3dll

The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 229.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 2–275	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 1–274（274 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 1–274（274 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 2–272（271 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 2–275（274 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 2–272（271 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL2_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 2–275

50S ribosomal protein L3

物种未注明

UniProt Q9RXK2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–211	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2OGM The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative SB-571519 提交 2007-01-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	G19 (2S,3AR,4R,5S,6S,8R,9R,9AR,10R)-2,5-DIHYDROXY-4,6,9,10-TETRAMETHYL-1-OXO-6-VINYLDECAHYDRO-3A,9-PROP[1]ENOCYCLOPENTA[8]ANNULEN-8-YL [(6-AMINOPYRIDAZIN-3-YL)CARBONYL]CARBAMATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.334
2OGN The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative SB-280080 提交 2007-01-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	G80 (3AS,4R,5S,6S,8R,9R,9AR,10R)-5-HYDROXY-4,6,9,10-TETRAMETHYL-1-OXO-6-VINYLDECAHYDRO-3A,9-PROPANOCYCLOPENTA[8]ANNULEN-8-YL (PIPERIDIN-4-YLTHIO)ACETATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.56 Å R-free 0.338
2OGO The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative retapamulin (SB-275833) 提交 2007-01-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	G34 Retapamulin × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.66 Å R-free 0.334
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 B 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–211（211 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–206（206 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–206（206 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–206（206 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL3_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–211； UniProt 1–211

50S ribosomal protein L4

物种未注明

UniProt Q9RXK1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 1–205	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–205（205 aa）	未记录	CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–205（205 aa）	未记录	CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–205（205 aa）	未记录	ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–205（205 aa）	未记录	ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 1–204（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 2–205（204 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 2–205（204 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 1–204（204 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 2–198（197 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 C 2–198（197 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 2–198（197 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 2–196（195 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL4_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

50S ribosomal protein L5

物种未注明

UniProt Q9RXJ0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 1–180	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 3–179（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 D 3–179（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 1–180（180 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 3–179（177 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 3–179（177 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 D 2–177（176 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL5_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180

50S ribosomal protein L6

物种未注明

UniProt Q9RSL3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 E； UniProt 1–185	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 28–212（185 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 28–212（185 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 E 1–212（212 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 5–175（171 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 E 5–175（171 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 1–185（185 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 5–175（171 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 5–175（171 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 E 5–175（171 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL6_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

50S ribosomal protein L11

物种未注明

UniProt Q9RSS7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 F； UniProt 1–144	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–144（144 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–144（144 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–144（144 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 G 1–144（144 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–144（144 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 4–144（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 F 1–144（144 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253

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UniProt名称	RL11_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

50S ribosomal protein L13

物种未注明

UniProt Q9RXY1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 G； UniProt 1–174	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–174（174 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–174（174 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–174（174 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 H 1–174（174 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–174（174 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 30–171（142 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 G 30–171（142 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 1–174（174 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 30–172（143 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 30–172（143 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 G 30–171（142 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL13_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174

50S ribosomal protein L14

物种未注明

UniProt Q9RXJ2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 H； UniProt 1–134	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–134（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–134（134 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–134（134 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 I 1–134（134 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–134（134 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–134（134 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL14_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

50S ribosomal protein L15

物种未注明

UniProt Q9RSK9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 I； UniProt 1–156	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–156（156 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–156（156 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–156（156 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 J 1–156（156 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–156（156 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 4–144（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 I 4–144（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–156（156 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–137（137 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–137（137 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–137（137 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL15_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

50S ribosomal protein L16

物种未注明

UniProt Q9RXJ5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 J； UniProt 1–141	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NJM The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) and the antibiotic sparsomycin 提交 2003-01-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 K 2–142（141 aa）	未记录	SPS SPARSOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM	分辨率 3.60 Å R-free 0.308
1NJP The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) 提交 2003-01-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 K 2–142（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM , pH 7.80	分辨率 3.50 Å R-free 0.295
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 1–140（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 2–142（141 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 2–142（141 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 K 1–142（142 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 2–142（141 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
1Y69 RRF domain I in complex with the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2004-12-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 K 1–141（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.33 Å R-free 0.338
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 5–140（136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 J 5–140（136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 1–141（141 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 5–140（136 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 5–140（136 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 J 5–138（134 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL16_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 2–142； UniProt 1–141

50S ribosomal protein L17

物种未注明

UniProt Q9RSJ5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 K； UniProt 1–116	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–116（116 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 3–115（113 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 K 3–115（113 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–116（116 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–115（115 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL17_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

50S ribosomal protein L18

物种未注明

UniProt Q9RSL2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 L； UniProt 1–114	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 2–114（113 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 2–114（113 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 M 1–114（114 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 1–113（113 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 8–111（104 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 L 8–111（104 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 1–114（114 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 8–111（104 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 8–111（104 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 L 8–111（104 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL18_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114

50S ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt Q9RWB4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 M； UniProt 1–166	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–166（166 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–166（166 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–166（166 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 N 1–166（166 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–166（166 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 2–166（165 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 2–106（105 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 M 2–115（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 1–113（113 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 1–166（166 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 2–119（118 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL19_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

50S ribosomal protein L20

物种未注明

UniProt Q9RSW7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 N； UniProt 1–118	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–118（118 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–118（118 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 O 1–118（118 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–118（118 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 2–118（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 N 2–118（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 1–118（118 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 2–118（117 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 2–118（117 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 2–118（117 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL20_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

50S ribosomal protein L21

物种未注明

UniProt Q9RY64

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 O； UniProt 1–100	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 70–169（100 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 70–169（100 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 P 70–169（100 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 1–100（100 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 5–98（94 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 O 5–98（94 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–100（100 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–98（98 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–98（98 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–98（98 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL21_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–100； UniProt 1–100

50S ribosomal protein L22

物种未注明

UniProt Q9RXJ7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 P； UniProt 1–134	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–134（134 aa）	未记录	CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–134（134 aa）	未记录	CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–134（134 aa）	未记录	ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–134（134 aa）	未记录	ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1OND THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 50S LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH TROLEANDOMYCIN MACROLIDE ANTIBIOTIC 提交 2003-02-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	TAO TROLEANDOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；EVAPORATION	分辨率 3.40 Å R-free 0.310
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–134（134 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 1–134（134 aa）	突变：Insertion of VPR after R109	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 1–109（109 aa）链 P 110–134（25 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 8–134（127 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 P 8–134（127 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 6–133（128 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 1–134（134 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 P 6–134（129 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL22_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

50S ribosomal protein L23

物种未注明

UniProt Q9RXK0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 Q； UniProt 1–95	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 1–94（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 2–95（94 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 2–95（94 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 R 1–95（95 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 1–94（94 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2AAR Structure of trigger factor binding domain in biologically homologous complex with eubacterial ribosome. 提交 2005-07-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 R 1–95（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K	分辨率 3.50 Å R-free 0.320
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 R 0–94（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 2–94（93 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Q 2–94（93 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 1–95（95 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 2–94（93 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 2–94（93 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 2–94（93 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL23_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

50S ribosomal protein L24

物种未注明

UniProt Q9RXJ1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 R； UniProt 1–115	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 S 1–115（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 2–115（114 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 4–113（110 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 R 4–113（110 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 1–115（115 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 4–113（110 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 4–113（110 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 4–113（110 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL24_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

50S ribosomal protein L25

物种未注明

UniProt Q9RX88

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 S； UniProt 1–237	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NJM The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) and the antibiotic sparsomycin 提交 2003-01-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 T 17–253（237 aa）	未记录	SPS SPARSOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM	分辨率 3.60 Å R-free 0.308
1NJP The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) 提交 2003-01-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 T 17–253（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM , pH 7.80	分辨率 3.50 Å R-free 0.295
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 1–237（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 17–253（237 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 17–253（237 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 T 1–253（253 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 1–237（237 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–175（175 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 S 1–175（175 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–237（237 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–175（175 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–175（175 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–175（175 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL25_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

50S ribosomal protein L27

物种未注明

UniProt Q9RY65

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 T； UniProt 1–91	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
1Y69 RRF domain I in complex with the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2004-12-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 U 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.33 Å R-free 0.338
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 2–85（84 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 T 2–85（84 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 12–85（74 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 1–91（91 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 T 12–83（72 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL27_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

50S ribosomal protein L28

物种未注明

UniProt Q9RRG8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 U； UniProt 1–81	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 8–79（72 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 U 8–79（72 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 1–81（81 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 6–79（74 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 6–79（74 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 6–79（74 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL28_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

50S ribosomal protein L29

物种未注明

UniProt Q9RXJ4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 V； UniProt 1–67	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2AAR Structure of trigger factor binding domain in biologically homologous complex with eubacterial ribosome. 提交 2005-07-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K	分辨率 3.50 Å R-free 0.320
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 W 1–67（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 V 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 1–67（67 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 6–66（61 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 6–66（61 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 13–66（54 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL29_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

50S ribosomal protein L30

物种未注明

UniProt Q9RSL0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 W； UniProt 1–55	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 X 1–55（55 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 X 1–55（55 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 X 1–55（55 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 X 1–55（55 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 X 1–55（55 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 W 1–55（55 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL30_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55

50S ribosomal protein L32

物种未注明

UniProt P49228

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 Y； UniProt 1–60	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

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其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–60（60 aa）	未记录	CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–60（60 aa）	未记录	CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–60（60 aa）	未记录	ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–60（60 aa）	未记录	ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Z 1–59（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Z 2–60（59 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Z 2–60（59 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1OND THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 50S LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH TROLEANDOMYCIN MACROLIDE ANTIBIOTIC 提交 2003-02-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	TAO TROLEANDOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；EVAPORATION	分辨率 3.40 Å R-free 0.310
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Z 1–59（59 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Y 1–60（60 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 Y 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 3–59（57 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 Z 3–59（57 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 1–60（60 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 2–59（58 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 2–59（58 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Z 3–59（57 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL32_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

50S ribosomal protein L33

物种未注明

UniProt Q9RSS4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 1； UniProt 1–55	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 1 1–82（82 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 1 2–50（49 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 1 1–55（55 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 2–55（54 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 6–54（49 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 6–54（49 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 1 6–54（49 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL33_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	27
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55

50S ribosomal protein L34

物种未注明

UniProt Q9RSH2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 2； UniProt 1–47	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–47（47 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 2 1–46（46 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL34_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	28
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–47； UniProt 1–47

50S ribosomal protein L35

物种未注明

UniProt Q9RSW6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 3； UniProt 1–66	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L36 × 1 （Q9RSK0） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 1–63（63 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 2–66（65 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 2–66（65 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 1–65（65 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 1–65（65 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol	分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 2–66（65 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 198	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 3 2–66（65 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol	分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 1–66（66 aa）	未记录	6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol	分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 2–64（63 aa）	未记录	QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 2–64（63 aa）	未记录	QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 3 2–64（63 aa）	未记录	MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.	分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称	RL35_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	29
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

50S ribosomal protein L36

物种未注明

UniProt Q9RSK0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 28 RNA 2 PDB 声明：30-meric（30）与全部聚合物数一致	链 4； UniProt 1–37	未记录	rRNA-23S ribosomal RNA × 1 rRNA-5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q9RXK2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q9RXK1） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q9RSL3） 50S ribosomal protein L11 × 1 （Q9RSS7） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q9RXY1） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （Q9RSK9） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q9RSL2） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q9RWB4） 50S ribosomal protein L20 × 1 （Q9RSW7） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q9RY64） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q9RXK0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q9RX88） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q9RY65） 50S ribosomal protein L28 × 1 （Q9RRG8） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S ribosomal protein L30 × 1 （Q9RSL0） 50S ribosomal protein L32 × 1 （P49228） 50S ribosomal protein L33 × 1 （Q9RSS4） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q9RSH2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （Q9RSW6） MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3DLL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–36（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	773 CETHROMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	ZIT AZITHROMYCIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MUL TIAMULIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3CF5 Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.	分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric	链 4 1–37（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.239

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UniProt名称	RL36_DEIRA
Isoform	—
PDB实体	30
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3dll
沉积日期 deposition_date	2008-06-27
结构标题 title	The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning
关键词 keywords	;Ribosome, Antibiotic, oxazolidinone, Linezolid, Ribonucleoprotein, Ribosomal protein, RNA-binding, rRNA-binding, tRNA-binding, Methylation, Metal-binding, Zinc-finger ;; RIBOSOME
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	67.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	68.85 Å
零角强度 I(0) i0	53588300000.00
分子量 molecular_weight	1262600.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1287100 Å³
包络体积 envelope_volume	2142200 Å³
水化壳体积 shell_volume	237930 Å³
包络直径 envelope_diameter	230.0 Å
壳层 Rg shell_rg	81.20 Å
包络 Rg envelope_rg	68.53 Å
形状 Rg shape_rg	69.01 Å
总 Rg total_rg	68.64 Å
总原子数 total_atoms	83495
残基数 n_residues	5812
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	229.8 Å
Rg (实空间) rg_real	67.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.00 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.3590e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2440e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal	68.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	53660000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8567
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	89.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.223
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.380
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9269000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.788; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.799

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (33)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	rRNA-23S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	933405.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	X
原子数 atom_count	83657

GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAACCGAAACGCUUGCGUUUCGGGGUUGUAGGACCAGUUUUUAAGAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUACUGGCACCUGAGUAGGUCGUUGUUCGUGAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAGGGGGCCUACCAGCUUACCAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAUUCGGGUUUCUCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGCGAAACUGGCCUUUUGGGGUCGGUGGAGGCAACGGUGAAAUACCACCCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUUAUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCACUC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	rRNA-5S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	39605.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Z

ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUU

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L2
分子量 formula_weight	29976.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

AVKKYRPYTPSRRQMTTADFSGLTKKRPEKALTEALPKTGGRNNRGRITSRFIGGGHKRLYRIIDFKRRDKSGVNAKVAAIEYDPNRSARIALLHYADGEKRYILAPEGLTVGATVNAGPEAEPKLGNALPLRFVPVGAVVHALELVPGKGAQLARSAGTSVQVQGKESDYVIVRLPSGELRRVHSECYATIGAVGNAEHKNIVLGKAGRSRWLGRKPHQRGSAMNPVDHPHGGGEGRTGAGRVPVTPWGKPTKGLKTRRKRKTSDRFIVTRRK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L3
分子量 formula_weight	22477.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MKGILGTKIGMTQIWKNDRAIPVTVVLAGPCPIVQRKTAQTDGYEAVQIGYAPKAERKVNKPMQGHFAKAGVAPTRILREFRGFAPDGDSVNVDIFAEGEKIDATGTSKGKGTQGVMKRWNFAGGPASHGSKKWHRRPGSIGQRKTPGRVYKGKRMAGHMGMERVTVQNLEVVEIRAGENLILVKGAIPGANGGLVVLRSAAKASAAKGGK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L4
分子量 formula_weight	22308.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAQINVIGQNGGRTIELPLPEVNSGVLHEVVTWQLASRRRGTASTRTRAQVSKTGRKMYGQKGTGNARHGDRSVPTFVGGGVAFGPKPRSYDYTLPRQVRQLGLAMAIASRQEGGKLVAVDGFDIADAKTKNFISWAKQNGLDGTEKVLLVTDDENTRRAARNVSWVSVLPVAGVNVYDILRHDRLVIDAAALEIVEEEAGEEQQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L5
分子量 formula_weight	20379.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MQQLKTKYNDQVRPALMQQFGYSSVMAVPRIEKIVVNEGLGSSKEDSKAIDKAAKELALITLQKPIITKAKKSISNFKLRQGMPVGIKVTLRGERMYVFLEKLINIGLPRIRDFRGINPNAFDGRGNYNLGIKEQLIFPEITYDMVDKTRGMDITIVTTAKTDEEARALLQSMGLPFRKQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L6
分子量 formula_weight	19613.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSRIGKQPIAVPSGVTVNAQDGVFKVKGPKGELTVPYNTELTVRQDGDQLLVERPSDAQKHRALHGLTRTLVANAVKGVSDGYTINLELRGVGFRAKLTGKALEMNIGYSHPVIIEPPAGVTFAVPEPTRIDVSGIDKQLVGQVAANVRKVRKPDAYHGKGVRFVGEQIALKAGKAGATGGKGKK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L11
分子量 formula_weight	14889.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MKKVAGIVKLQLPAGKATPAPPVGPALGQYGANIMEFTKAFNAQTADKGDAIIPVEITIYADRSFTFITKTPPMSYLIRKAAGIGKGSSTPNKAKVGKLNWDQVLEIAKTKMPDLNAGSVEAAANTVAGTARSMGVTVEGGPNA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L13
分子量 formula_weight	19223.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAFPDTDVSPPRGGPSSPAKSPLLRSFKVKTYIPKNDEQNWVVVDASGVPLGRLATLIASRIRGKHRPDFTPNMIQGDFVVVINAAQVALTGKKLDDKVYTRYTGYQGGLKTETAREALSKHPERVIEHAVFGMLPKGRQGRAMHTRLKVYAGETHPHSAQKPQVLKTQPLEVK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L14
分子量 formula_weight	14256.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MIMPQSRLDVADNSGAREIMCIRVLNSGIGGKGLTTGGGGNKRYAHVGDIIVASVKDAAPRGAVKAGDVVKAVVVRTSHAIKRADGSTIRFDRNAAVIINNQGEPRGTRVFGPVARELRDRRFMKIVSLAPEVL

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L15
分子量 formula_weight	16894.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MKLHDLKPTPGSRKDRKRVGRGPGGTDKTAGRGHKGQKSRSGAGKGAFFEGGRSRLIARLPKRGFNNVGTTYEVVKLSQLQDLEDTTFDRDTLEAYRLVRRKNRPVKLLASGEISRAVTVHVDAASAAAIKAVEAAGGRVVLPEVQTQQDDAQKAE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L16
分子量 formula_weight	16257.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MMLLPKRTKFRKQFRGRMTGDAKGGDYVAFGDYGLIAMEPAWIKSNQIEACRIVMSRHFRRGGKIYIRIFPDKPVTKKPAETRMGKGKGAVEYWVSVVKPGRVMFEVAGVTEEQAKEAFRLAGHKLPIQTKMVKREVYDEAQ

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L17
分子量 formula_weight	12926.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MRHGKAGRKLNRNSSARVALARAQATALLREGRIQTTLTKAKELRPFVEQLITTAKGGDLHSRRLVAQDIHDKDVVRKVMDEVAPKYAERPGGYTRILRVGTRRGDGVTMALIELV

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L18
分子量 formula_weight	12163.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MATATTIRRKLRTRRKVRTTTAASGRLRLSVYRSSKHIYAQIIDDSRGQTLAAASSAALKSGNKTDTAAAVGKALAAAAAEKGIKQVVFDRGSYKYHGRVKALADAAREGGLDF

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L19
分子量 formula_weight	18347.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MQTHIKINRGELLRGIEQDHTRQLPDFRPGDTVRVDTKVREGNRTRSQAFEGVVIAINGSGSRKSFTVRKISFGEGVERVFPFASPLVNQVTIVERGKVRRAKLYYLRELRGKAARIKSDRSRVMKDAARAQQDKANASASQAAAAQADVTVISAAPEVAPETQGE

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L20
分子量 formula_weight	13991.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MPRAKTGIVRRRRHKKVLKRAKGFWGSRSKQYRNAFQTLLNAATYEYRDRRNKKRDFRRLWIQRINAGARLHGMNYSTFINGLKRANIDLNRKVLADIAAREPEAFKALVDASRNARQ

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L21
分子量 formula_weight	11165.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MFAIIQTGGKQYRVSEGDVIRVESLQGEAGDKVELKALFVGGEQTVFGEDAGKYTVQAEVVEHGRGKKIYIRKYKSGVQYRRRTGHRQNFTAIKILGIQG

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L22
分子量 formula_weight	15190.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MTAPEQTFRNKKQRKQQVKLRKPGFAVAKYVRMSPRKVRLVVDVIRGKSVQDAEDLLRFIPRSASEPVAKVLNSAKANALHNDEMLEDRLFVKEAYVDAGPTLKRLIPRARGSANIIKKRTSHITIIVAEKGNK

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L23
分子量 formula_weight	10539.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSHYDILQAPVISEKAYSAMERGVYSFWVSPKATKTEIKDAIQQAFGVRVIGISTMNVPGKRKRVGRFIGQRNDRKKAIVRLAEGQSIEALAGQA

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L24
分子量 formula_weight	12384.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MPRPSAGSHHNDKLHFKKGDTVIVLSGKHKGQTGKVLLALPRDQKVVVEGVNVITKNVKPSMTNPQGGQEQRELALHASKVALVDPETGKATRVRKQIVDGKKVRVAVASGKTID

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L25
分子量 formula_weight	25415.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MELTAKPRTPKQKLDESMIAAVAYNKENNVSFALDRKAFDRAFRQQSTTGLFDITVEGGETFPALVKAVQMDKRKRAPIHVDFYMVTYGEPVEVSVPVHTTGRSQGEVQGGLVDIVVHNLQIVAPGPRRIPQELVVDVTKMNIGDHITAGDIKLPEGCTLAADPELTVVSVLPPRLTAEELEAEVQAAQVAGLVAAGELSEEAAEAVLEGDASLEEVKAEASEDNAGTDSEDNSDAQ

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L27
分子量 formula_weight	9609.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MAHKKGVGSSKNGRDSNPKYLGVKKFGGEVVKAGNILVRQRGTKFKAGQGVGMGRDHTLFALSDGKVVFINKGKGARFISIEAAQTEVAAD

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L28
分子量 formula_weight	8982.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSRECYLTGKKNLVVNSVIRRGKARADGGVGRKTTGITKRVQRANLHKKAIRENGQVKTVWLSANALRTLSKGPYKGIELI

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L29
分子量 formula_weight	7775.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MKPSEMRNLQATDFAKEIDARKKELMELRFQAAAGQLAQPHRVRQLRREVAQLNTVKAELARKGEQQ

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L30
分子量 formula_weight	6079.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MKIKLVRSVIGRPGNQVKTVQALGLRKIGDSREVSDTPAVRGMVKTVKHLLEVQE

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L32
分子量 formula_weight	6810.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MAKHPVPKKKTSKSKRDMRRSHHALTAPNLTECPQCHGKKLSHHICPNCGYYDGRQVLAV

实体 27 Entity 27 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L33
分子量 formula_weight	6374.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MAKDGPRIIVKMESSAGTGFYYTTTKNRRNTQAKLELKKYDPVAKKHVVFREKKV

实体 28 Entity 28 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L34
分子量 formula_weight	5626.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MKRTYQPNNRKRAKTHGFRARMKTKSGRNILARRRAKGRHQLTVSDE

实体 29 Entity 29 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L35
分子量 formula_weight	7448.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MPKMKTHKMAKRRIKITGTGKVMAFKSGKRHQNTGKSGDEIRGKGKGFVLAKAEWARMKLMLPRGK

实体 30 Entity 30 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L36
分子量 formula_weight	4322.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MKVRSSVKKMCDNCKVVRRHGRVLVICSNVKHKQRQG

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	35

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide
分子量 formula_weight	337.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 43 domains

SCOP 2.08 (27 domains)

结构域编号 domain_id	d3dll11
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.41.8 — Zn-binding ribosomal proteins
家族 Family family	g.41.8.6 — Ribosomal protein L33p

结构域编号 domain_id	d3dll21
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.118 — Ribosomal protein L34p
超家族 Superfamily superfamily	j.118.1 — Ribosomal protein L34p
家族 Family family	j.118.1.1 — Ribosomal protein L34p

结构域编号 domain_id	d3dll31
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.301 — L35p-like
超家族 Superfamily superfamily	d.301.1 — L35p-like
家族 Family family	d.301.1.1 — Ribosomal protein L35p

结构域编号 domain_id	d3dll41
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.42 — Ribosomal protein L36
超家族 Superfamily superfamily	g.42.1 — Ribosomal protein L36
家族 Family family	g.42.1.1 — Ribosomal protein L36

结构域编号 domain_id	d3dllb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.3 — Translation proteins
家族 Family family	b.43.3.2 — Ribosomal protein L3

结构域编号 domain_id	d3dllc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.22 — Ribosomal protein L4
超家族 Superfamily superfamily	c.22.1 — Ribosomal protein L4
家族 Family family	c.22.1.1 — Ribosomal protein L4

结构域编号 domain_id	d3dlld1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.77 — RL5-like
超家族 Superfamily superfamily	d.77.1 — RL5-like
家族 Family family	d.77.1.1 — Ribosomal protein L5

结构域编号 domain_id	d3dlle1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.141 — Ribosomal protein L6
超家族 Superfamily superfamily	d.141.1 — Ribosomal protein L6
家族 Family family	d.141.1.1 — Ribosomal protein L6

结构域编号 domain_id	d3dlle2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.141 — Ribosomal protein L6
超家族 Superfamily superfamily	d.141.1 — Ribosomal protein L6
家族 Family family	d.141.1.1 — Ribosomal protein L6

结构域编号 domain_id	d3dllg1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.21 — Ribosomal protein L13
超家族 Superfamily superfamily	c.21.1 — Ribosomal protein L13
家族 Family family	c.21.1.1 — Ribosomal protein L13

结构域编号 domain_id	d3dllh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.39 — Ribosomal protein L14
超家族 Superfamily superfamily	b.39.1 — Ribosomal protein L14
家族 Family family	b.39.1.1 — Ribosomal protein L14

结构域编号 domain_id	d3dlli1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.12 — Ribosomal proteins L15p and L18e
超家族 Superfamily superfamily	c.12.1 — Ribosomal proteins L15p and L18e
家族 Family family	c.12.1.1 — Ribosomal proteins L15p and L18e

结构域编号 domain_id	d3dllj1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamily	d.41.4 — Ribosomal protein L16p/L10e
家族 Family family	d.41.4.2 — Ribosomal protein L16p

结构域编号 domain_id	d3dllk1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.188 — Prokaryotic ribosomal protein L17
超家族 Superfamily superfamily	d.188.1 — Prokaryotic ribosomal protein L17
家族 Family family	d.188.1.1 — Prokaryotic ribosomal protein L17

结构域编号 domain_id	d3dlll1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.4 — Translational machinery components
家族 Family family	c.55.4.1 — Ribosomal protein L18 and S11

结构域编号 domain_id	d3dllm1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.6 — Ribosomal protein L19

结构域编号 domain_id	d3dlln1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.144 — PABP domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.144.2 — Ribosomal protein L20
家族 Family family	a.144.2.1 — Ribosomal protein L20

结构域编号 domain_id	d3dllo1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.155 — L21p-like
超家族 Superfamily superfamily	b.155.1 — L21p-like
家族 Family family	b.155.1.1 — Ribosomal protein L21p

结构域编号 domain_id	d3dllp1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.55 — Ribosomal protein L22
超家族 Superfamily superfamily	d.55.1 — Ribosomal protein L22
家族 Family family	d.55.1.1 — Ribosomal protein L22

结构域编号 domain_id	d3dllq1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.12 — Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e
超家族 Superfamily superfamily	d.12.1 — Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e
家族 Family family	d.12.1.1 — L23p

结构域编号 domain_id	d3dllr1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family family	b.34.5.1 — Ribosomal proteins L24p and L21e

结构域编号 domain_id	d3dlls1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.53 — Ribosomal protein L25-like
超家族 Superfamily superfamily	b.53.1 — Ribosomal protein L25-like
家族 Family family	b.53.1.1 — Ribosomal protein L25-like

结构域编号 domain_id	d3dllt1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.4 — Ribosomal L27 protein-like
家族 Family family	b.84.4.1 — Ribosomal L27 protein

结构域编号 domain_id	d3dllu1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.325 — L28p-like
超家族 Superfamily superfamily	d.325.1 — L28p-like
家族 Family family	d.325.1.1 — Ribosomal protein L28

结构域编号 domain_id	d3dllv1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamily	a.2.2 — Ribosomal protein L29 (L29p)
家族 Family family	a.2.2.1 — Ribosomal protein L29 (L29p)

结构域编号 domain_id	d3dllw1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.59 — Ribosomal protein L30p/L7e
超家族 Superfamily superfamily	d.59.1 — Ribosomal protein L30p/L7e
家族 Family family	d.59.1.1 — Ribosomal protein L30p/L7e

结构域编号 domain_id	d3dlly1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.41.8 — Zn-binding ribosomal proteins
家族 Family family	g.41.8.5 — Ribosomal protein L32p

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	3dllA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3dllA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3dllD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1440 — 50s Ribosomal Protein L5; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L5

结构域编号 domain_id	3dllE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	930 — Outer Surface Protein A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — Ribosomal protein L6

结构域编号 domain_id	3dllE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	930 — Outer Surface Protein A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — Ribosomal protein L6

结构域编号 domain_id	3dllF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	250 — Ribosomal protein L11/L12, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	3dllG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1180 — Ribosomal Protein L13p; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L13

结构域编号 domain_id	3dllH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	150 — Ribosomal Protein L14
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L14/L23

结构域编号 domain_id	3dllJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L16/L10

结构域编号 domain_id	3dllK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1030 — 50s Ribosomal Protein L17; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L17

结构域编号 domain_id	3dllL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	3dllP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L22/L17

结构域编号 domain_id	3dllQ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

结构域编号 domain_id	3dllS01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	240 — Ribosomal Protein L25; Chain P
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal Protein L25; Chain P

结构域编号 domain_id	3dllS02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L25, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	3dllW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1390 — Ribosomal Protein L30; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L30/L7

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	169.700 Å
晶胞边长 b length_b	410.000 Å
晶胞边长 c length_c	695.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.500 Å
最低分辨率 resolution_low	29.980 Å
R 因子 r_factor	0.2590
R_work r_work	0.2590
R_free r_free	0.2800

fit	/app/data/saxs_computation/dl/3dll/3dll.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dl/3dll/3dll.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dl/3dll/3dll.dat