10 Å
原子数	8103
残基数	1025
排除体积	144550 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3dbh__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3dbh__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3dbh__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3dbh__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit
分子量 formula_weight	59973.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	32578

GSMAQLGKLLKEQKYDRQLRLWGDHGQEALESAHVCLINATATGTEILKNLVLPGIGSFTIIDGNQVSGEDAGNNFFLQRSSIGKNRAEAAMEFLQELNSDVSGSFVEESPENLLDNDPSFFCRFTVVVATQLPESTSLRLADVLWNSQIPLLICRTYGLVGYMRIIIKEHPVIESHPDNALEDLRLDKPFPELREHFQSYDLDHMEKKDHSHTPWIVIIAKYLAQWYSETNGRIPKTYKEKEDFRDLIRQGILKPEDEENFEEAIKNVNTALNTTQIPSSIEDIFNDDRCINITKQTPSFWILARALKEFVAKEGQGNLPVRGTIPDMIADSGKYIKLQNVYREKAKKDAAAVGNHVAKLLQSIGQAPESISEKELKLLCSNSAFLRVVRCRSLAEEYGLDTINKDEIISSMDNPDNEIVLYLMLRAVDRFHKQQGRYPGVSNYQVEEDIGKLKSCLTGFLQEYGLSVMVKDDYVHEFCRYGAAEPHTIAAFLGGAAAQEVIKIITKQFVIFNNTYIYSGMSQTSATFQL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit
分子量 formula_weight	48681.6 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
突变 mutation	R190A, C216A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

MKLDWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQFLFRPKDIGRPKAEVAAEFLNDRVPNCNVVPHFNKIQDFNDTFYRQFHIIVCGLDSIIARRWINGMLISLLNYEDGVLDPSSIVPLIDGGTEGFKGNAAVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMATIASMPRLPEHCIEYVRMLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPEHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVVKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLVDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFTS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	NEDD8
分子量 formula_weight	9721.2 kDa
突变 mutation	A172R
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L

GSRRASVGSGGSMLIKVKTLTGKEIEIDIEPTDKVERIKERVEEKEGIPPQQQRLIYSGKQMNDEKTAADYKILGGSVLHLVLRLRGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 37 domains

SCOP 2.08 (17 domains)

结构域编号 domain_id	d3dbha_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3dbhc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhd1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3dbhe_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhf1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3dbhg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhh1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.111 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
超家族 Superfamily superfamily	c.111.1 — Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins
家族 Family family	c.111.1.2 — Ubiquitin activating enzymes (UBA)

结构域编号 domain_id	d3dbhh2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3dbhi2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.1 — Ubiquitin-related

结构域编号 domain_id	d3dbhi3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3dbhj_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.1 — Ubiquitin-related

结构域编号 domain_id	d3dbhk_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.1 — Ubiquitin-related

结构域编号 domain_id	d3dbhl_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family family	d.15.1.1 — Ubiquitin-related

CATH v4.4 (20 domains)

结构域编号 domain_id	3dbhA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	520 — Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2

结构域编号 domain_id	3dbhB03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	260 — NEDD8-activating enzyme E1, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	3dbhC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	520 — Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2

结构域编号 domain_id	3dbhD03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	260 — NEDD8-activating enzyme E1, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	3dbhE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	520 — Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2

结构域编号 domain_id	3dbhF03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	260 — NEDD8-activating enzyme E1, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	3dbhG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3dbhH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	520 — Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2

结构域编号 domain_id	3dbhH03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	260 — NEDD8-activating enzyme E1, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	3dbhI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	3dbhJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	3dbhK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	3dbhL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

▶

晶胞边长 a length_a	135.647 Å
晶胞边长 b length_b	198.100 Å
晶胞边长 c length_c	210.961 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.850 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2260
R_work r_work	0.2240
R_free r_free	0.2740

Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NEDD8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3dbh__assembly_3__model_1

3dbh__assembly_3__model_1 | I(q)

3dbh__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 37 domains

SCOP 2.08 (17 domains)

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)

Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NEDD8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3dbh__assembly_3__model_1

3dbh__assembly_3__model_1 | I(q)

3dbh__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 37 domains

SCOP 2.08 (17 domains)

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)