3e1k

Crystal structure of Kluyveromyces lactis Gal80p in complex with the acidic activation domain of Gal4p

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 226.4 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80

Kluyveromyces lactis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–457 链 C； UniProt 1–457	未记录	Lactose regulatory protein LAC9 × 2 （P08657）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–457 链 G； UniProt 1–457	未记录	Lactose regulatory protein LAC9 × 2 （P08657）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–457 链 K； UniProt 1–457	未记录	Lactose regulatory protein LAC9 × 2 （P08657）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–457 链 O； UniProt 1–457	未记录	Lactose regulatory protein LAC9 × 2 （P08657）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3E1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NVW Crystal sctucture of transcriptional regulator Gal80p from kluyveromymes lactis 提交 2006-11-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–457（456 aa）链 B 2–457（456 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；20% 2,4-MPD, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
2NVW Crystal sctucture of transcriptional regulator Gal80p from kluyveromymes lactis 提交 2006-11-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–457（456 aa）链 B 2–457（456 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；20% 2,4-MPD, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
2NVW Crystal sctucture of transcriptional regulator Gal80p from kluyveromymes lactis 提交 2006-11-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–457（456 aa）链 B 2–457（456 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；20% 2,4-MPD, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.245

共 1 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAL80_KLULA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 C； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 E； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 G； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 I； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 K； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 M； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457 作者链 O； PDB构建体 1–457； UniProt 1–457

Lactose regulatory protein LAC9

物种未注明

UniProt P08657

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 844–865 链 D； UniProt 844–865	片段：UNP residues 844-865	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 × 2 （Q06433）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 844–865 链 H； UniProt 844–865	片段：UNP residues 844-865	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 × 2 （Q06433）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 844–865 链 L； UniProt 844–865	片段：UNP residues 844-865	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 × 2 （Q06433）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 844–865 链 P； UniProt 844–865	片段：UNP residues 844-865	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80 × 2 （Q06433）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20-25% (w/v) pentaerythritol propoxylate 5/4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3E1K	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CLD DNA-binding protein 提交 1995-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 85–144（60 aa）	突变：INITIATOR MET	CD CADMIUM ION × 2	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LAC9_KLULA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 D； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 F； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 H； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 J； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 L； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 N； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865 作者链 P； PDB构建体 1–22； UniProt 844–865

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3e1k
沉积日期 deposition_date	2008-08-04
结构标题 title	Crystal structure of Kluyveromyces lactis Gal80p in complex with the acidic activation domain of Gal4p
关键词 keywords	;transctiption, repressor, trans-activation, Carbohydrate metabolism, DNA-binding, Galactose metabolism, Transcription, Transcription regulation, Activator, Metal-binding, Nucleus, Zinc ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	65.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	66.42 Å
零角强度 I(0) i0	1793850000.00
分子量 molecular_weight	369100.0 kDa
排除体积 excluded_volume	466920 Å³
包络体积 envelope_volume	644430 Å³
水化壳体积 shell_volume	86545 Å³
包络直径 envelope_diameter	248.8 Å
壳层 Rg shell_rg	58.44 Å
包络 Rg envelope_rg	66.08 Å
形状 Rg shape_rg	66.42 Å
总 Rg total_rg	66.24 Å
总原子数 total_atoms	26057
残基数 n_residues	3258
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	226.4 Å
Rg (实空间) rg_real	66.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.40 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7940e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.9650e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	65.14 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1790000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6051
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	84.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.438
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.175
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0007
最高正则化参数 α highest_alpha	54330000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.800; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.013; Positv: 1.000; Valcen: 0.921; Smooth: 0.503

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80
分子量 formula_weight	52174.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O
原子数 atom_count	26057

MNNNKRSKLSTVPSSRPIRVGFVGLTSGKSWVAKTHFLAIQQLSSQFQIVALYNPTLKSSLQTIEQLQLKHATGFDSLESFAQYKDIDMIVVSVKVPEHYEVVKNILEHSSQNLNLRYLYVEWALAASVQQAEELYSISQQRANLQTIICLQGRKSPYIVRAKELISEGCIGDINSIEISGNGGWYGYERPMRSPEYLYDIESGVNLISNSFGHTIDVLQYITGSYFQKINAMISNNIPTQFLLDENGKRTKETISKTCPDHLLFQGILENGKVPVSCSFKGGTPVKKLTKNLVIDIHGTKGDLKIEGDAGFVEISNLVLYFYGIKNGNGSSNGTDNNGAAAIKDKEKVTKSPSPSTGTSEEEQTMEVFHLRNYNSVVGNILRIYESIADYHFLGKPESKSSRGPDDLFASTKFDKQGFRFEGFPTFKDAIILHRLIDAVFRSDKEEKTLDVSKIMILEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Kluyveromyces lactis
通用名 common_name	yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28985
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Lactose regulatory protein LAC9
分子量 formula_weight	2687.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

TQQLFNTTTMDDVYNYIFDNDE

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 33 domains

SCOP 2.08 (17 domains)

结构域编号 domain_id	d3e1ka1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1ka2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1ka3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3e1kc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1kc2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1ke1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1ke2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1kg1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1kg2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1ki1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1ki2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1kk1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1kk2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1km1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1km2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

结构域编号 domain_id	d3e1ko1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.3 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3e1ko2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.1 — Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain
家族 Family family	d.81.1.5 — Glucose 6-phosphate dehydrogenase-like

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	3e1kA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kI02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kK02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kM01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kM02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

结构域编号 domain_id	3e1kO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	3e1kO02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	101.100 Å
晶胞边长 b length_b	160.500 Å
晶胞边长 c length_c	132.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.70 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2310
R_work r_work	0.2280
R_free r_free	0.2890

fit	/app/data/saxs_computation/e1/3e1k/3e1k.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e1/3e1k/3e1k.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e1/3e1k/3e1k.dat

Crystal structure of Kluyveromyces lactis Gal80p in complex with the acidic activation domain of Gal4p

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Galactose/lactose metabolism regulatory protein GAL80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Lactose regulatory protein LAC9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 33 domains

SCOP 2.08 (17 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)