SAXSdb — 3euk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromosome partition protein mukB, Linker

Haemophilus ducreyi (strain 35000HP / ATCC 700724)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Chromosome partition protein mukF × 1 （Q7VL94） PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Chromosome partition protein mukF × 1 （Q7VL94） Chromosome partition protein mukE × 2 （Q7VL95） PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MUKB_HAEDU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–242； UniProt 33–271 作者链 A； PDB构建体 250–483； UniProt 1263–1496 作者链 C； PDB构建体 4–242； UniProt 33–271 作者链 C； PDB构建体 250–483； UniProt 1263–1496 作者链 F； PDB构建体 4–242； UniProt 33–271 作者链 F； PDB构建体 250–483； UniProt 1263–1496 作者链 H； PDB构建体 4–242； UniProt 33–271 作者链 H； PDB构建体 250–483； UniProt 1263–1496

Chromosome partition protein mukF

Haemophilus ducreyi

UniProt Q7VL94

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Chromosome partition protein mukB, Linker × 2 （Q7VL96） PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Chromosome partition protein mukB, Linker × 2 （Q7VL96） Chromosome partition protein mukE × 2 （Q7VL95） PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MUKF_HAEDU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–152； UniProt 292–443 作者链 J； PDB构建体 1–152； UniProt 292–443

Chromosome partition protein mukE

Haemophilus ducreyi

UniProt Q7VL95

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Chromosome partition protein mukB, Linker × 2 （Q7VL96） Chromosome partition protein mukF × 1 （Q7VL94） PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MUKE_HAEDU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–238； UniProt 1–238 作者链 M； PDB构建体 1–238； UniProt 1–238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3euk
沉积日期 deposition_date	2008-10-10
结构标题 title	Crystal structure of MukE-MukF(residues 292-443)-MukB(head domain)-ATPgammaS complex, asymmetric dimer
关键词 keywords	;MukB, MukE, MukF, Chromosome condensation, condensin, SMC, non-SMC subunit, ABC-type ATPase, WHD, ATP-binding, Cell cycle, Cell division, Chromosome partition, DNA condensation, DNA-binding, Nucleotide-binding ;; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3euk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3euk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3euk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.31 Å
Rg（电子密度）	32.39 Å
总 Rg	32.90 Å
原子数	7963
残基数	998
排除体积	141890 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3euk__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3euk__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chromosome partition protein mukB, Linker
分子量 formula_weight	54102.8 kDa
突变 mutation	E1435Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,F,H
原子数 atom_count	18401

GHMIARGKFRSLTLINWNGFFARTFDFDELVTTLSGGNGAGKSTTMAGFVTALIPDLTLLNFRNTTEAGSTSSSRDKGLYGKLKAGVCYAVLETVNSRAQRIITGVRLQQIAGRDKKVDIRPFSLQNVPMTDSVISLFTEQVANKARVLSLNDLKEKFEETAVTFKPYHSITDYHSFMFDLGILPKRLRSSSDRNKFYKLIEASLYGGISSVITKSLRDYLLPENSGVRQAFQDMEAALRENSGGSGGSISAESVANILRKTIQREQNRILQLNQGLQNIAFGQVKGVRLVVNIRDTHSILLNALSDQHEQHKDLFESQKLSFSEALAMLYKRINPHIELGQRMPQTIGEELLDYRNYLDLEVETLRGAYGWMRAESSALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRMRAKDILPCRLLFLDQAARLDAMSINTLFELCERLDMQLLIAAPENISPERGTTYKLVRKILANQEYVHVVGLKGFG

来源 Source

来源生物 organism	Haemophilus ducreyi (strain 35000HP / ATCC 700724)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	233412
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chromosome partition protein mukF
分子量 formula_weight	17334.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J

MDKNRVFGQRLRQSIQNYFSSPWLLYTAKAEALLDLRDDEAMLNEMEAVGELPMALEYESLTDVQTQIVTAIQAELAHFRNTAQPINLGAVLQEQLARYPQSRHFDVARIIVDQAVKLGMASQDHQAVYPVWQPIDDFSAAVQAHLIDQYDK

来源 Source

来源生物 organism	Haemophilus ducreyi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	730
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Chromosome partition protein mukE
分子量 formula_weight	26815.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

MTEYIQDAIPAKLAIAIANPIFPQLDSQLRAGRHISIEMLDEHAFLMDFQTELESFYRRYHVDLIRAPEGFFYLRPKASTLIARSAMSEMEMLVGKVLCYLYLSPERLAQQGIFSQDDVYEELLNLADENKLLKAVNPRSTGSDLDRAKLAEKVGGALRRLARIGIITRVGEQNSKKFIISEAVFRFGADVRAGDDPREVQLRLIRDGEATTPTLLTTAAIEFAEDGARDELEESEAE

来源 Source

来源生物 organism	Haemophilus ducreyi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	730
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

CATH v4.4 (7 domains)

结构域编号 domain_id	3eukA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — N-terminal domain of mukB
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3eukC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — N-terminal domain of mukB
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3eukE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	225 — NK-Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — MukF, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	3eukF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — N-terminal domain of mukB
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3eukH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — N-terminal domain of mukB
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3eukJ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	225 — NK-Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — MukF, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	3eukL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2250 —

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晶胞边长 a length_a	172.414 Å
晶胞边长 b length_b	172.414 Å
晶胞边长 c length_c	491.587 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.000 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2710
R_free r_free	0.3240

Crystal structure of MukE-MukF(residues 292-443)-MukB(head domain)-ATPgammaS complex, asymmetric dimer

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromosome partition protein mukB, Linker

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromosome partition protein mukF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromosome partition protein mukE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3euk__assembly_1__model_1

3euk__assembly_1__model_1 | I(q)

3euk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of MukE-MukF(residues 292-443)-MukB(head domain)-ATPgammaS complex, asymmetric dimer

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromosome partition protein mukB, Linker

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chromosome partition protein mukF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chromosome partition protein mukE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3euk__assembly_1__model_1

3euk__assembly_1__model_1 | I(q)

3euk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)