SAXSdb — 3f5c

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1 × 2 （Q61066）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NR5A2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–248； UniProt 313–560

Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1

Mus musculus

UniProt Q61066

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 × 1 （P45448）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NR0B1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–268； UniProt 205–472 作者链 C； PDB构建体 1–268； UniProt 205–472

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3f5c
沉积日期 deposition_date	2008-11-03
结构标题 title	Structure of Dax-1:LRH-1 complex
关键词 keywords	;nuclear receptor, transcriptional corepressor, regulatory complex, DNA-binding, Lipid-binding, Metal-binding, Nucleus, Receptor, Transcription, Transcription regulation, Zinc, Zinc-finger, Cytoplasm, Repressor ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3f5c__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3f5c__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3f5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.13 Å
Rg（电子密度）	30.59 Å
总 Rg	31.21 Å
原子数	4936
残基数	607
排除体积	89396 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3f5c__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2
分子量 formula_weight	28732.0 kDa
突变 mutation	I525L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4936

QTNSPASIPHLILELLKCEPDEPQVQAKIMAYLQQEQSNRNRQEKLSAFGLLCKMADQTLFSIVEWARSSIFFRELKVDDQMKLLQNCWSELLILDHIYRQVAHGKEGTIFLVTGEHVDYSTIISHTEVAFNNLLSLAQELVVRLRSLQFDQREFVCLKFLVLFSSDVKNLENLQLVEGVQEQVNAALLDYTVCNYPQQTEKFGQLLLRLPELRAISKQAEDYLYYKHVNGDVPYNNLLIEMLHAKRA

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1
分子量 formula_weight	30375.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

GEEQPQQISVASGTPVSADQTPATPQEQPRAPWWDASPGVQRLITLKDPQVVCEAASAGLLKTLRFVKYLPCFQILPLDQQLVLVRSCWAPLLMLELAQDHLHFEMMEIPETNTTQEMLTTRRQETEGPEPAEPQATEQPQMVSAEAGHLLPAAAVQAIKSFFFKCWSLNIDTKEYAYLKGTVLFNPDLPGLQCVKYIEGLQWRTQQILTEHIRMMQREYQIRSAELNSALFLLRFINSDVVTELFFRPIIGAVSMDDMMLEMLCAKL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3f5ca_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family family	a.123.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	3f5cA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Retinoid X Receptor

结构域编号 domain_id	3f5cB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Retinoid X Receptor

结构域编号 domain_id	3f5cC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Retinoid X Receptor

▶

晶胞边长 a length_a	103.355 Å
晶胞边长 b length_b	103.355 Å
晶胞边长 c length_c	117.455 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43
空间群编号 int_tables_number	78
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	24.785 Å
R 因子 r_factor	0.2236
R_work r_work	0.2220
R_free r_free	0.2792

Structure of Dax-1:LRH-1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3f5c__assembly_1__model_1

3f5c__assembly_1__model_1 | I(q)

3f5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of Dax-1:LRH-1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3f5c__assembly_1__model_1

3f5c__assembly_1__model_1 | I(q)

3f5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)